PubMed 이용교육(기초편)

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득희 환
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1 PubMed 이용교육 동국대학교의학도서관김유진 ( ) medlib@dongguk.ac.kr

2 목차 1. PubMed 소개 2. PubMed 문헌검색법 3. MeSH 검색활용법 4. 검색화면 5. My NCBI 기능소개 6. 그외다양한기능

3 PubMed 란? 미국국립의학도서관 (NLM) 산하 NCBI 에서주관하는 Medline 무료의학문헌색인검색시스템 PubMed = Medline + (In Process* + Publisher + Full text) 469 개정도의원문 Database 와출판사에서약 8,765 여종원문제공 ( ) PubMed does not include the full text of journal articles; however, click the icon in the top right corner of the abstract display to link to the full text, if available. Medline 미국국립의학도서관 (NLM) 이개발한의학, 간호학, 치의학, 수의학등보건과임상을망라한최고의서지색인데이터베이스 (premier bibliographic database) 1944 년도이후출판된 Biomedical 분야의 14,804 종 (Currently 5,641 종 ) 저널에서 2,000 만건이색인된의학문헌색인 DB

4 접속방법 도서관홈페이지로그인 메인페이지배너나 디지털컨텐츠 > 웹 Db

5 상세검색 My NCBI 튜토리얼 다양한검색도구 MeSH 를포함한다양한검색방법 가장많이이용되는저널 10 종업데이트 최근이틀동안이용률높은아티클 PubMed 논문에가장도움이되는코멘트게시한저자와글링크

6 기본검색 특정주제에대한문헌검색 ( 키워드, 저자명, 저널명등 ) 자동키워드변환 : 검색창에입력하는검색어 ( 자연어 ) 가 PubMed 에색인된통제어 (MeSH) 로바뀌는검색어자동변환방식 자연어 OR MeSH( 주제 ) > Journal > Author 순으로맵핑되어변환됨 한국인저자입력시 성, 이름 으로정확한키워드검색가능 선행연구조사등검색시, 키워드 1 개보다키워드 3-4 개권장

7 Citation Sensor 특정논문을검색하고싶을때 1. 서지사항직접입력 2. PMID(PubMed 고유번호 ) 입력

8 PubMed 기본검색 Q. What is the best search strategy? a. aspirin heart attack prevention b. aspirin heart attack prevention c. aspirin AND heart AND attack AND prevention

9 PubMed 기본검색 Q. Wat is the best search strategy? a b c 많은검색결과보다원하는정보가얼마나정확히검색되었는가

10 PubMed 검색 [ 불리언검색 ] 학술 DB 와검색엔진에서사용가능 AND 2 개이상의키워드를모두포함한자료검색 입력하지않아도무방 검색결과줄이고싶은경우유용 논리연산자 OR 2 개이상키워드중 1 개또는 2 개이상포함한자료검색 더많은자료를검색하고싶은경우유용 NOT 뒤의키워드제외한자료검색 부적절한자료는제외하고싶은경우유용 libguides.mchenry.edu

11 해당검색방법사용시자동매핑변화는되지않음 괄호검색 ( ) A AND (B OR C) 검색순서정할때사용 괄호는모든연산자보다우선 Ex) influenza AND (vaccine OR vaccination) 구문검색 Helicobacter pylori 따옴표입력시구검색하여구와일치하는검색어만검색 Ex) Helicobacter pylori : Helicobacter pylori [MeSH Terms] OR ( Helicobacter [All Fields] AND pylori [All fields]) OR Helicobacter pylori [All Fields] Ex) Helicobacter pylori : Helicobacter pylori [All Fields] 절단검색 *? Mimick* Ne?t Truncation : 여러문자대체 Mimick* 입력시, Mimick, Mimicked, Mimicks 등검색 Wild Card : 한문자대체 Ne?t 입력시. Nest, Next, Near 등검색 필드검색 [ ] [sb] 검색어의검색위치를지정하게되므로, 정확하고효율적인검색가능 필드태그는반드시검색어뒤에작성 [ ] 안에필드약어입력 ( 예시 )

12 Field 검색약어 특정 Field 로제한하여검색하고싶을때 검색어와해당 Field 약어연속입력 Ex) Science[ta] AND zika virus[tiab]

13 Science[ta] AND zika virus[tiab] 검색결과 Science 학술지에개제된 zika virus 의논문명과초록만검색됨 Search Information 에서검색어가자동변환됨

14 PubMed 검색 Advanced Search 특정필드를제한하여검색할때 AND, OR, NOT 등의연산자를사용할때 연산자를사용한키워드조합이어려운경우 Builder를통한상세검색 검색한식내역 (History) 확인및재조합 (Add) 가능 검색식 100개까지저장가능, 컴퓨터종료및 8시간후삭제 History 저장가능 시연 : 소속원들의발행논문중 teaching 또는 screening 관련논문검색식

