PART III. 반응검색 (REACTIONS). 반응검색화면. 반응검색 구조식그리기및편집. 반응검색 검색옵션설정방법 4. 반응검색결과화면 5. 반응검색결과화면
. 반응검색 조건설정 : 검색옵션을설정후 Search 버튼을클릭합니다 반응검색은생성물이나원료지정뿐만아니라, 전체반응, 반반응도검색가능합니다 검색모드를선택 Reactions 반응검색 Substances 물질검색 Literature 문헌검색 검색하고자하는구조식을그리거나이름으로구조식을그립니다. 4 검색조건설정 4 Options 옵션설정 ( 상세설명 : P5, 6) As Drawn 그려진구조대로검색 Substructure 부분구조검색 Similarity 유사반응검색 (P.5) 반응에서역할선택 : Product: 생성물 Starting Material: 출발물질 Reagent/Catalyst: 시약 / 촉매 Any role: 생성물또는출발물질 5 기타조건을설정 Reaction data 추가설정검색 ( 수득율, 용매등 ) 기타조건추가삭제 Add/Remove 에서항목추가삭제 6
. 반응검색 - 구조식그리기및편집 구조식그리기 (structure editor) 에서검색대상물질과반응을구조식으로그려서검색할수있습니다. 그리고구조식그림을그리지않고, 화학이름을넣어바로그림으로구조를확인하거나편집, 변형하여검색이가능합니다. 구조식을그리기위해더블클릭하면소프트웨어가시작됩니다. 검색예 : Esomeprazole 과연관체의합성법찾기. 이름으로구조그리기 Create Structure Template from Name ( 이름으로구조검색 ) 아이콘을클릭합니다.. 이름입력화면입니다. "esomeprazole" 를입력하고 Submit 버튼을클릭합니다. < 참고 > 문구와동일한것을찾고싶을때 : is 앞문구에들어가는것을찾을때 : start with 뒷문구에들어가는것을찾을때 : ends with 부분일치 : contains 여러후보화합물이나타나는경우필요한것을선택합니다.. Submit 을누르면, Marvinsketch 에자동으로구조식이그려집니다. 구조편집하기 4. 만약 esomeprazole 의구조와유사한다른물질을그리고싶을경우 EDIT 를클릭하여편집후 Transfer query 버튼을클릭하면변경된값으로구조식이 Reaxys Marvinsketch 에표시됩니다. 4 4
. 검색옵션설정방법 반응검색과물질검색에서옵션이일부다릅니다. 구조검색옵션 As Drawn : 그린물질의구조검색 Substructure : 부분구조검색 on heteroatoms : 헤테로원자검색 on all atoms : 모든아톰검색 Similarity : 유사한반응검색 기타검색옵션 Include tautomers : 호변이성체를포함 Ignore stereo : 입체무시 No isotopes : 동위원소를포함하지않는것 No charges : 전하를띠는분자를포함하지않는것 No radicals : 라디칼을포함하지않는것 No ring closures : 추가압축고리를불허 Ignore Atom Mapping : Atom 매핑을무시 Align results with query : 얻어진결과의구조를 Query 의구조와같은배치로표시 Keep Fragments separate : 조각의분리를유지 Similarity 검색 Reaxys 는반응과물질의유사성을기반으로검색이가능합니다. 위의검색옵션을설정하여검색을수행합니다. < 유사반응의표시예 : Vioxx 의경우 > Reaction 선택 -> 검색옵션중 Similarity 선택 -> Create structure template from name-> Vioxx 넣고, submit-> Search reaction 클릭시, 아래와같이창이뜹니다. 유사성정도에따라건수가표시됩니다. ( 유사성정도내용은에서확인할수있습니다 ) 건수를클릭하면각각의결과가표시됩니다. 5
. 반응검색옵션 (Reactions Query Constraints) Option Definition Example Include tautomers 호변이성체를포함 Tautomers are placed in separate records, use classic conjugated double bonds, and only cover the movement of real atoms (not charges and valences). Included: Ignore stereo 입체무시 When this box is checked, any stereochemistry displayed in the query will be ignored and the substances retrieved may or may not depict specific stereochemistry. Included: No isotopes 동위원소를포함하지않는것 When this box is