ISSN 2288-2197 NEWS LETTER 2014. 07. ( 제 2 권제 2 호 ) http://kbn.cdc.go.kr/ 질병관리본부 ( 충북청원군오송읍오송생명 2 로 200) 자원활용연구소개 제주대병원인체자원단위은행사례 2011 년 2 월에신규은행으로선정된제주대학교병원인체자원단위은행은짧은연혁에도불구하고젊은연구자들을주축으로하여 다양한분야의종양및비종양질환들은물론제주지역에서특히 빈발하는유전질환들과건강대조군의인체자원들을수집하고있습 니다. 뿐만아니라기존의연구자들이인체자원은행도입이전부터 연구용으로수집하였던약이천여건의귀중한인체자원들도우리 은행이정한표준화절차를거쳐인체자원은행의자료로일원화하는 작업도수행하였습니다. 특히제주대학교병원소화기내과에서는소화성궤양, 점막절제후궤양등의 Helicobacter pylori 감염검사및치료의적응증에해당하는환자들중인체자원은행의자원수집에동의하는분들을대상으로하여검체를수집하고있습니다. 내시경생검의특성상대부분의경우검체의 양이제한적이므로수집과정에서 DNA 로분리하여저장하고있습니다. 송현주교수는제주대학교병원소화기내과에서왕성하게활동하고있는젊은연구자로서헬리 코박터제균치료실패와 H. pylori 의특정염기서열돌연변이와의관계가제주도라는한정된 지역에서어떻게나타나는지연구하고자하여기관 IRB 의승인을얻은후제주대학교병원인체 자원단위은행에해당자원의분양을문의하였습니다. 이에우리자원은행은송현주교수가제출한 분양신청서와자원활용계획서를바탕으로분양심의위원회를개최하여분양을승인하였습니다. 이후연구자는자원의분양에필요한인체자원 정보이전협약서를다시제출하였고우리인체 자원은행은은행이보유한위내시경생검자원중 H. pylori 감염이확인된 127 예의 DNA 자원을 분양하였습니다. 송현주교수는분양받은자원을이용하여 H. pylori 균의염기서열중 23S rrna 의 A2132G 와 A2143G 돌연변이여부를연구하였으며각각 7.9% 와 18.1% 의돌연변이를밝혀내어전체 127 예의 H. pylori 감염조직자원중 26% 가점돌연변이를가지고있음을확인하였습니다. 이연구결과는 2013 년에 Clarithromycin-resistant Helicobacter pylori Associated with 23S rrna Point Mutations in Jeju Island 라는제목으로발표되었고제주대학교병원인체자원단위은행에서제공한인체자원을이용하였음이표기되었습니다. 본연구는저희제주대학교인체자원은행에서시행한자원분양예중첫번째로발표된연구 결과로서저희은행에서각별히기쁘고감사하게생각했던사례여서이자리에소개하고자합니다. 제주대병원인체자원단위은행은행장맹영희 C O N T E N T S 01 자원활용연구소개 02 2014 년 2 분기단위은행인체자원수집현황 03 KBN NEWS LETTER 실무자인터뷰 04 해외선진바이오뱅크참관기 05 KBN 2 분기주요뉴스 06 단위은행 2 분기주요뉴스 인 발 쇄 : 2014 년 7 월 행 : 2014 년 7 월 발행처 : 질병관리본부국가생명윤리정책연구원 문 의 : 충청북도청주시흥덕구오송읍오송생명 2 로 200 국립중앙인체자원은행생물자원은행과인체자원연구지원센터 Tel_ 043. 719. 6544 Fax_ 043. 719. 6559
현재 논문개요 Kim T, Song HJ, Shin SY, Kim JH, Na SY, Boo SJ, Choi EK, Cho YK, Kim HU, Song BC. Clarithromycin-resistant Helicobacter pylori Associated with 23S rrna Point Mutations in Jeju Island Korean J Gastroenterol. 2013;61:252-8 요약 이번연구의목적은제주지역에서 H. pylori 제균치료실패와 clarithromycin 내성과연관된것으로알려진 23S rrna 점돌연 변이에대해 PCR assay(seeplex ClarR-H. pylori ACE detection) 방법을통해서확인하고자한다. 연구내용 본연구는제주대학교병원의임상시험심사위원회 (IRB) 로부터연구 프로토콜 (IRB No. 2011-32) 승인과모든환자의정보는임상시험 전서면동의를받았으며, 제주대학교병원인체자원단위은행에서 제공한인체자원을이용하였다. 1) DNA 추출 제주대학교소화기내과 부교수송현주 제주대학교병원영양집중지원팀장 경력 2001. 3. 1-2005. 2. 28 이대목동병원내과전공의 2005. 3. 1-2007. 2. 28 이대목동병원소화기내과전임의 2007. 3. 