검색매뉴얼 연세대학교의학도서관 김나원 2017.06.26
Contents I. PubMed... 4 II. 우리도서관 PubMed... 8 III. PubMed 검색... 9 1. PubMed Searching... 10 1.1 Keyword 검색... 11 1.2 저자명검색... 12 1.3 학술지명검색... 12 1.4 MeSH 검색... 13 1.5 Field Tag 이용검색... 14 1.6 검색결과비교... 15 2. Filters... 16 3. Advanced Search... 19 3.1 Builder... 19 3.2 History... 19 4. Document... 19 4.1 Format... 20 4.2 Sort by... 23 4.3 Items per page... 23 4.4 Clipboard... 23 4.5 Similar Articles... 26 4.6 PMID... 26 2
4.7 Results by Year... 26 4.8 PMC Images Search... 27 4.9 Cited by over 1 PubMed Central article... 27 5. PubMed Tools... 28 5.1 PubMed Mobile... 28 5.2 Single Citation Matcher... 29 5.3 Batch Citation Matcher... 30 5.4 Clinical Queries... 30 5.5 Topic Special Queries... 31 6. More Resourcess... 34 6.1 MeSH Databases... 34 6.2 Journals in NCBI Databases... 37 6.3 Clinical Trials... 38 7. My NCBI... 39 7.1 Register... 39 7.2 My Bibliography... 42 7.3 Recent Activity... 44 7.4 Save Searches... 45 7.5 Collections... 47 7.6 Filters... 49 7.7 NCBI site Preferences... 52 IV. Tutorials... 54 3
I. PubMed 미국국립의학도서관 NLM(National Library of Medicine) 산하 NCBI 에서무료로 제공하고있는 Database 로 Biomedical 관련즉의학 간호학 치의학 수의학 등최신의학서지정보를검색할수있는의학분야최고의데이터베이스입니다. NCBI 에서는 PubMed 뿐만아니라다른 Database 도제공하고있으며, 그목록은다음과같습니다. - Nucleotides : GenBank 유전자염기서열검색 - Proteins : 단백질염기서열검색 - Genomes : Genome 과염색체의 mapping data 검색 - Structure : 단백질의 3 차구조검색 - OMIM : 유전병관련 DB 로특정유전질환에대한설명이나연구자료검색 - PubMed Central : PubMed Central. 원문을무료로이용할수있는논문 - Journals in NCBI Databases : Journal 검색 - Books : 단행본정보로서일부는무료로원문이용 PubMed 는 5,600 여종이상의 Biomedical journal 을포함하고있으며, 1948~65 년까지 16,000 여건의 citation 을포함하고있는 Old Medline 과 1948 년이후 2,700 만여건이상의 citation 을포함하고있으며, Medline 을모두제공하고있습니다. 2017 년 6 월현재 475 개정도의원문제공데이터베이스와출판사의약 8,337 종의원문링크를제공하고있으며, 현재모든저널의원문이연결된것은아니지만 PubMed 를검색해서바로원문을볼수있는편리한기능을이용할수있습니다. PubMed 는검색방법도다양하며, 검색식이나검색한논문들을저장할수있고, update 되는검색결과를이메일을통해자동으로받아볼수있는기능, 검색 결과를자동으로 filter 해서볼수있는기능도있습니다. PubMed 에수록된논문들의구성을살펴보면 Medline 이 89% 정도를차지하고있으며, 그외 In Process (1%), OLDMEDINE (1%), Only PubMed (7%), Publisher (2%) 로구성되어있습니다. 2010 년 4 월부터는 NCBI Bookshelf 에서제공하는 Book 도검색이가능합니다. (2010 년 4 월현재 GeneReviews, Essentials of Glycobiology 가수록 ) 4
F 2,3 를보면검색결과에서보여지는항목을통해서논문이어디에포함되어 있는지를확인할수있습니다. 논문의상세화면으로들어가면논문의 status 를 확인할수있습니다. 1 as supplied by publisher PubMed 의논문들은대부분출판사로부터전자로전달되는데, 이는출판중인논문을빠르게접근할수있도록위한방법입니다. 이논문들은통제되지않은서지정보로정확성이떨어질수있습니다. 2 In process In process 논문들은기본서지정보와초록을제공하고있습니다. MEDLINE 범위에있는논문이라면주제어가부여되고서지정보의확인이검토된논문입니다. 이후 MEDLINE 으로이동됩니다. 3 Indexed for MEDLINE NLM 의주소요서지 DB 인 MEDLINE 에색인이된논문으로, 이논문들은완전한논문들로서지정보가정확합니다. 4 OLDMEDLINE 1946 년부터 1965 년사이발행된의학, 임상전실험학, 보건학분야의약 2 백만건의논문이포함되어있으며, 초록을제공하고있지않습니다. 5 PubMed 출판사로부터전자적으로전달된논문중 MEDLINE 에등재되지않은논문들로색인과정을거치지않기때문에 MeSH 용어도부여되지않습니다. 6 Books and Documents PubMed 에 title 이나 chapter 가인용된단행본들로 NCBI Books Database 에수록되어있습니다. 7 PMC PMC 에등재된학술지논문으로 MEDLINE 에등재되지않은논문입니다. 정확한서지정보를제공하고있습니다. 5
