Mnova 사용법 (in text) # 설치방법 1. Mnova 를설치한다. A. Mnova 홈페이지에서다운로드받는다. i. ii. KAIST는 버전을받는다. ( 해당버전이상

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1 Mnova 사용법 (in text) # 설치방법 1. Mnova 를설치한다. A. Mnova 홈페이지에서다운로드받는다. i. KAIST는 버전을받는다. ( 해당버전이상에대한 license 미보유 ) B. 캠퍼스라이센스파일을데이터서버에서다운로드받는다. i. 데이터서버접속정보 : NMR실 processing 컴퓨터모니터상단에기재 위치 : /opt/mnova_license/version_14_0_1/ KAIST_Campus_License_2018.zip C. Mnova 를설치후에, 라이선스압축파일을끌어다붙인후, 프로그램을재시작한다.

2 # 단축키 - FID 열기 : Ctrl + O - 기본상태 : ESC - Apodization : W - Baseline correction : B - Phase Correction : Shift + P - Referencing : L or R - Zoom in : Z ( 가로 / 세로 /2D) - Full spectrum : F - Peak picking : K or Ctrl + K - Integration : I - Multiplet analysis : J - 서브창추가 : E - 화면줄임 / 복원 : X, V - Cursor 정보 : C - 새로운 page 추가 : Ctrl + M

3 # 사용방법 1. 파일열기 ( 단축키 : Ctrl + O) A. Bruker의 1D 스펙트럼, Agilent( 구 varian) 의경우폴더내 fid 파일을연다. B. Bruker의 2D 스펙트럼일경우폴더내 ser 파일을연다. C. 탐색기에서데이터가있는폴더째끌어다붙여도됨 2. 환경설정 A. 스펙트럼에서오른쪽마우스를클릭하여 Properties 를클릭한다. B. 원하는화면표시설정을설정한후 OK 선택한다.

4 3. Processing A. Mnova는 load시바로 FT(Fourier Transfom) 을하여스펙트럼을보여준다. B. Apodization ( 단축키 : W) // 1D, 2D 모두적용 i. 스펙트럼의 S/N를강화하거나 Resolution을강화시킨다. 1. Raw data에만족할경우, 적용하지않아도됨 2. Trade off : Sensitivity를강화할경우, Resolution이나빠진다. ( 반대도동일 ) 3. 2D의경우 F2와 F1을모두적용하여야한다. 추천하는 function 1. (1D) Exponential : S/N 을강화할경우많이사용됨 (1D 에서많이사용 ) A. 일반적으로 ( 계산하지않을경우 ) 아래의수치이하를많이사용 i. 1D proton NMR 일경우에는 0.2Hz 이하권장 1D Carbon 일경우에는 2 Hz 이하권장 B. 최적화할경우에는 Matched filter 1/AQ 를계산하여입력 i. AQ = TD / (2* SW) 2. (1D, 2D) Gaussian + Exponential 함수와같이사용 A. View에서 Full view를켜놓고, 적용되는함수를확인하면서적용 3. (2D) Sine Square : 75 또는 90 degree를권장 A. 값이 90에가까울수록 S/N이좋아지고, 0에가까울수록 resolution이좋 아진다. B. 2D에서는실험종류에따라적용하는 degree가다름 i. Magnitude : 0 degree ( 예 > COSY, HMBC) Phase-sensitive : 90 degree ( 예 > NOESY, HSQC) C. C. Zero filling (2D만적용 ) i. Digital resolution을강화하는작업 1. FID의말단에 0을추가하여 peak shape을좀더자연스럽게한다.

5 A. 장점 : peak의형태가더자연스러워진다. B. 단점 : 데이터의용량이증가한다. 권장 : Original size 보다한단계위 ( 보통 2배사이즈 ) D. Linear prediction(2d만적용. NUS 적용시에는필수 ) i. Truncate된 FID 말단을기존패턴으로부터예측하여생성하는작업 1. Non-uniform sampling 적용시에는반드시적용해야함 2. 장점 : resolution이증가한다. 3. 단점 : 데이터의용량이증가한다. 권장 : Original size보다한단계위 ( 보통 2배사이즈 ) 1. To Spectrum size 를선택한후 LP filling 을적용하면됨 E. Phase correction (1D, 2D 공통 ) i. 스펙트럼의 phase를조정하는작업 Mnova는각 NMR컴퓨터에서보정한값을그대로가져온다. ( 기본설정일경우 ) i 자동으로보정된 phase가만족스럽지않을경우에는다음과같이한다. 1. 자동으로할경우에는 Auto Phase Correction 을클릭한다. 2. 수동으로할경우에는아래와같이한다. A. Manual Phase( Shift +P) 를선택한다. B. 기준으로삼을 peak를고른다. (Pivot point에서 position을움직여결정 ) i. 보통가장큰 peak를선택하거나, 가장자리에있는 peak를선택 C. PH0을조절하여기준 peak를대칭이되게조절 D. PH1을조절하여기준과멀리떨어져있는 peak의 phase를조절. E. 만족스럽지않을경우, 기준 peak를변경하여다시시도하여반복 F. Baseline correction( 단축키 : B) (1D, 2D 모두적용 ) i. Baseline을보정하는작업 ( 정확한 integral 계산 ) Polynomial Fit을선택한후적당한 order을입력한후 OK 버튼을클릭한다. 1. 다항식 (ax+bx^2+cx^3+ ) 을이용하여보정하는방식으로 interactive하게