1-2009. 2. 28 이대목동병원소화기내과임상조교수 2009. 3. 1-2011. 8. 30 제주대학교병원의학전문대학원소화기내과기금조교수 2011. 9. 1- 현재제주대학교병원의학전문대학원소화기내과부교수 2006. 3 아시아태평양간학회젊은의학자상 2013. 11 제 63 회대한소화기내시경학회추계학술대회우수연제상수상 학력 1994. 3. 1-2000. 2. 28 이화여자대학교의학과학사 2003. 3. 1-2005. 2. 28 이화여자대학교의학과석사 2005. 3. 1-2008. 2. 28 이화여자대학교의학과박사 우선 clarithromycin 내성유전자검사는위생검조직에서 QIAamp DNA mini Kit (Qiagen inc., Valencia, CA, US 를사용하여제조사의키트설명서에따라 DNA를분리한후시행하였다. 11 위생검조직을 microcentrifuge tube에담고, 단백질을제거하기위해막대사발에위생검조직을넣고액체질소를조금씩부어넣으면서잘게부숴준후 ATL buffer 180 µl를넣고다시한번갈았다. 그다음막대사발에녹아져있는 ATL buffer 와조직을 1.5 ml tube 에넣고, proteinase K 20 µl를넣어준후잘섞이도록섞었다. 이후 56 (dry heating block) 에서완전히용해될때까지방치한후 AL buffer 200 µl를넣은후 70 (dry heating block) 에서 10분간반응시켰다. 조직이녹아있는 1.5 ml tube 에 100% 에탄올 200 µl를첨가하여섞어준후 QIAamp spin column 에넣어 8,000 rpm에서 1분간원심분리하였다. 이후세척을위하여 column에 AW1 buffer 500 µl를넣고 8,000 rpm에서 1분간원심분리하고, 2차로 AW2 buffer 500 µl를넣어 14,000 rpm에서 3분간원심분리하였다. Column에붙어있는 DNA를분리하기위해 AE buffer (Elution Buffer) 50 µl를넣어 1분간실온에방치한후 8,000 rpm 에서 1분간원심분리하였다. 분리된 DNA는자외선분광광도계 (Beckman, CA, US 를이용하여정량하고사용하기전까지 -80 에서보관하였다. 2) 내성유전자변이검사 Dual priming oligonucleotide system(dpo) 기법을도입하여개발된 Seeplex ClaR-H. pylori PCR kit(seegene Inc., Seoul, Korea) 의 Seeplex Home-brew primer mix를이용하여유전자를증폭하였다. DNA의증폭은 GeneAmp PCR system 9600(Perkin- Elmer Branchburg, NJ, US 을이용하였고, Kit 안의용액을빠른시간에실온에서완전히녹였다. Kit 에포함된시약은 5X ClaR- HP PM, 8-MOP solution, 2X Multiplex Master였다. 완전히녹인 kit 시약과 0.2 ml tube와 1.5 ml tube를준비하여, 0.2 ml tube는실제실험에이용될조직의갯수와 NC(negative control), PC1 (Clarithromycin 의 A2142G 내성 ), PC2(Clarithromycin의 A2143G 내성 ) 을포함하여준비하였다. 1.5 ml tube는원활한실험을위해시약을섞기위해사용되었다. 준비된 1.5 ml tube에 5X ClaR-HP PM (4 µl X 전체표본수 ), 8-MOP solution(3 µl X 전체표본수 ), 2x Multiplex Master (10 µl X 전체표본수 ) 만큼섞었다. 준비된 0.2 ml tube에각각의조직에추출된각각의 DNA 3 µl를넣었다. DNA를넣은 tube에섞은용액을 17 µl씩넣고, 방울이생기지않도록천천히섞어주었다. 3개의 0.2 ml tube(nc, PC1, PC2) 를준비하여 NC에는 8-MOP 3 µl을넣고, PC1, PC2에는 PC1, PC2 시약을각각 3 µl씩넣었다. 모든준비가끝나면중합효소 02 KBN News Letter