F.1 은 PubMed 에수록된자료들의상태를보여주는표입니다. F. 1 F. 2 6
F.3 7
II. 우리도서관 PubMed PubMed 검색결과에서는다양한 Link 가연결되어있습니다. 내에서만이용이가능합니다. 아이콘이있는경우원문을바로볼수있습니다. 단의료원 을선택하면원문연결 link 뿐만아니라인쇄학술지소장정보, 원문복사신청, JCR 의 Impact factor 확인이가능하며, SCIE 에등재된경우저자의다른논문을 Web of Science 에서검색할수있으며, SCI SCIE SCI 등재여부, 논문작성프로그램인 EndNote 로반입할수있는링크가연결되어있습니다. 검색에앞서모든기능을이용하기위해서는의학도서관홈페이지를로그인한후 PubMed 검색을시작해야합니다. 의료원외부에서는홈페이지로그인을하시면교외접속이가능합니다. 단원문이용은 Find It Yonsei 아이콘을통해서만가능합니다. (Explorer 의보안이높게설정되면이용에오류가발생하니 보통 이하로설정하고이용하셔야합니다 ) F. 4 8
III. PubMed 검색 의학도서관홈페이지에연결된 PubMed 로접속해야만우리도서관에서구독하는 전자저널의원문정보나다양한링크서비스를이용할수있습니다. 검색후 Find it Yonsei 링크를통해얻을수있는정보입니다. F. 5 9
< 제공하는정보 > Fulltext Link 우리도서관소장자료검색 추천논문검색 ( 검색된논문을본이용자가추가로본논문제공 ) 원문복사신청 JCR (Impact Factor) 검색 SCI, SCIE, SSCI 등재여부검색 EndNote 로반입 Web of Science 검색 Author Instruction 사서에게물어보세요 1. PubMed Searching F.6 은 PubMed 의첫화면이며, 검색창에검색어를입력하면됩니다. F. 6 10
PubMed 검색방법으로는기본적으로 keyword 저자 학술지명 MeSH( 주제어 ) 검색이있습니다. Keyword 검색의경우특별히제한을하지않고검색한다면모든 Field 에서검색이이루어지기때문에결과물의양이많아지거나, 부정확한논문도검색될수있습니다. 그러므로정확한검색을위해서는검색방법을여러가지로활용하는것이좋습니다. 1.1 Keywords 검색 1) AND, OR, NOT 검색 Boolean Logic 을사용하여검색어를여러개결합해서검색을할수있습니다. 검색창에 AND, OR, NOT 을단어사이에넣어서검색할수있는데이때대문자로입력하는것이좋습니다. 1 AND lung AND cancer : lung 과 cancer 가모두포함된논문검색 2 OR lung OR cancer: lung 이나 cancer 둘중하나만포함되어있으면검색 3 NOT lung NOT cancer: lung 검색결과에서 cancer 가포함된논문은제외 2) Phrase 검색 단어구로검색하기위해서는 사이에구를입력하여검색합니다. 3) Nesting 검색 ( ) 가있으면우선검색 4) Truncation (Wild characters) 검색 절단검색을원할때는 * 를사용하여검색합니다. PubMed 에서는 600 개의 단어까지만확장이가능합니다. 예 : child* (child, children, childhood 등 ) 11
1-2 저자명검색 1) [AU] 이용 : 저자의성, 이름이니셜을입력한뒤, 저자를의미하는 field 값인 [AU] 를넣어줍니다. 예 ) Smith A. [AU] 2) Advanced 메뉴이용 F.7 3) Single Citation Matcher 이용 F.8 1-3. 학술지명검색 1) [ta] 이용 : 학술지명을입력한뒤, 학술지를의미하는 field 값인 [ta] 를 넣어줍니다. 예 ) Cancer[ta] 2) Advanced 메뉴이용 F.9 12
3) Single Citation Matcher 이용 F.10 1-4. MeSH 검색 MeSH Databases 를이용한검색입니다. 이검색방법은뒤에서 (p.33) 자세하게 설명하겠습니다. F.11 * MeSH Databases The National Library of Medicine's controlled vocabulary thesaurus (http://www.nlm.nih.gov/mesh) 검색어입력후해당검색어에해당하는 MeSH term 이검색되고, 상세화면에서는 subheading 과상하개념의용어들을계층구조로보여줍니다. 논문작성과정에서요구되는 MeSH term keywords 선정시에도확인가능합니다. 13