15 검색했던식재조합후검색가능 Advanced Search 연산자를사용한키워드조합이어려운경우 Builder 를통한상세검색 검색한식내역 (History) 확인및재조합 (Add) 가능 검색식 100 개까지저장가능, 컴퓨터종료및 8 시간후삭제 History 저장가능

16 동국대소속의 Teaching 과 Screening 이포함된논문검색

17 MeSH 란? MeSH: Medical Subject Headings 약자, 의학주제명표목표 미국국립의학도서관 (NLM) 에서만든통제어휘 ( 주제명표목표 ) 어휘를개념으로분류하여유의어, 반의어, 상하위관계등을단어로정의한용어사전 구성 : Heading(16 개범주, 26,142 개용어 ), Subheadings( 용어의여러가지측면 - 치료, 수술, 원인등으로그룹화 ) 적절한문헌을찾을가능성, 부적절한문헌을배제할가능성높아짐 시연 : MeSH 검색 cancer

18 MeSH Database 를이용하여 PubMed 검색 1. PubMed 검색창에서 MeSH 선택후검색 2. More Resources > MeSH Database 선택 MeSH 는논문의핵심주제를나타내므로빠르게핵심논문검색가능 ( 정확도증가 ) Subheading( 부표목 ) 을사용하여포커스검색수행 MeSH hierarchy tree 사용하여주요개념을확장또는축소하여검색가능

19 MeSH 에서검색한 Cancer 의경우 Cancer 로검색하면 Neoplasms 는 [Mesh] 용어로검색되고 Entry Term 에 Cancer 가등록되어있어검색가능 MeSH Database 에는정의, 도입날짜, 부표목 (Subheading), 검색제한, Entry Term, Previous Indexing 등 MeSH 계층구조정보제공

20 BabelMeSH 한글의학용어를영문 MeSH 로검색가능 해당용어의추가검색가능

21 1. 연구주제에서검색어선정 연구주제에서키워드추출 근거에기반한골관절염환자신체활동증진프로그램개발및적용 검색키워드 골관절염 /osteoarthritis 신체활동, 증진프로그램 / Human Activities, Health Promotion BabelMeSH 에서 MeSH 검색

22 2. MeSH 검색을통한검색어선정 MeSH on Demand ( 자동 MeSH 추출 ) MeSH > MeSH Database > MeSH on Demand Auto Mapping 으로입력한키워드에대한 MeSH Term 검색가능 논문의초록또는본문을입력하면자동분석하여 MeSH 키워드추천 검색 변환된 MeSH Terms 검색결과

23 3. 관련문헌의 MeSH 참조를통한검색어선정 Keywords / MeSH terms / Similar articles( 확장검색 )

24 검색결과화면 검색제한필터 검색결과서지정보, 순서, 페이지설정 논문명 저자 학술지, 출판년도, 권차기호, 페이지, doi, PMID( 논문고유번호 )

25 검색결과화면 1. 검색된결과의 Similar article 클릭시관련된다른논문으로재검색한결과보여줌 2. 검색어의연도별논문수를한눈에파악할수있는그래프, 마우스를그래프위에올리면연도별논문수가보이고, 선택하면해당연도검색결과로이동함 3. 검색된논문이 PMC에수록되어있을때에는그논문에실려있는이미지를보여줌

출판사에서제공하는원문연결아이콘 4. PMC 논문에서 #N회이상인용된논문의제목정보제공 5.

26 검색결과화면 1. PMID( 논문의고유번호 ) 와 doi, 2013년도이후 PubMed에등재된논문에수록된저자키워드제공 2. MEDLINE에색인된논문은 Publication Type, Substances, MeSH Terms, Link Out 정보등을제공 3. 출판사에서제공하는원문연결아이콘 4. PMC 논문에서 #N회이상인용된논문의제목정보제공 5. NLM 저널약어명학술지, 출판년도, 권차기호, 페이지, doi 정보제공 *Major topic* Myocardial Infarction/Surgery* Main heading Subheading

27 My NCBI NCBI 사이트에개인계정등록후이용가능 자신의논문, 프레젠테이션 연구업적저장및관리 최근 6 개월간검색이력 키워드검색후 create alert 클릭 ( 메일발송 ) 관심있는키워드나주제어저장및관리 RSS 가능 검색한결과저장및관리 검색한논문 Clipboard 저장 (8 시간저장 )> send to> Collections 이동 필터설정후검색된논문제한