연쇄반응에실험온도및시간을맞추었다. 94 에서 15분동안변성시킨후 94 에서 30초, 65 에서 30초, 72 에서 1분으로 40회증폭하였다. 마지막으로 72 에서 5분간연장반응을시켰다. 3) 실험결과의판정증폭된 DNA 산물 5 µl를 2% 아가로스겔을이용하여 100 volt에서 30분간전기영동한후 ethidium bromide 로염색하여자외선투과조명기에서밴드를확인하였다. 621 bp 산물이관찰되면 H. pylori 양성으로해석하였다. H. pylori 양성검체에서 194 bp와 475 bp의변이형밴드가관찰되지않으면야생형 (wild type) 으로, 194 bp 산물이확인되면 A2142G 변이형으로, 475 bp 산물이보이면 A2143G 변이형으로해석하였다 (Fig. 1) 결과제주도에서 23S rrna 점돌연변이와관련된 clarithromycin 내성은 26% 로국내의다른지역들과비슷하며 (15.8-31.3%), 특히 A2143G 점돌연변이가일차 H. pylori 제균치료의실패와높은관련이있었다. 연구결과에대한기대효과및활용방안 Clarithromycin에의한내성률의증가와이로인한 H. pylori 제균실패의문제가대두되고있는현실에서 clarithromycin에대한내성을치료전에확인할수있는방법을찾는점은매우유용하다. 그러나현재까지 H. pylori에대한내성검사를위해배양은조건이까다롭고배양기간이길어서최근까지항생제감수성검사방법으로는표준화된방법이없었고, 내성을판정하는기준농도도연구자마다달라서내성률비교에도문제가있었다. 본연구에서는 Seeplex ClaR-H. pylori PCR kit을통한돌연변이여부를판단하였는데이를이용한방법은배양검사보다시간이적게걸려치료시작까지의시간을줄일수있는장점이있어임상적유용성이있다. Fig. 1. Detection of point mutation at A2143G and A2142G in 23S rrna gene by polymerase chain reaction products. Lane M, DNA ladder; lane 28; A2143G mutation, lane 29; wild type, lane73; A2142G mutation 2014 년 2 분기단위은행인체자원수집현황 Total Number of Recuited Participants 단위 : 명 (Unit : Participants) 구분 (Division) 은행명 (Biobank) 총누적수집명수 동의서확보된명수 * 강원대병원 (Kangwon National University Hospital) 380 362 경북대병원 (Kyungpook National University Hospital) 1,482 910 경상대병원 (Gyeongsang National University Hospital) 3,087 2,896 계명대동산병원 (Keimyung University Dongsan Medical Center) 1,462 1,462 부산대병원 (Pusan National University Hospital) 1,333 1,216 지역거점은행 원광대병원 (Wonkwang University Hospital) 416 410 인제대부산백병원 (Inje University Pusan Paik Hospital) 1,411 1,407 전남대화순병원 (Chonnam National University Hawsun Hospital) 1,567 1,545 전북대병원 (Chonbuk National University Hospital) 1,279 1,253 제주대병원 (Jeju National University Hospital) 159 9 충남대병원 (Choungnam National University Hospital) 2,512 1,219 충북대병원 (Choungbuk National University Hospital) 1,819 1,817 고려대구로병원 (Korea University Guro Hospital) 803 92 서울대병원 (Seoul National University Hospital) 198 193 협력은행 서울아산병원 (Seoul Asan University Hospital) 1,550 1,550 순천향대부천병원 (Soonchunhyang University Bucheon Hospital) 91 - 아주대병원 (Ajou University Hospital) 358 339 계 (Total) 19,907 16,680 * 14 년 6 월 30 일기준으로동의서정보가등록완료된자원의명수 서울아산병원내용은병원자체통계자료이며그외 16 개단위은행의내용은 BIMS 에등록된자료를활용한통계자료입니다. 3,500 3,000 2,500 2,000 1,500 1,000 500 강원경북경상계명부산원광인제 동의서확보된명수 * 동의서미확보명수 전남전북제주충남충북고려대서울대아산순천향아주 KBN News Letter 03