아래 F.12 는 asthma 라는키워드를입력한뒤, MeSH term 이검색된화면입니다. 여기서 asthma 라는 MeSH term 으로검색을원하면단어앞박스에체크를하고, 오른쪽 PubMed Search Builder 박스아래 Add to search builder 를클릭하면해당검색어가검색창안으로입력됩니다. 그후 Search PubMed 를클릭하면 PubMed 로이동하면서검색이됩니다. F.12 1-5. Field Tag 이용검색 [ ] 에 Tag 약어를넣어검색하면해당 field 에제한하여검색가능해서검색의 정확도를높일수있습니다. F. 13 에 Field 명 Tag 가나타나있으니, 이를참조해서사용하면됩니다. 예를들어 입력한검색어가 Title 이나 Abstract 에출현한경우에만검색을원하면키워드를 입력한뒤 [TIAB] 를입력하면됩니다. 14
F. 13 1-6 검색결과비교 검색어에어떤 option 을지정하고검색하는지에따라서검색결과는다양하게 나타납니다. 아래 F.14 에서는 artificial tooth 라는키워드를어떤 option 으로 검색하느냐에따라달라지는검색결과를확인할수있습니다. F. 14 Recent queries in pubmed Search Query Items found Time #7 Search artificial tooth[mesh Major Topic] 1267 4:31:45 #6 Search artificial tooth [Mesh] 2393 4:27:31 #5 Search artificial too* 2478 4:29:20 #4 Search artificial tooth [TiAb] 150 4:28:28 #3 Search "artificial tooth" 2472 4:26:18 #2 Search artificial tooth 5156 4:23:42 15
2. Filters 검색결과를제한하고싶을때이용할수있는메뉴입니다. 검색결과왼쪽 Sidebar 에서 filtering 할수있습니다. F.15 기본적으로 Article Types, Text availability, PubMed Commons, Publication Dates, Species filter 가보이고추가로 Show additional filters 를선택하면다양한 filter option 이있습니다. F.16 16
1. Article Type : 논문형식으로제한 Meta-Analysis, Randomized Controlled Trial, Review, Case Reports 등특정형태의논문만으로검색이가능합니다. 2. Text availability : Full Text, Free Full Text, and Abstracts : 전자저널및무료로원문을제공하는전자저널에수록된논문, 초록제공논문 (1975 년이전논문은초록이제공되지않음 ) 만을선택하여검색이가능하며, 동시선택도가능합니다. 3. Publication Date : 출판년도제한검색 4. PubMed Commons : Readers comments, Trending asticles 독자의 comments 가입력된논문과최근많이읽혀지는논문에대한검색 5. Publication dates : 출판년도검색 6. Species: Humans / Other animals 7. Languages : 언어별로제한하는기능으로, Korean 으로도제한검색이가능합니다. ( 여기서말하는 Languages 는논문의원문에서작성된언어입니다 ) 8. Sex 9. Subjects : AIDS, Cancer 10. Journal Categories : Core clinical Journal (119 종 ), Dental Journal., Nursing Journal) 11. Ages 12. Search Field Tags Filtering 검색을하고있는경우검색결과화면상단에로어떤 Field 에서제한검색을하고있는지알려줍니다. 해당 Filter 를제거하고싶으면 Clear All 를선택하면 filtering 이제거됩니다.. F. 17 17
3. Advanced Search 검색방법을다양하게해줄수있는메뉴로 field 명으로제한한후결합할수있는 기능과이전검색이력들을조합하여결합검색을할수있습니다. 3.1 Builder 검색어의결합을통해서다양한검색을할수있는기능입니다. F. 18 All Field 창을선택하면오른쪽에보여지는 field 명이보이고, 그곳에서제한하고싶은부분을선택하고검색창에검색어를넣으면해당 field 로만제한한후검색할수있습니다. 제한이가능한 Field 명으로는 Affiliation, All Fields Author, Filter, First Author, Issue, Journal, Language, MeSH Terms, Pagination, Publication Date, Text Word, Title 등이있습니다. 또한 Show index list 에서는검색어를정확히모르는경우검색어입력후선택하면입력한단어이하의용어가알파벳순으로보여주어보다정확한검색어선택이가능하도록도와줍니다. 3.2 Search History 검색했던검색이력을확인할수있으며, 검색어들을 Boolean Logic(AND, OR, NOT) 을이용하여다양하게결합검색을할수있는기능입니다 이전에검색했던검색어에일련번호가주어지고, 그일련번호 (#1 ) 들간에결합하여검색을할수있습니다. 또한일련번호와단어도결합할수있습니다. 번호들간에결합을하려면 Add to builder 에있는 Add 클릭하면검색창이 Builder 로해당번호가자동으로입력되며이때원하는 Logic (AND, OR, NOT) 을선택하면결합검색이이루어집니다. 18
