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흥기 심
5 years ago
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1 PubMed 활용 1

2 1. NCBI Database PubMed PubMed Central : Open Access Journal (free) Bookself : 단행본정보와일부원문제공 GenBank : NIH 유전자서열 Database로 DNA 서열정보제공 PubMed Health : Clinical effectiveness research 제공 OMIM : 유전자와유전자표현형정보제공 2

3 2. PubMed 미국국립의학도서관에서 1996 년에서비스시작된의학분야최고의 Database medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, health care systems, and preclinical sciences. 1947~65년 16,000건, 1966년이후 2,800만건이상의 Citation Adds citations Tuesday through Saturday E-Journal 원문과연결 - 480개정도의원문 Database와출판사에서약 8,511 여종원문제공 ( ) 년 4월부터는 NCBI Bookshelf에서제공하는 Book도검색가능 3

4 3. 우리도서관 PubMed 우리도서관에서 E-J 을구독해서원문을바로볼수있는경우 의료원내에서만이용가능 우리도서관에서구독하는 E-J 연결뿐만아니라다양한링크정보제공 Full text 연결 Link, Print J 소장정보, 원문복사신청, SCIE 등재된경우다른논문검색기능, JCR impact factor 값확인 4

5 4. PubMed Searching Keywords 첫검색창에검색어를넣어서검색하는방법으로가장기본적인방법 Author Advanced 에서 Author 를선택해서검색 Journal Advanced 에서 journal 을선택해서검색 주제어 MeSH(Medical Subject Heading) 검색주제어의상하개념을확인할수있고 subheading 을지정하여검색 5

6 Keywords 검색 (1) 1. AND, OR, NOT 검색 lung AND cancer : lung과 cancer가모두포함된논문검색 lung OR cancer: lung이나 cancer 둘중하나만포함되어있으면검색 lung NOT cancer: lung 검색결과에서 cancer가포함된논문은제외 2. Phrase 검색 단어구로검색하기위해서는 사이에구를입력 3. Nesting 검색 ( ) 가있으면우선검색

7 Keywords 검색 (2) 4. Truncation 절단검색을원할때는 * 를사용하여검색 예 : child* (child, children, childhood 등 ) 5. Stopwords 6. Field Tag 이용검색 [ ] 에 Tag 약어를넣어검색. 해당 field 에제한하여검색가능

8 8

9 9

10 5. Filters 1. Article Type : Publication types 2. Text availability 3. PubMed Commons 4. Publication Dates 5. Species: Humans / Other animals 6. Journal Categories : Core clinical, Dental, Nursing Journal 5. Additional filter Languages Sex Subjects Ages Search Fields 10

11 6. Advanced Search Search Builder - 특정 field 로제한, 결합검색 - keyword 입력시 index 기능이있어서용어선택시도움이됨 Search History - 검색했던검색기록을확인 (100개까지 ) - Inactivity 8시간후삭제됨 - 이전검색질의어의결합검색이가능 - My NCBI에저장하여활용 - Clear History ( 삭제기능 ) 11

12 7. Documents (1) 검색된결과논문을보는형식을지정가능 1. Format : Summary, Abstract, MEDLINE, XML 2. Sort by : 논문배열순서설정 Most Recent, Best Match, Publication Date, First Author, Last Author, Journal, Title 3. Items per Page : 페이지당보여지는논문수설정 12

13 7. Documents (2) 1. Similar Articles 관련문헌으로재검색 2. Results by Year - 검색결과에서오른쪽상단에 Result by Year 그래프 - 검색어의년도별논문수를한눈에파악할수있으며, 마우스를그래프위에올리면년도별논문수를확인 3. PMC Images Search 검색된논문이 PMC 에수록되어있을때에는그논문에실려있는이미지를볼수있다. 이미지는 PMC 에등재된 Journal 만가능 4. Cited by # PubMed Central articles 검색논문중 PMC 논문에서 1 회이상인용된논문이면상세검색결과화면에서해당논문을인용한논문을검색 (#: 인용된횟수 ) 5. PubMed Identifier (PMID) 13

14 8. Clipboard 특정논문을선택해서모아둘수있음 이화면에서 Save를실행 500개의논문까지저장가능 - 단 inactivity 8시간후삭제됨 My NCBI에저장가능 (Save Collection) Remove from Clipboard ( 선택한논문삭제 ) 14

15 9. More Resources 1. MeSH Database 2. Journals Database 3. Clinical Trials 15

16 10. PubMed Tools 1. Single Citation Matcher 2. Batch Citation Matcher 3. Clinical Queries 4. Topic Specific Queries 16

17 11. My NCBI 1. Register ID 를등록한후사용가능하므로처음이용시에는 NCBI 에 ID 신청 2. My Bibliography 자신의논문을관리 3. Recent Activity 최근 6 개월간 PubMed 에서실행한검색기록확인 4. Save Search 5. Collections 6. NCBI site Preferences 1) Account settings: 주소, password 2) Common Preferences : Links Display, Highlighting 3) PubMed Preferences : Result Display Settings 17