KBN NEWS LETTER 실무자인터뷰 아주대병원인체자원단위은행진주현 Q) 근무하시는인체자원단위은행에관해간략한설명부탁드립니다. 아주대병원인체자원단위은행은 2011년에선정된인체자원은행으로 간및소화기질환특화인체자원단위은행 입니다. 2001년부터 10년간보건복지부의질환군별유전체사업의일환으로시행되어온 간및소화기질환유전체연구센터 와함께 2006년부터 간및소화기유전자원은행 을설립하여운영해온경험과그간의물적 인적자원을승계발전시켜 아주대학교병원인체자원단위은행 을구축하여운영함으로써질환연구활성화를위해양질의인체자원과임상역학정보를수집, 보관하고연구자들에게제공하는것은물론적극적인질환연구를통해질환의조기진단, 치료법개발등국민보건건강에이바지하고있습니다. 아주대병원인체자원단위은행은아주대의료원의간센터, 소화기센터, 위암센터, 대장암센터, 유방암센터, 일반외과, 신경외과등과연계하여간및소화기질환의인체자원은물론갑상선암, 유방암, 뇌종양, 폐암, 베체트병등의인체자원, 임상 역학정보를보관하고있으며, 자체데이터베이스를구축하여운영함으로써보다더적극적이고안전하게데이터를관리하고있습니다. Q) 인체자원단위은행실무자로서의경력은어느정도되시나요? 현재담당하시는업무를소개해주세요. Q) 1996 년아주대병원입사이래지금까지 18 년동안간및소화기질환연구실, 간및소화기질환유전체연구센터를거쳐현재인체자원은행에근무해오고있습니다. 인체자원단위은행실무경력은유전자은행실무자로 2006 년부터인체자원단위은행선정이전까지 5 년, 2011 년인체자원단위은행선정후부터지금까지 4 년간입니다. 저는인체자원단위은행의전반적인운영을책임지고있으며은행운영에필요한행정, 자원관리, 분양관리는물론인체자원단위은행의국고보조금, 인력및시설 장비관리등을수행하고있습니다. 저희은행에는저를포함하여짧게는 2 년에서길게는 9 년까지다년간인체자원은행각분야별업무를담당해온 5 명의실무자가함께근무하고있습니다. 단위은행실무에있어어려운점은어떤점이있나요? 혹시이를개선할방법이있다면제시해주셨으면좋겠습니다. 우선, 인체자원은행실무와관련된제대로된규정이없다는점입니다. 인체자원단위은행을운영하는데필요한인력, 급여, 시설, 장비, 국고보조금사용등과관련된현실적인규정이없기때문에기관으로부터인체자원은행운영에필요한지원을받고자할때제시할수있는근거가없어지원을받기어려운경우가많습니다. 원활한인체자원은행의 운영을위해필수적인사항들에대한현실적인규정이마련되어야만인체자원은행사업의연속성이이루어질것으로생각됩니다. 또한수집해야하는임상 역학정보항목이매년변경된다는점입니다. 매년정책에따라수집해야하는임상 역학정보항목이변경됨에따라인체자원단위은행실무자들이수행해야하는업무의양이증가하고변경되는어려움이있습니다. 또한변경된항목에대한수집시점이변경공지시점이아닌이미기수집된자원에대해서도모두변경된항목에대해수집하도록하고있어실무자들의업무는기하급수적으로증가하는것이현실입니다. 매년정책에따라변경되는데이터수집이아닌, 명확히정해진목표에따라표준화된데이터관리가이루어진다면모든단위은행들이수집하는임상 역학정보에있어통일성을가지고통합되어자원을분양받는연구자들에게양질의정보를제공할수있을것으로생각됩니다. 마지막으로 BIMS 3.0 의미완성에따른업무진행이어려운점입니다. 아직까지 BIMS 3.0 에대한실무자추가교육은물론 BIMS 3.0 이미완성인관계로인체자원은행에서수행되고있는자원의정도관리결과및분양결과등의입력이이루어지지않고있는상황입니다. BIMS 3.0 의완성및입력이계속늦어진다면평가시점에있어인체자원단위은행실무자들의업무가배가되어많은어려움이있을것으로사료되는바, 가능한빠른시일내에 BIMS 3.0 추가교육은물론정도관리결과, 분양, 임상 역학정보입력과관련된사항들이완성되기를부탁드립니다. Q) 분양상담부터자원수령까지단위은행에서행해지는분양절차를효율적으로진행하는노하우가있습니까? 분양심의가이루어지기전에제일먼저진행되는분양가능한자원의보유현황문의에서부터분양신청서류접수에이르기까지모든분양절차에있어분양신청연구자와분양관리자가유선상으로나메일로상세한상담을진행합니다. 즉, 분양을신청하는연구자가연구에필요한자원의보유현황및임상 역학정보에대해문의하면분양관리자가바로자원관리자, 정보관리자와확인하여빠른상담을진행함과동시에분양신청연구자가작성해야할분양신청서류작성법등에대해안내하고, 가접수된서류를검토하여분양심의전에분양신청서류의미비한사항에대한수정작업이이루어질수있도록상담합니다. 분양신청과제의 IRB 심의통과후모든분양신청서류가완비되어분양신청이접수되면메일로분양심의위원 ( 자원활용운영위원회위원 ) 들게분양신청과제에대한간략한설명과함께관련서류일체와함께분양심의체크리스트를보내분양심의위원들로부터빠른분양심의가이루어지도록진행하고있습니다. 하여분양접수후분양심의가완료되고자원의인수가이루어지기까지 1-2주내에신속한분양이이루어지도록하고있습니다. Q) 중앙은행에서진행하는기본교육, 심화교육이외에추가로교육을원하시는부분이있으신가요? 그밖에도중앙은행에서좀더지원해줬으면하는부분이있으면말씀해주세요. 04 KBN News Letter