6 보여지는파란색 baseline을보면서결정한다. A. 스펙트럼가장자리의절벽은신경쓰지않아도된다. B. Order를변경하면서맞춘다. ( 보통 0~3) i. qnmr일경우에는 0으로설정 C. order만으로맞추지못할경우 Filter를조절하여맞춘다. D. (2D) F2, F1에같은설정을적용하고싶을경우 Apply to All dimensions 를체크하고적용한다. i Whitaker smoother 가더효율적으로 baseline 을다듬지만 broad 한 peak 를없앨 수있으므로, exchangeable proton(-oh, -NH) 이있을경우에는사용을피한다. 1. Filter 를잘조절할경우, 더정확한 baseline 을맞출수도있다 F, 29Si, 11B 등 Background signal 이있는실험의스펙트럼의 baseline 에효 과적임

7 4. Analysis A. Referencing ( 단축키 : L 혹은 R) i. 기준점을새로설정하는작업 1. TMS를넣은경우에는 TMS의 peak를 0으로설정 2. Solvent를기준으로할경우에는온도에따른 peak위치를확인하고설정 B. Peak picking ( 단축키 : K 혹은 Shift + K ) i. Peak로선택하는작업 Automatic : Noise 가많지않거나간단하게작업할때 1. Mnova 는 noise 값을자동으로계산한다. 2. Options : standard 에서 noise factor 는 noise 의 X 배이상의 signal 만 peak 로 picking 하는 threshold 임 i iv. Manual Threshold : 특정위치만 peak picking 할때영역을 drag 하여설정 Peak by peak : peak 를커서로선택하여지정할때 v. Table을이용하여 peak정보를쉽게스프레드시트로복사할수있다. C. Integration ( 단축키 : I) i. Peak의적분값을구하는작업 적분을원하는영역을 drag한다. 1. 첫번째 integration하는영역은 1로자동 normailze된다. 2. 적분값이적힌곳위에서오른쪽마우스를클릭하여, Edit Integral 을선택하 여적분값을바꿀수있음 3. Table을이용하여 integral 표를볼수있다. D. Multiplet analysis ( 단축키 : J) i. J coupling을측정하는작업 측정을원하는영역을 drag한다. 1. 오른쪽마우스를클릭하여, Edit multiplet 을선택하여값을바꿀수있음 2. Table 을이용하여 j-couping 표를볼수있다. 논문형식변경가능

8 5. 화면조작 A. Intensity : 마우스휠로 intensity 조절 i. Fit to height : 단축키 H B. Zoom : ( 단축키 : 화면확대 z, 화면축소 : shift +z ) i. Z를 1번누르면 drag한가로로화면확대 i iv. Z 를 2 번누르면 drag 한세로로화면확대 Z 를 3 번누르면 drag 한박스로화면확대 ESC 를누르면 zoom mode 해제됨 v. 화면축소도위와동일 C. 전체화면 : 단축키 f 6. 화면추가 A. Full spectrum view i. 전체스펙트럼을별도로보여주는기능 메뉴 : View Full view 체크후생기는박스를스펙트럼위에 drag 하여붙임 B. 부분확대화면추가 ( 단축키 : E) i. 강조해야할 peak를추가화면으로보여주는기능 C. 스펙트럼축소 i. 중간부분을생략해서보여줘야할때사용하는기능 i 화면줄이기 : 단축키 X 누른후사라지게할부분을 drag 화면복원 : 단축키 V 누른후에사라졌던부분을 drag

9 7. Stack Plot A. 겹칠 spectrum들을 processing하고 reference를맞춘후에 stack한다. B. 새로운 page를만든후, ( 단축키 : Ctrl + M) Pages 패널에새로생긴페이지를확인한다. i. Pages 패널이보이지않을경우에는메뉴 View Pages 체크 C. Stack하기원하는페이지들을선택한다. i. Shift + 클릭, Ctrl + 클릭, Ctrl+A 페이지순서대로아래부터 stack되니겹치기전에배열할순서를확인한다. D. 메뉴 Stack Stack Spectra를클릭 E. 메뉴 View Table Stacked Spectra를선택하면 stacked spectrum의 table을볼수 있다. i. Multiply / Divide : 각각의 spectrum의 intensity 조절 i Show : 보여줄스펙트럼선택 Select: 기능을적용할스펙트럼을선택 iv. Invert : 역순으로정렬한다.

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