checked, isotopes will not appear in your results. Excluded: No charges 전하를띠는분자를포함하지않는것 When this box is checked,charged compounds will be excluded from your results. Excluded: No radicals 라디칼을포함하지않는것 When this box is checked, compounds containing radicals will not appear in your results. Excluded: No ring closures 추가압축고리를불허 When this box is checked, ring closures between atoms or groups with free sites will be excluded from your results. Ignore atom mapping Atom 매핑을무시 Align Results with Query Keep fragments...separat e, together 조각의분리를유지 If atom-atom mappings are defined in a query, this option will ignore those mappings in the search Checking this option ensures that the structures in the results will have the same general orientation as the structure in the query When the query contains more than one isolated component, checking separate ensures that they are to be retrieved as separate components. Together means that the fragments will be part of the same structure. 6
4. 반응검색결과화면 검색결과는표형식으로표시됩니다. 다른논문 특허유래의반응조건이차례로표시되므로 ( 기본적으로 개표시 ) 조건끼리쉽게비교 검토할수있습니다. 검색결과의분석및재검색을위해각종필드를활용한필터기능도준비되어있습니다검색결과에서원문과서지정보등에액세스할수있는링크도부여되어있습니다. 작업이력기록 / Alert 설정 4 Reactions / Substance / Citations 확인가능 7 결과분석 / 통계 5 도구모음 6 결과정렬 반응결과 8 필터기능 : 결과내정렬및재검색 작업한 history 를기록하여전에작업한내용을클릭하여열람할수있습니다. Create Alert : Alert 설정합니다 (Part VII 참조 ) 필터기능 ( Part VII 참조 ) 4Reactions / Substance / Citations 확인가능 5 도구모음 : 확대, 축소, 인쇄, 숨기기기능등 6 검색결과정렬 : 7 Analysis View : 검색결과의통계분석기능 ( Part VII 참조 ) 8 반응결과 : 다른논문 특허유래의반응조건이나란히 개씩표시됩니다. 여기에서는 Show All Remaining Details 를클릭하여다른반응조건을표시합니다. Reaxys Ranking 은 다양한지표에서반응정보의유용성을점수화하여순위를표시한것입니다. 7
반응검색결과화면 6 Yield 수율 Conditions: 반응조건 4 References 출처정보 ( 저널 / 특허 ) 특허기록중실험내용부분을확인 제목 / 초록 전문 인용정보 - 문헌상세정보 5 기타반응조건 Yield 수율 Conditions 반응조건 반응조건, 정제방법등자세한실험방법표시, 특허및학술논문기재내용에서확인할수있습니다 학술논문은일부제목만대상임. Show / Hide Experimental Procedure: 특허기록중실험해당부분을확인할수있습니다. 4 References 출처정보 ( 저널 / 특허 ) Title / Abstract : 제목 / 초록 Full Text : 문헌의전체텍스트 View citing articles : Scopus 에서피인용정보 Show Details 문헌별정보 ( 수록반응화합물등 ) 5 Show All Remaining Details 기타반응조건 6 아이콘 화합물의시판정보사이트안내화합물의하위메뉴뷰어기능화합물을다른데이터베이스 (PubChem 또는 emolecules) 로표시 Reaxys 번호 분자식 분자량 CAS 등록번호 화합물에대한자세한믈성데이터 구조식을클립보드에복사 (mol 형식 ) 구조식을검색화면에복사 부분구조필터로사용 반응식을검색화면에복사 관련 Markush 구조확인 Synthesize 화합물의합성경로만들기 ( 합성경로설계도구, 자세한내용은 p.8 C-9) Find similar reactions 유사한반응검색 8