생명윤리법이나시행령, 시행규칙을근거로한인체자원은행실무에필요한내용에대한교육이추가되었으면합니다. 생명윤리법은원론적인내용이기에실무에적용해야하는사항이나범위를단위은행실무자들이해석하고규정하기가어렵습니다. 그러므로법률적인사항들을실무에어떻게적용해야하는지등에대한실무자교육과함께질의와답변시간이필요합니다. 지금까지실무자교육시에정도관리와관련된문제점이나질의, 개선점을여러차례개진하였으나제대로된답변이나개선점을확인받은바가없습니다. 또한최근에는분양을신청하는연구자로부터정도관리사항및결과에대한상담문의도많아지는추세이기에정도관리와관련된문제점이나개선사항등에대해해당전문가와실무자들이함께모여서로토의하고개선방향을찾는시간도마련되면좋을것으로생각됩니다. 해외선진바이오뱅크참관기 선진바이오뱅킹의현장, UK Biobank 를다녀오다. Q) 13 년도의경우단위은행실무자분들이워크숍등의행사로서로의견을나눌기회가많이있었는데요, 앞으로도인체자원연구지원센터에서는실무자분들이의견을나눌자리를지속적으로계획할예정입니다. 향후워크숍이나분임토의관련하여제안이있으면말씀해주세요. 인체자원단위은행실무자들이서로의견을나누고정보를공유할수있는행사는반드시필요합니다. 이러한행사가스케줄에따라내내워크숍강의를듣는시간들로이루어지는것은행사취지에도맞지않고실무자들의소중한업무시간만빼앗기는일이기에, 각단위은행의실무자들이서로인사를나누고자유롭게대화함으로써의견과고충을나눌수있는시간들로이루어질수있다면더좋을것같습니다. 분임토의를하는것은단위은행실무자들이정보를공유하는좋은방법이긴합니다만, 무엇보다도분임토의결과가실무에반영되어단위은행업무절차나근무환경등이개선되어야할것입니다. 단순히강의를듣고실무자들이모여개선되어야할점들을늘어놓는분임토의보다는각분야별해당전문가 ( 혹은은행관련담당자 ) 와실무자들이함께모여토의하고개선방향을함께찾는시간이필요하다고생각합니다. Q) 중앙은행과함께인체자원연구지원센터에서단위은행과관련실무업무를지원할예정입니다. 특별히바라시는점이있으면말씀해주세요. 아직까지인체자원단위은행의인지도가많이낮은편입니다. 단순히각단위은행에서알아서분양실적을높이라고만할것이아니라 R&D 국책과제와인체자원단위은행과의연계가이루어질수있도록하는정책이나홍보가마련될수있었으면좋겠습니다. 또한국가사업이나국책과제와연계될수있는공식적인홍보와다양한매체를통한홍보가각단위은행과함께이루어질수있었으면합니다. 또한 BIMS 3.0 사용자교육을각단위은행의특성에맞게단위은행별로진행해주신다던지, 제대로된 BIMS 3.0 사용자매뉴얼을제작해서배포해주심으로써각단위은행에서 BIMS 3.0 사용과관련된 SOP 를알아서만들어야하는이중업무를없애주시는등 BIMS 3.0 의원활한사용을위한실무적업무지원이있었으면합니다. UK Biobank 견학후기념사진왼쪽부터충북대학교병원이일석, 서울대학교병원윤근영, Dr Kristian Spreckley 그리고원광대학교병원김헌수교수 UK Biobank 를가다 17 개한국인체자원단위은행에서근무하는실무자를대표하여원광대병원김헌수교수, 서울대병원윤근영연구원과충북대병원이일석연구원으로구성된한국인체자원단위은행대표단은 해외선진바이오뱅크벤치마킹을위한해외기관방문 을목적으로 2014 년 6 월 24 일부터 27 일까지영국을다녀왔다. 특히 6 월 26 일에런던시에서열릴 UK Biobank Frontiers Meeting 참석에앞서 25 일에 UK Biobank 를방문하였다. 이번방문을통해선진바이오뱅크의자원관리, 분양정책등운영현황및기술동향을파악하고협력체계를구축하는것이중요한목표였다. 런던에서맨체스터로가는국내선을타고공항에내려다시차로 20 분여이동해야하는한적한시골마을에 UK Biobank 가위치하고있었다. 늘말로만듣다직접보게된다는기대감을가득안고도착했는데예상과달리아주소박한건물이어서 UK Biobank 라쓰인글씨마저없었다면잘못온것이아니었나할정도였다. 한국의인체자원은진료환자를대상으로자원수집이이루어지는것과달리 UK Biobank 는자원공여자가이곳또는지역센터를직접방문하여바이오뱅킹에참여하기때문에별도로일반인대기실이마련되어있었다. 우리도그대기실에서잠시기다리니견학을진행해주었던 Biocentre 소속 Dr Kristian Spreckley 가우리를반갑게맞아주었다. 먼저미팅룸에서 UK Biobank 에대한전반적인프레젠테이션및소개를들었다. UK Biobank 는 50 만명의자원을수집하며축적한기술및연구노하우를연구자에게제공하기위해 2012 년추가로설립된 Biocentre 를함께운영중이라고했다. 따라서수집된모든검체는이미 biomarker study 와 genotyping study 를끝낸상태로올해 5 월부터기존의자원공여자대상으로 imaging enhancement 연구가시작되어이곳에서직접 MRI 검사및결과분석이진행되고있다고했다. 또한현재까지분석된모든데이터는공식웹사이트에구축되어있어서 access 권한을받은연구자라면필요한데이터를제공받아연구에활용할수있다고했다. KBN News Letter 05