F. 19 History 는 100 개까지검색식이저장되고, 컴퓨터의 inactivity 시간이 8 시간지나면자동으로삭제되므로검색결과를출력하거나 Save in My NCBI 기능을이용해서검색어를저장해야나중에다시그검색어를확인할수있습니다. 특정검색어를삭제하고싶으면 #No 를클릭하여 delete 라는메뉴에서삭제하면되고, 저장한검색어를모두지우려면 Clear History 를선택하면됩니다. 박스오른쪽상단에있는 Download history 를선택하시면엑셀파일로검색기록이저장되어다양한활용이가능합니다. 4. Document 검색결과를보는방법으로, F.20 은검색간략화면에서보여지는정보입니다. F. 20 19
display format, Show, sort 를통해검색된결과를여러가지형태로변경할수 있습니다. 화면형식, 논문수, 배열방법을설정할수있습니다. 4.1 Format F. 21 먼저 Format 은 default 는 summary 로지정되어있으나다른형식의화면으로변경할수있습니다. 논문의전자저널이용가능여부를확인할수있는원문아이콘과초록까지보고싶으면 Abstract 으로변경하고, EndNote 로자료를반출하려면 MEDLINE 으로 display 형식을변경하면됩니다. 전자저널로원문을볼수있는지확인하려면해당논문을선택해서상세정보 화면으로이동하거나 display 형식을 Abstract (F.22) 으로바꾸면됩니다. F.22 20
Abstract 을선택하면검색된모든논문들에원문을볼수있는 Journal 인경우 원문연결아이콘이나타납니다. 검색된논문에서원문과관련되어보이는원문 아이콘에는 3 종류가있습니다. 먼저해당출판사에서제공하는원문아이콘과 Yonsei 표시가있는 2 개의아이콘, 을볼수 있습니다. 우리도서관에서구독하는전자저널의원문제공여부는 2 개의아이콘에서 보여줍니다. 먼저논문에 이있다면우리도서관에서전자저널로구독하고있는 Journal 임을의미하고, 그아이콘을선택하면바로원문으로연결됩니다. 대개의 경우 PDF 형태의원문으로바로연결되지는않고, 초록이나 HTML 형태의 페이지를보여주고 PDF 를원하는경우그사이트에서연결된 PDF 링크를 선택해주어야합니다. 단의료원내에서만이용이가능합니다. 그리고 PubMed 자체에서원문링크를해주지않은출판사의저널인경우는 Fulltext 아이콘을보여줄수없으나, 이아이콘이없어도전자저널로원문이용이 가능한논문도있습니다. 다음에설명할 Find it Yonsei 에서는그러한경우에도 원문과연결을해줍니다. 또한의료원외부에서원문을이용하실때는이아이콘을 통해서만가능합니다. 두번째종류인을선택하면, F23 과같은상세화면이보입니다. 전자저널로원문이제공되는경우 Fulltext link 가나타나며, 소장정보에서는인쇄학술지소장유무를확인할수있습니다. 원문복사서비스를이용하고자하는경우에는원문복사신청서를선택하여신청합니다. 찾은논문이 SCIE 에등재된경우그저자의다른논문을 Web of Science 에서검색할수있는링크를제공하고있으며, 검색된 Journal 이 JCR 에등재되어있으면 JCR 로연결하여 Impact factor 값을확인할수있고, 저널의 SCI SCIE SSCI 등재여부도바로확인할수있습니다. 또한논문관리프로그램인 EndNote 로서지정보를보낼수도있습니다. 21
F. 23 원문신청을하기위해서는의학도서관홈페이지에서로그인을하고 PubMed 검색을시작해야개인정보가자동으로입력됩니다. 원문복사신청서를선택하면 F.24 와같은화면이나타나게되고, 그신청서에는개인정보와논문정보가입력되어있으므로신청범위를선택하면됩니다. 신청을하면원문복사담당자가신청한범위를확인하여신청한범위내에서원문입수가가능하면원문을입수한뒤연락을드리고, 그범위를넘어선경우연락을드립니다. 그경우에는담당자에게전화 (2228-2916) 나회신이메일로확인을해주어야만원문복사서비스가제공되므로이메일을꼭확인해야합니다. 비용이나소요기간은신청서하단에안내되어있으니참조하기바랍니다. F. 24 22
4.2 Sort by Sort by 에서는검색결과를 Most Recent, Best Match, Publication Date, First Author, Last Author, Journal, Title 순으로재배열하실수있습니다. Best Match 로 재배열하면검색된키워드와가장정확도가높은검색결과가상단에보여집니다. F. 25 4.3 Items per page 한페이지에보여지는논문수를 5 편에서 200 편까지조정할수있습니다. F. 26 4.4 Clipboard 검색한결과들을확인해보면모두다출력을원하는논문들은아닙니다. 그때출력을원하는논문들만을선택하여모아두는기능입니다. 검색결과를보면서논문앞에있는박스에체크를한후 Send To 에서메뉴를불러와 Clipboard 를선택하면됩니다. 선택이모두끝나면이곳에서한꺼번에저장, 이메일전송등을할수있습니다. 출력을원하는논문을선택한후 send to 를선택하면 choose 23
Destination 창이열리고, 메뉴에서 clipboard 를선택하고 Add to Clipboard 를 클릭하면됩니다. F. 27 Clipboard 안에논문이한편이라도저장되어있다면 F.28 에서와같이오른쪽상단에 Clipboard 링크가생성이되고, Clipboard 에들어가보면선택했던논문들이저장되어있는것을확인할수있습니다. 또한 Clipboard 에저장된논문은전체검색결과에서논문하단에 Item in Clipboard 표시가보여선택한논문이어떤것인가도확인이가능합니다. F. 28 24