28 My Bibliography 연구업적저장및관리 Public settings 시 My Bibliography 페이지를볼수있는 URL 제공 서지관리도구프로그램으로반입가능 PubMed 수록논문인경우저자명검색우리나라저자명검색 : 성, 이름검색 PubMed 수록이아닌경우 Medline Format 으로반입

29 My Bibliography This bibliography is private (make it public) Public settings 시 My Bibliography 페이지를볼수있는 URL 제공

30 Clipboard 검색결과나선택한논문의구조적인관리를위해 Clipboard 이용후 Collection 저장추천 검색한논문 Clipboard 저장 (8 시간저장 )> send to> Collections 이동

31 Collection 검색한결과저장및관리 검색한논문 Clipboard 저장 (8시간저장 )> send to> Collections 이동

32 Create Alert(Save Searches) NCBI 회원가입후이용가능 학술지 / 검색어메일링서비스 원하는학술지 / 검색어결과업데이트내역메일송신가능 Advances Search> Search History 의검색어메일링가능

33 Create Alert(Save Searches) 학술지메일링서비스 학술지업데이트내역메일송신

34 Create Alert(Save Searches) 검색어메일링서비스 Advances Search> Search History 해당검색어 Search>Save in MY NCBI

35 Single Citation Matcher 서지사항을통한논문검색 PubMed Tools > Single Citation Matcher 학술지명, 권 (vol.), 호 (issue), 시작페이지, 출판연도, 저자명, 논문의제목일부등입력해서논문검색 Reference 에서찾은논문, 저자명, 학술지명검색시유용

36 Journal List In NCBI DB NCBI DB 에포함된학술지서지정보검색 학술지명, 약어명, ISSN 등검색가능 More Resources > Journal List NCBI Databases

37 Clinical Queries 임상의를위한임상관련질의가능 Clinical Study Categories ( 병인, 진단, 치료, 예후, 임상진료지침논문 ) category / scope Sensitivity 민감도 : 해당주제논문모두검색 Specificity 특이도 : 검색의정확성높임 Systematic Reviews( 체계적인방법에의한문헌고찰 ) ( 임상시험리뷰, 근거중심의학, 가이드라인등 ) Medical Genetics( 유전학 ) 검색가능 시연 : zikavirus

논문상세화면하단 Publication Types 에 Retracted Publication 으로표기 2.

38 Topic-Specific Queries - Retracted Publication 철회되었거나철회된논문확인 ( 학술지가발간된상태에서철회된 PubMed 에는삭제하지않고철회상태를표기하고있음 ) 1. 논문상세화면하단 Publication Types 에 Retracted Publication 으로표기 2. 철회된논문검색 Topic specific Queries > Retracted Publication 클릭 > PubMed 에등재된논문중철회된논문전체검색가능 3. 오류정정레코드 검색창에 Published Erratum [pt] 로제한검색

39 HighLighting NCBI 회원가입후이용가능 검색결과형광펜기능 My NCBI > NCBI Site Preferences Highlighting 클릭

40 NLM 에서제공하는데이터베이스 PMC 생의학및생명과학학술지무료아카이브 Clinical Trials 196 개국에서수집된임상시험제공 MedlinePlus 일반인을위해제공하는의학 DB PubMed Health 질병, 건강, 질환등에관한예방과치료정보제공 (Clinical Trials 의 systematic reviews 를기반으로제공 )

41 Chrome 에서 The Paper Link for PubMed 활용 검색결과에 IF 제공 도서관에서구독하는저널 PDF 다이렉트다운로드등제공 1. 크롬웹스토어 > The Paper link for PubMEd 2. 크롬주소창에붙여넣기 chrome://extensions/ 3. The paper link for PubMed> 사용설정체크 > 옵션클릭 4. visit k.com/reg 클릭 > 구글계정등록 > 펍메드접속

42 The Paper Link for PubMed : Peaks Peaks 저자옆아이콘생성 저자의연간 IF 와수치화그래프제공

43 Chrome 에서 Eigenfactorizer 활용 크롬웹스토어 >Eigenfactorizer 설치 IF 에대치하기위한새로운저널퀄리티수치 영향력이높은저널색표현 : 빨간색 <-> 파란색

44 감사합니다

pUBmED UPDATE

pUBmED UPDATE PUBMED 검색및활용 서울대학교의학도서관 (02-740-8054) PART 1. INTRODUCTION PART 2. SEARCHING PART 3. RESULTS PART 4. MY NCBI PART 1. INTRODUCTION PubMed 소개 PubMed 특징 PubMed 이용 PubMed 소개 PubMed (http://pubmed.gov/) - 온라인을통해