18 My NCBI Register 1. 신청양식을작성 (Register account) 2. 신청서에입력한메일에가서 NCBI 에서보낸메일확인 My NCBI automatic updates confirmation 에서연결된주소방문 3. Keep me signed in : PubMed 연결시항상 My NCBI 에자동으로 로그인되도록설정하는기능 18

19 1. My Bibliography 자신의논문을입력하고관리 논문설정 private / Public : settings 연세대학교의학도서관 19

20 * Add citation 1 Add from PubMed : PubMed 수록논문인경우저자명으로검색 2 Add manually : PubMed 수록논문이아닌경우 3 Upload a file : MEDLINE format 으로반입

21 1. This bibliography is private (make it public) Public settings 시 My Bibliography 페이지를볼수있는 URL 형성 2. Edit settings for My Bibliography 3. Save My Bibliography to a text (MEDLINE format) 서지관리도구프로그램으로반입가능 21

22 1. This bibliography is private (make it public) Public settings 시 My Bibliography 페이지를볼수있는 URL 형성 22

23 My Bibliography : Related article 정보제공 ( 매주 update) 23

24 2. Saved Searches (1) 관심 keywords 를등록해놓고, PubMed 에서해당검색어결과가 Update 되면계정으로알려주는기능 ( 메일 alert 가능 ) 24

25 2. Saved Searches (2) 1. 검색결과화면검색창하단에 Create alert 링크가생성 25

26 2. Saved Searches (3) 새로운검색결과를 로자동으로받도록기간, format, 최소 items 수설정후 Save 26

27 2. Create Alert (4) 2. Advances Search > Search History 에입력된검색어에왼쪽마우스를클릭하면 option 메뉴가생성 --> Save in My NCBI 를선택하면저장입력창이생성 --> 저장할이름을지정하고 save setting 27

28 4) Collections (1) * Type 1. My Bibliography / Other Citation 2. PubMed PubMed 검색결과를 My NCBI 에저장저장된논문을 Private / Public setting 가능 ( 블로그등에논문을올릴때자동으로 URL 을생성 ) 28

29 4) Collections (2) 1. PubMed 검색결과에서저장하고싶은논문을선택한후 Clipboard 에저장 2. Clipboard 선택 --> send to > Collections 선택 3. Add to Collections 29

30 4) Collections (3) 1. 새로운 collection 생성, 기존 collection 에추가할것인지선택 2. Save 30

31 4) Collections (4) 저장한 collection 을 sharing : collection 에저장된논문만보이는 URL 을생성 31

32 4) Collections (5) 32

33 4) Collections (6) 33

34 4. Filters (1) PubMed 검색결과에서특정검색어나 Limit, 결합검색을원하는경우 Filter 로등록해놓으면검색결과를바로확인가능 34

35 4. Filters (2) 35

36 1. My Filters 4. Filters (3) 자신이설정해놓은 filter 확인 15개까지설정가능 2. Custom Filters 자신이등록하고싶은 filter 를직접등록하고싶을때 3. Browse / Search for PubMed Filters Filter를검색해서바로등록 Category : Popular, Linkout, Properties, Links 36

37 . Custom Filters 설정 4. Filters (4) Filter 명지정 -->Query terms 에검색식입력

38 4. Filters (5) 1. Category > Popular 2. Category > Linkout 38

39 4. Filters (6) 3. Category > Properties 4. Category > Links 39

40 5. Preferences 40

Pubmed Central (1) http://www.ncbi.nlm.nih.

41 Pubmed Central (1) NLM 에서제공하는생의학및생명과학학술지의무료아카이브 년 2 월 PubMed Central 로서비스시작현재 PMC 라는명칭으로 2016 년 9 월기준 3,905 종학술지제공 41

42 Medline Plus NLM 에서일반인을위해제공하는의학 Database 증상별, 질병별 topic, 약품정보, 의학이미지, 의학용어사전, 최신뉴스, 인명정보, 병원주소등다양한정보모음 42

43 PubMed Health NLM 에서제공하는 DB 로질병과건강, 질환등에관한예방과치료정보제공 Clinical effectiveness research finds answers to the question What works? in medical and health care clinical trials 의 systematic reviews 를기반으로제공 43

44 1.Reference 에서찾은논문을보고싶어요!

45 2. SR 논문만찾고싶어요! PubMed Clinical Queries PubMed Health

46 PubMed Clinical Queries 46

48 3. Impact Factor 를확인하고싶어요! Chrome 사용

49 4. Chrome 활용 확장프로그램추가 1. The paper link for PubMed : Impact factor, Peak 2. Lazy Scholar : Impact factor, Wos 인용횟수등 3. Eigenfactorizer : Journal Influence 정보등

50 감사합니다. 김나원 (82915)

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슬라이드 1 PubMed 기초 1 NCBI Database PubMed PubMed Central : Open Access Journal (free) Bookself : 단행본정보와일부원문제공 GenBank : NIH 유전자서열 Database로 DNA 서열정보제공 PubMed Health : Clinical effectiveness research 제공 OMIM : 유전자와유전자표현형정보제공