또한 Clipboard 에논문이한편이라도저장되어있다면 PubMed 첫화면에서도 연결이되어바로 Clipboard 로들어갈수있는링크가생성됩니다. F. 29 출력을원하는논문을모두선택한후, Clipboard 를클릭하면선택하여모아둔논문을확인할수있습니다. Clipboard 에서삭제를원하면논문하단에 Remove from Clipboard 선택하면해당논문은삭제되고, 모두삭제하고싶으면결과창위에있는 Remove all items 를선택하면됩니다. F. 30 이와같은방법으로 Clipboard 에는논문을 500 개까지저장할수있으며, 컴퓨터의 inactivity 시간이 8 시간이지나면자동삭제되므로그전에프린트나저장 등의방법으로출력을해야합니다. 25
4.5 Similar Articles 검색된결과에서 Similar Articles 을선택하면관련된다른논문으로재검색하여결과를보여주는기능입니다. 연결된링크를선택하면해당논문과관련있는논문들을보여줍니다. 만약찾은논문이정확도가높다면이메뉴를이용하면관련문헌검색을자동으로추천받을수있습니다.. 4.6 PMID PubMed 에등재된논문에부여된일련번호로해당번호로도검색이가능합니다. 특정논문을다른사람과공유하고싶을때해당번호를알려주면논문을쉽게찾아볼수있습니다. F. 31 4.7 Results by Year 검색된결과를연도별로보여주는그래프를확인할수있습니다. 특정년도를 선택하면그연도로 filtering 된결과도볼수있습니다. F. 32 26
4.8 PMC Images Search PubMed 논문중 PMC 에등재된논문에포함된이미지가검색되어보여집니다. 해당이미지들은재사용도가능해서유용하게활용할수있습니다. F. 33 4.9 Cited by over 1 PubMed Central article PMC 등재된논문의경우는해당논문을인용한논문에대한정보도얻을수 있습니다. F. 34 27
5. PubMed Tools 기본적으로제공하는검색외에추가로활용가능한메뉴로, PubMed 화면하단 중앙에 5 가지메뉴가있습니다. 1. PubMed Mobile 2. Single Citation Matcher 3. Batch Citation Matcher 4. Clinical Queries 5. Topic Specific Queries F.35 5.1. PubMed Mobile PubMed 의 Mobile 버전입니다. 이메뉴는검색기능도일부만지원되고, Fulltext 이용시도서관에서구독하는저널확인이불가능하며의료원외에서는원문이용도불가능합니다. 화면하단왼쪽에 link 되어있는 Full Website 를클릭하여 PC 버전으로이용하는것이더좋습니다. 28
F. 36 5.2 Single Citation Matcher 특정논문을찾고자할때이용하는메뉴로알고있는논문의서지정보중학술지명, 권, 호, 시작페이지, 출판년도, 저자명, 논문의제목일부등의정보를입력해서원하는논문을검색합니다. 만약모두입력한다면 1 개의논문만이검색됩니다. 이때학술지명, 년도, 시작페이지정도를입력하고검색하면간편한검색이가능합니다. F.37 29
5.3 Batch Citation Matcher 이기능은이용자들보다는출판사처럼한번에대량의논문을찾을필요가있는 경우에사용하는기능입니다. 5.4 Clinical Queries 임상관련질의를할수있는메뉴로 Clinical Study Category, Systematic Reviews, Medical Genetics 검색이가능합니다. 관심있는분야범위를좁혀서검색할수있는기능으로제한검색을간편하게할수있도록연결되어있습니다. F.38 1) Clinical Study Category etiology, diagnosis, therapy, prognosis, clinical prediction guides 별로검색이가능합니다. Scope 에서는 narrow-specific search 를선택하면관련문헌은적지만그결과물의정확도는높은답변을얻게되고, broad-sensitive search 를선택하면관련문헌은많지만검색결과의정확도는좀떨어지는결과를얻게됩니다. Category 와 Scope 을선택하고검색어를입력하면검색창안에 Filter 검색이숨겨져있어간단하게 Clinical study 로검색을할수있습니다. 각각의 Category 와 Scope 이어떤 filter 기능을하고있는지는아래 Filter table 을참고하면알수있습니다. 30
F. 39 2) Systematic Reviews PubMed 에수록된논문중 Systematic Reviews 논문만으로제한검색을해줍니다. 3) Medical Genetics diagnosis, differential diagnosis, clinical description, management, genetic counseling, molecular genetics, genetic testing 에서전체또는일부를선택해서검색을할수있습니다. 5.5 Topic Specific Queries 특정주제등으로다양하게제한하거나 filter 제공해주고연결검색을할수있는기능입니다. 하여검색할수있도록검색창을 1) Queries Targeted for Clinician and Health Services Researchers - Clinical Queries, - Health Services Research Queries, - Cancer Topic Searches (U.S. National Cancer Institute 와연결되어 100 가지정도의 cancer topic 을선택하여 PubMed 로연결되어검색 ) - Healthy People 2010 31