실험실을돌아보며브리핑이끝나고이어서실험실을견학하였다. 보안을위한출입카드를작성하고본격적으로견학을진행했는데약두시간여가소요되었다. 이곳의실험실은총 5 개로구성되어있고출입자는반드시입실전가운을입게되어있었다. 제일처음들어간 <LAB 3 실험실 > 은대용량생화학면역분석기 (AU5400, Olympus) 를이용하여검체의화학면역관련임상진단을하는실험실로단시간에대용량검체분석을하는실험실이다. 두번째로견학한 <LAB 1 실험실 > 은검체가도착하면최초로검체처리가진행되는곳으로대량의혈액, 소변등의검체를자동으로분리, 저장할수있는 96 well plate 기준전자동화장비 (Freedom Evo, Tecan) 가여러대있었다. 모든검체가자동처리되기때문에앞서갔었던실험실에는한명의연구원이, 이실험실에는두명의연구원만이근무한다고하였다. 그외혈액분석장비 (Sysmex XN, Sysmex) 등의임상검사용분석장비와시약보관및냉장실험용냉장실이있었다. 세번째로들린 <LAB 2 실험실 > 은세포배양및분자생물학관련실험을하는곳이었다. 다음으로우리견학단이가장궁금해했던검체저장실, <LAB 4 실험실 > 을돌아보았다. 실험실크기의어마어마한검체자동저장시스템 (Polar, The Automation Partnership) 은 80 의 robotic repository 로현재약천만개의 aliquot 된검체가보관되어있다고한다. 검체의입고부터출고까지전과정을로봇으로컨트롤하는자동화저장고로검체의안정성을위해입출고시에는 20 의상태를유지하도록설계되어있다고하니검체에대한그들의철저한관리를느낄수있었다. Dr Kristian Spreckley 의상세한설명과함께우리는앞서실험실에서봤던대형자동화분석장비와더불어엄청난규모의검체자동저장시스템을보며 UK Biobank 의기술력과연구기획력에서의선진적인면에모두감탄하지않을수없었다. 이곳외에도약 10km 떨어진곳에별도의백업저장소가있어서수집된검체의일부인약 4 백만여검체가그곳의액체질소냉동고와초저온냉동고에보관되어있다고했다. <LAB 4 실험실 > 에는이외에도보관된검체를자동으로꺼낼수있는 20 저장장비와 DNA 추출전용 <LAB 5 실험실 > 이있어서 array-based SNP genotyping 분석에필요한 DNA 를역시자동화장비를통해대량으로추출하고있었다. UK Biobank 전경 대량검체처리및분석에최적화된실험실전경. 윗줄왼쪽부터 <LAB 3 실험실 > 의대용량생화학면역분석기, <LAB 1 실험실 > 의전자동검체처리장비및 <LAB 5 실험실 > 의대용량전자동 DNA 추출기 미팅룸에서 실험실입구에비치된실험안전각종표지판 이와같은첨단장비를갖춘 UK Biobank 의일일샘플처리량은약 6 천여샘플! 하루에약 25,000 개의저장용 aliquots 까지수집할수있다고하는데이정도면전세계적으로독보적인바이오뱅킹이겠구나싶었다. 그다음의규모로스웨덴과미국, 일본정도라고했다. 두시간여돌아보는내내최첨단대용량전자동화장비시스템을구축하여최소한의인력으로최대한의자원수집과안정적인자원관리, 효율적분석능력을갖춘 UK Biobank 의하드웨어적인면이상당히인상적이였다. 그리고이곳의현재가앞으로우리가더열심히노력하고나아갈길을제시하는듯느껴졌다. 합리적으로설계되어검체수집증가에따라증, 개축이가능하도록설계된검체저장실내부 <LAB 4 실험실 > 의 -80 검체자동저장시스템. 윗줄왼쪽부터자동저장시스템외부, 오른쪽검체보관컨트롤실, 아래 repository 내부의 robotic 시스템. 견학을마치며이번견학을통해무엇보다감명받은점은 UK Biobank 가 자국민의헬스케어시스템구축및이를통한부가적인연구데이터창출과활용 이라는뚜렷한목적을갖고출발하여이미상당부분이루었으며정부이외에도 Wellcome trust, MRC (Medical Research Council), British Heart Foundation 등다양한지원처로부터안정적으로기금을지원받아의미있는연구가계속진행되고있다는점이였다. 또한견학전에는허름해보이기까지했던 Biobank 건물이연구의목적성에따라얼마든지자유롭게증, 개축이가능할수있도록하기위함이라는설명을듣고나니그들의유연하고실용적인사고방식도무척이나인상적이였고우리가꼭배워야할점이라는생각이들었다. 우리나라도자원수집량에서는영국과뒤지지않는다. 하지만다양한분야의연구자들이인체자원에손쉽게접근하여분양받을수있고이를활용한양질의연구가이루어져서영국처럼우리나라도국민에게유용한헬스케어시스템이구축되기를바라는간절한마음을안고런던으로돌아왔다. 그것이진정우리가어렵게자원공여자들로부터동의서를얻고인체자원을수집하는뜻일것이다. 서울대학교병원인체자원단위은행실무자윤근영 06 KBN News Letter