2) Subjects - AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, - Health Disparities, Health Literacy, History of Medicine, - Space Life Sciences, Smallpox, Toxicology, - Veterinary Medicine / Animal Health 3) Additional Search Queries / Interfaces - ALTBIB, CAM on PubMed - MedlinePlus Health Topics (NLM 에서일반인을위해제공하는건강정보사이트로다양한질병에관한정보와의학백과사전등이미지, 동영상등많은자료를제공 ) - National Institute of Health Funding Support (NIH 의연구지원을받아진행된연구결과를검색 ) - Retracted Publication ( 철회된논문검색 ) - TOXNET 4) Journal Collections 수록된학술지의종류는수시로변경되며, 리스트는도서관홈페이지 E-Resources / PubMed / Tip 메뉴에서제공하고있습니다. - Core clinical Journal (Abridged Index Medicus 에수록된 119 종의영어 Journal) - Dental Journal - Nursing Journal F.40 32
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6. More Resources MeSH Databases, Journals in NCBI Databases, Clinical Trials F. 41 6.1 MeSH Databases MeSH Databases 는입력한 Keyword 를 MeSH 로변경해서검색결과를보여주고, 검색된용어를선택하여상세화면으로들어가면주제어의정의, Subheading, 상하개념용어들의계층구조등을제공합니다. MeSH 란 Medical Subject Heading 의약자로주제어를통제어로만들어놓은용어입니다. 자연어가아니기때문에입력한단어가모두검색이되지않습니다. 논문검색후결과가거의없다거나검색의정확성이떨어지는경우검색어변경시이용이가능하며, 개인논문의 Keyword 선정시 MeSH 를이용하면정확한용어선정이가능합니다. F.42 34
예로 cancer 라는단어를검색해보면, cancer 대신다른관련용어들만검색이된것을볼수있는데, 이는 cancer 가 MeSH 용어가아니기때문입니다. 검색된용어중하나를선택해보면, 용어의정의가나와있고, 관련어, 상하개념의용어들을확인할수있습니다. 또한오른쪽에있는 Link 를클릭해서 PubMed 를선택하면해당 Mesh 용어로 PubMed 로연결해서검색결과를보여줍니다. 좀더자세한검색방법을보면, 검색된 MeSH 용어를선택하면용어의정의가보이고 Subheading 을선택해서검색할수있도록되어있습니다. 해당주제어에서특정 Subheading 만을선택해서검색하고싶은경우 F. 43 에서와같이나열되어있는 Subheading 을선택한후 ( 복수선택가능 ) Add to search builder 를선택합니다. 그러면 F. 43 과같이검색창이생성되고, Search PubMed 를클릭하면검색결과를볼수있습니다. F. 43 MeSH 에관한자세한내용은, MeSH Databases 에연결되어있는 MeSH 를선택해 보면자세한설명과더불어매년선정되는 Mesh 용어를확인할수있습니다. 35
F.44 * MeSH on Demand https://www.nlm.nih.gov/mesh/meshondemand.html 검색박스에논문의서명이나초록등을입력하면해당문서를분석하여 MeSH term 을추천해줍니다. 또한추천한 MeSH term 을가진논문도검색결과로알려줘서입력한문서와관련도가높은검색을실행해줍니다. F. 45 36
F. 46 6.2 Journal in NCBI Databases 학술지명으로검색을해서해당학술지에대한서지정보가검색됩니다. 검색할때는학술지의 full title 이나약어명, ISSN, 주제분야 (Subject Terms) 로검색이가능합니다. 이검색을통해서학술지의공식약어명, ISSN 등의정보를볼수있습니다. 오른쪽옆에있는 Link 를선택하면 PubMed 검색으로연결되어, 해당학술지를 PubMed 로검색해서그결과를볼수있습니다. F.47 37
6.3 Clinical Trials NIH 에서제공하는 Database 2017 년 6 월현재 202 개국에서수집된 24,745 개의임상시험을제공하고있습니다. Search, Study Topics, Glossary 로검색가능하고, clinical trials 를등록할수도있습니다. F. 48 38
7. My NCBI NCBI 사이트에자신의계정을등록하여관심있는주제어를등록하면 update 된논문을이메일로 alert 서비스를받을수있으며, 검색결과를저장할수도있고, 자신만의 filter 를등록하는기능, display 를 setting 하여이용할수있습니다. 또한입력한검색어에는특정색으로 Highlighting 이되어보여지도록설정할수있어서검색어가논문의어느부분에위치하는가를신속하게확인을할수있습니다. My NCBI 를이용하기위해서는도서관홈페이지 ID/password 와는별개로등록을 해야만합니다. 등록후로그인을하고신청한이메일을한번확인한후, 모든 기능들을이용할수있습니다. 7.1 Register 1) PubMed 오른쪽상단에있는 My NCBI 를선택를선택합니다. F.49 2) Register for an Account 를선택합니다. 39