2014 London UK BioBank Frontiers meeting 참석 오전세션이끝난후점심시간에는별도의회장에 UK Biobank 홍보포스터와터치스크린스탠드를설치하여, UK biobank 및사이트이용방법및분양방법등에대하여터치스크린화면을통해직관적으로설명을해주었다. 또한자유롭게 UK biobank 에대하여 discussion 을하며정보를공유할수있는시간을가졌다. Frontiers Meeting 이진행된 The Queen Elizabeth II Conference Centre 앞왼쪽부터충북대학교병원이일석, 서울대학교병원윤근영, 원광대학교병원김헌수교수 1 2 Frontier Meeting 참석하다. 인체자원단위은행김헌수실무교수 ( 원광대 ), 윤근영연구원 ( 서울대 ), 이일석연구원 ( 충북대 ) 은 해외선진바이오뱅크벤치마킹을위한해외기관방문 을목적으로지난 2014 년 6 월 25 일에맨체스터에소재한 UK biobank 를방문하고 2014 년 06 월 26 일에는런던 The Queen Elizabeth II Conference Centre 에서개최된 2014 년 UK biobank frontiers meeting 에참석하여선진 biobank 의동향을파악하는시간을가졌다. 26 일에참석한 UK biobank frontiers meeting 은 UK biobank 와 MRC( 의학연구위원회, Medical Research Council) 및 wellcome trust 등의기관들을통해개최됐으며, 의학연구위원회장인 John savill 교수의 UK biobank 현황과활동사항을소개로시작을하였다. 오전오후두세션으로나누어진행된 UK biobank frontiers meeting 은총 11 개주제의구두발표와 2 회의 discussion 을통해참가자들에게 biobank 에대한정보를제공하고활발한논의가이루어질수있도록하였다. 오전세션의강연은 25 일에방문한 UK Biobank 에서 Dr Kristian Spreckley 로부터설명받은수집한자원들의관리및저장방법, 보유자원등이주된내용이었다. 오전세션에서 UK biobank 의 Rory Collins 교수는 Making the most of UK biobank 라는주제로강연을시작하였고, UK Biobank 는 2006 년에서 2010 년동안 500,000 명의성인 40~69 세의코호트를수집하였는데, 이러한대규모코호트의필요성와 UK biobank 에서이를통해활용하고자하는것은무엇인지에대하여강연을하였다. 1. break time 공간에부착되어있는포스터 2. 터치디스플레이를통해 UK biobank 관계자가홈페이지에서시료검색방법및분양신청방법등의의문점을직관적으로알려주는모습 3. 서울대학교병원실무자윤근영, 인체자원연구지원센터김미리 4. Frontier meeting 에참석한원광대학교병원김헌수교수 오후세션은 wellcome Trust -Population Health 의 Dr Jimmy Whitworth 의소개로시작되었으며 2-time 의 discussion 시간을가져참석자와의활발한논의가이루어졌다. 특히인상적이었던것은 9 번째세션에서 Dr Tim Peakman 의 Prodress with collection of seven day physical activity data 강연이었다. 3 4 세션 1 자료사진. 대규모코호트가필요한이유와 UK biobank 에서수집한코호트수 세션 9 자료사진. Wearable device 를이용한운동량정보수집 세션진행모습 현재국내역학정보지에의하면운동량정보에대해일주일에 30 분미만 /30 분이상 /1 시간이상 / 모름 등으로표기하여정확한값을가질수없는게국내병원의현실인데, UK Biobank 에서는 Wearable device( 신체착용형장치 ) 를이용하여보다정확하게운동량정보를기록, 관리할예정이라는발표에세세한것하나부터보다정확한데이터를구축하려고한다는사실에놀랄수밖에없었다. KBN News Letter 07