F. 50 3) 신청양식을작성합니다. F.51 40
4) 신청서에입력한이메일주소확인합니다. 메일 (My NCBI automatic updates confirmation) 내용에서연결된주소를방문합니다. 이때주소가링크되어있지않으니, http:// ~ 이하주소를복사해서 Explorer 주소 창에붙이고엔터를치면됩니다. F.52 5) Keep me signed in 등록한 ID/pwd 로로그인을하고 Keep me signed in 을체크해놓으면 PubMed 연결시항상 My NCBI 에자동으로로그인되어있습니다. 만약컴퓨터를개인혼자사용한다면이곳에체크를하면컴퓨터를껐다켜도 My NCBI 는자동으로로그인되어있습니다. PubMed 이용시마다로그인이필요없기때문에한번설정해놓으면편리하게이용할수있는기능입니다. F.53 41
7.2 My Bibliography 자신의논문, 프리젠테이션등연구업적을저장해두고관리할수있습니다. Setting 을 Public 으로지정하면블로그등자신의연구논문을연결할수있는 URL 을생성해줍니다. F.54 논문입력방법 1. PubMed 수록논문인경우 : Add from PubMed ( 저자명으로검색 ) 2. PubMed 수록논문이아닌경우 : Add Manually 3. 기타 Book and Chapters, Presentations, Patients 도입력가능 F. 55 PubMed 수록논문인경우 related PubMed citations 을주단위로 update 해서 제공해주어, 해당논문과관련있는최신논문을확인할수있습니다. 42
F. 56 1) This bibliography is private (make it public) 메뉴에서 Public 으로 settings 하면 My Bibliography 페이지를볼수있는 URL 형성을형성해주어 My Bibliography 에등록된논문만볼수있는페이지를생성해줍니다. F. 57 2) Save My Bibliography to a text (MEDLINE format) 를선택하면서지관리도구 프로그램으로반입가능하도록파일을생성해줍니다. F. 58 43
7.3. Recent Activity 최근 6 개월간 PubMed 에서검색한이력을확인할수있습니다. 링크가걸려있어 다시 PubMed 로돌아갈수도있고, 검색식이나검색결과를이화면에서도저장이 가능합니다. F. 59 44
7.4. Saved Searches 자신이관심있는키워드혹은주제어를저장하여두고관리하는페이지로 PubMed 에서저장된검색어의검색결과가추가되면그논문들을메일로받아볼 수있도록지정가능합니다. ( 기간, 형태등지정이가능 ) F. 60 검색식을저장하는방법에는 2 가지가있습니다. 1) PubMed 에서검색을하면검색창하단에 Create alert 링크가생성되고, 저장 여부를묻는창을클릭하면저장할이름과스케쥴을입력할수있습니다. F. 61 2) Advanced / History 에서저장하고싶은검색어의 Search 번호 (#n) 에마우스를 두고왼쪽을클릭한뒤 Saved in My NCBI 를선택하면검색어를저장하는옵션창이 열립니다. 역시저장할이름과스케쥴을입력할수있습니다. 45
F. 62 Save search 나 Saved in NCBI 를선택하면 F. 63 과같은창이열립니다. 저장하려는 검색어의이름을정하고, 메일로갱신된결과를받아볼때주기, 메일로보내지는 형식등을지정하여저장합니다. F. 63 46
이렇게저장한검색어는 My NCBI 의 Save Searched 메뉴에서관리할수있습니다. Managed Saved Search 를선택하고들어가면저장된검색식들이보입니다. (F.64) Schedule 을선택하면다시이메일을받는주기, format 등을수정할수있습니다. 그리고더이상 update 결과가필요없는검색어인경우 Delete selected item(s) 를선택하면삭제되고, What s new 를선택하면마지막으로검색된이후추가된논문을확인할수있습니다. F. 64 7.5. Collections PubMed 에서검색한검색결과를저장해두고관리하는메뉴로다른저장장치가필요없이웹상에저장할수있습니다. 논문을저장하기위해서는먼저검색된결과에서저장하고싶은논문을선택해서 Clipboard 에저장을합니다. ( 참조 p. 24~26 Clipboard) 저장이완료된후 Clipboard 를들어가서 send to 메뉴에있는 Collections 를선택합니다. Clipboard 에모은논문들은 8 시간이지나면자동삭제가되지만 My NCBI 에저장하면본인이삭제하지않는이상계속저장되어있어언제든지확인이가능합니다. F. 65 47
검색결과를저장하기위해서는 Clipboard 에서 Send to 를선택하면 F.66 과같은 창이뜨고, 그곳에서저장하고싶은이름을정하는데, 이때기존에저장된 collection 에추가를할수도있고, 새로만들수도있습니다. F. 66 Add to Collections 을클릭하면저장할이름을지정하는창 (F.67) 이열립니다. F. 67 이렇게저장된논문은 My NCBI / Collections 에서확인할수있고, Managed Collection 에들어가면저장된논문들을확인할수있습니다. Collection 이름옆에 edit 를선택하면편집도가능합니다. 저장된 collection 을삭제도가능하며, 하나의 collection 중일부논문만도삭제할수있습니다. 48
F. 68 7.6 Filters Filter 를설정할수있어서 PubMed 검색후자동으로 filter 적용된검색결과를볼수있습니다. 설정된 filter 는 PubMed 검색후자동으로 filtering 되는검색결과를각각보여주고이동할수있도록링크를제공해주기때문에매우유용한기능입니다. F.69 49
F. 70 Filter 를설정하기위해서 filter 메뉴로이동하려면 My NCBI 메뉴에서 Filters / Manage Filters 에서설정할수있습니다. 또다른접근방법으로는이미 filter 가설정되어있는경우에는검색결과가보여지는화면에서 filter your Result 하단에 Manage Filters 링크가있고, 선택하면 filter 를지정할수있는화면으로연결됩니다. F. 71 Your PubMed Filter list 에서는자신이설정해놓은 filter 확인할수있으며, 등록한 Filter 중사용을원하지않는경우에는체크를해제하면 My Filter 에적용되지 않습니다. My Filter 는총 15 개까지설정이가능합니다. 50
Filter 설정하는방법에는 2 가지가있습니다. 1) Browse / Search for PubMed Filters : Popular, Linkout, Properties, Links Filter 를검색해서바로등록할수있습니다. Popular 와, Properties 메뉴는별도의검색없이도다양한 filter 들을보여주고있어설정을원하는 filter 에체크만하면등록이됩니다. 2) Custom Filters : 자신이등록하고싶은 filter 를직접만들어등록할수있습니다. F. 72 Custom Filters 를선택하면 Add Custom Filter in PubMed 창이열리고 Query terms 창에 filter 로등록하고싶은검색어를입력합니다. 그리고그검색어가유효한검색어인가는 Test This Query 를클릭하여검색결과가숫자로나오면 filter 로설정할수있는검색어입니다. Filter 이름을정하고 Save Filter 를하면내가원하는 filter 를만들어등록하게되는것입니다. 이렇게등록된나만의 filter 는 PubMed 검색결과오른쪽 sidebar 로보여집니다. F. 73 51
7.7 MCBI Site Preferences NCBI Site Preferences 에서는 password, 이메일주소, display 되는형식, 검색한 Keyword 에보여지는 Highlighting 색등을확인, 설정할수있습니다. F. 74 F. 75 이메일주소의경우주소뒤에 (confirmed) 라는문구가보여야저장된검색어의갱신된결과를자동으로받아보는메일주소가확인된것입니다. E-mail address 에원하는주소를입력을하면, 그이메일주소로 NCBI 에서확인메일을보내줍니다. 확인메일에는 Confirm 을할수있는 Link 가연결되어있는데, 그 Link 를선택해서로그인과정을거쳐야만이설정이완료됩니다. (P. 41. Register 참조 ) 이때, 메일을인식못하는경우에는주소를다시확인하라는내용의메시지나등록한이메일주소에서 NCBI 에서보내는메일을 Spam 처리한다는메시지가올수도있습니다. 그러면 User Preferences 에서다시이메일주소를수정하고다시한번반복해야합니다. 52
1) Highlighting 검색어에색을나타내주는기능으로, 내가찾는검색어가논문어디에 위치하는지한눈에파악할수있습니다. 2) Abstract Supplemental Data 검색된논문을선택해서상세정보화면으로들어갔을때, Publication Types, MeSH Terms, Substances 정보를화면에보여지도록설정할지를결정하는기능입니다. Open을체크해두면검색결과화면에서 Publication Types, MeSH Terms, Substances 정보를바로보여주고, Closed를하면링크만제공되고해당링크를선택하면각각의정보를보실수있습니다. 3) Document Delivery 우리도서관에서는 되므로별도의설정이필요없습니다. 에서제공하는원문복사서비스를이용하면 4) PubMed Filters & Icons 에서는 Filter 로설정한항목을확인할수있습니다. Outside tool 역시우리도서관 (Yonsei Medical Library) 을지정하면됩니다. 5) Result Display Settings 검색결과화면에서보여지는 display setting 을설정할수있는메뉴입니다. abstract 으로설정해놓으면검색결과는항상상세화면으로보여지게됩니다. 검색후매번 display settings 을바꾸실필요없이원하는 format 으로보여집니다. 53
IV. Tutorials PubMed 에서제공하고있는 Tutorial 기능으로, NLM 에서제작한 PubMed 이용방법에관한메뉴입니다. F.76 각각의기능별로연결되어해당부분을선택하면설명이 Flash 로제공되고있습니다. 검색방법에따른이용법과기능별로설명된이용법을모두제공하고있으니활용해보시기바랍니다. 추가할내용이나질문이있으시면도서관으로문의하여주시기바랍니다. ( 김나원, nwkim@yuhs.ac, 2228-2915) 54