투어를마치며, 이번해외선진바이오뱅크벤치마킹투어를통해한국인체자원은행사업은비록 UK biobank 와다른방식으로시작하여상당한차이점이있지만, 궁극적으로이루고자하는목표는같다고느꼈다. 향후인체자원단위은행의노력을통해기탁하는공여자들의인식을보다더좋은방향으로성장시키고, 수집된자원에대하여자국연구자라면누구나손쉽게접근이가능하도록하여많은연구분야에분양이활성화된다면, 보다더국가를위한, 국민의건강을위한 biobank 가될것으로기대해본다. 충북대학교병원인체자원단위은행실무자이일석 KBN 2 분기주요뉴스 한국인체자원은행사업 (KBP) 홍보소식 [ 2014 학술대회홍보계획 ] KBP 부스홍보활동모습 대한간학회 간암연구학회국제학술대회 2014 년 6 월 12 일 ( 목 )-14( 토 ) 3 일간, 제주해비치리조트에서대한간학회 간암연구학회국제학술대회가개최되었다. 대한간학회와간암연구학회가함께진행한이번학회에는국제학술대회인만큼국 내외많은연구자들이참여하였다. 멀리제주에서열린학회였지만아주대병원과제주대병원단위은행실무자의참여로홍보부스운영을무사히마칠수있었다. 국외참관객들도우리나라바이오뱅크사업에관심을보였으며, 약 140 명이상의참관객에게한국인체자원은행사업및수집된자원의종류와분양신청절차에대해안내하고홍보자료와기념품을배포하였다. 앞으로도지속적인홍보활동을통해현장의연구자와직접만나인체자원에대한교류활동을진행할예정이다. 학회명일시장소 부스운영 세션운영 초록광고리플릿배포 한국단백체학회 14.03.27( 목 )- 14.03.29( 토 ) 인제대해운대백병원 대한진단검사의학회 14.04.04( 금 )- 14.04.05( 토 ) 서울워커힐호텔 대한신경정신의학회 14.04.10( 목 )- 14.04.11( 금 ) 그랜드힐튼호텔 대한천식알레르기학회 14.05.09( 금 )- 14.05.10( 토 ) 그랜드힐튼호텔 생화학분자생물학회 14.05.15( 목 )- 14.05.16( 금 ) 서울코엑스 대한신장학회 14.05.23( 금 )- 14.05.25( 일 ) 그랜드힐튼호텔 대한간학회 14.06.12( 목 )- 14.06.14( 토 ) 제주해비치리조트 대한암학회 14.06.19( 목 )- 14.06.20( 금 ) 롯데호텔 기초의학협의회 14.06.27( 금 ) 서울코엑스 한국유전체학회 14.09.18( 목 )- 14.09.19( 금 ) 한국과학기술회관 대한병리학회 14.10.15( 수 )- 14.10.17( 금 ) 더케이서울호텔 한국분자세포생물학회 14.10.21( 화 )- 14.10.23( 목 ) 서울코엑스 대한소화기학회 14.10.26( 일 )- 14.10.27( 월 ) 서울코엑스 대한신경과학회 14.10.31( 금 )- 14.11.01( 토 ) 그랜드힐튼호텔 대한비뇨기과학회 14.11.14( 목 )- 14.11.17( 월 ) 그랜드힐튼호텔 [ 학술대회홍보부스운영 ] 생화학분자생물학회연례국제학술대회생화학분자생물학회연례국제학술대회가 2014 년 5 월 15 일 ( 목 )-16 일 ( 금 ) 2 일간, 서울코엑스에서개최되었다. 올상반기가장크게진행된이번학회에는충북대병원, 경상대병원단위은행실무자들이홍보부스운영에참여하였다. 약 200 명의참관객이 KBP 홍보부스를방문하였고분양신청자격및비용등구체적인분양신청절차와자원보유현황에많은관심을보였다. 또한연구자용리플릿과더불어질환군별자원종류현황자료를요청하는등그간의홍보효과를현장에서직접볼수있었고적극적인홍보활동의필요성을느끼는자리가되었다. 단위은행 2 분기주요뉴스 원광대병원 [ Monitoring system 구축 ] 원광대학교병원인체자원단위은행은자원저장실관리를위해실시간 Monitoring system 및 CCTV 를설치하여저장고의온도변화와이상유무를체크하는등자원저장실을실시간관리하는시스템을구축하였다. Monitoring system 은각각의저장고의온도변화를날짜별시간별로확인할수있으며이상상태나사고발생시간및사유등이자동기록된다. 또한 CCTV 의동작감지센서는출입인원이있을경우자동녹화, 저장되어자원저장실관리를효율적으로할수있는데큰도움이될것으로보인다. [ 특화자원교육실시 ] 원광대학교병원인체자원단위은행은 2014 년특화자원으로당뇨질환을선정하였다. 이에특화자원에관한직원역량강화를위해원광대학교병원내분비대사내과이대호교수를초청, 특화자원에대한교육을실시하여당뇨질환에대한기본지식을습득하는자리를마련하였다. 위교육을통해인체자원단위은행실무자들은해당특화자원에대한중요한임상정보내용을습득하여, 조금더전문화된형태로고품질의특화자원을생산 관리할수있는기반을만들어갈것으로기대된다. 08 KBN News Letter