1 EBM/SRs 논문작성 EMBASE 검색완전정복 SR 논문작성을위한 EMBASE 검색족집게정보 Presented By 김혜령, 엘스비어코리아 Email: he.kim@elsevier.com
2 목차 지금 PUBMED 를검색하고있는데, EMBASE 를꼭검색해야할까요? EMBASE VS PUBMED (MEDLINE) Part I. 정보검색전략수립 1. 선행연구조사, 연구주제탐색, 검색전략수립 2. 연구주제 PICO Question 설계예시 3. EMTREE 를이용해서연구주제어정의 / 검색동의어확장하기 4. 최종검색전략 PICO 수립 Part 2. EMBASE 검색 & 필수개념!! 1. 검색범위 ( 관련성넓고많은문헌 VS 관련성깊고적은문헌 ) 2. 필수검색연산자 Part 3. 결과관리기능 1. 검색식저장관리 / 편집 / 최신정보업데이트설정 2. 검색결과반출하기 3. 원문보기 Part 4. 검색초보자 / 전문가를위한 5 분완성 PICO 기능 EMBASE 만의 EBM/SRs 문헌검색기능
지금 PUBMED 를검색하고있는데, EMBASE 를꼭검색해야할까요? EMBASE VS PUBMED (MEDLINE) The Cochrane Handbook 에서는 High-Quality Systematic Review 를위해 MEDLINE 과 EMBASE 모두검색할것을권장합니다. 1. 컨테츠양및검색결과양 ( content coverage) 2. 색인통제어휘 (Browsing Thesaurus)
4 PubMed 컨텐츠 미국국립의학도서관 (NLM) 에서구축한의학논문서지 DB 로 MEDLINE 무료검색도구 MEDLINE : 1879 년도부터 NLM 에서권위있는의학학술지를선정하여논문을색인한후 DB 로구축 1946 년부터현재까지 2,500 만건이상의 Citation 포함 PubMed 25,000,000 건 PubMed 에서 MEDLINE 비율 약 91% MEDLINE 21,300,000 PMC 3,700,000 건 PMC : PubMed Central 생의학분야무료아카이브
5 EMBASE 컨텐츠 Over 8,500 Journals/31 Million Records! Embase 2,800 journals not available on MEDLINE MEDLINE 91% of PUBMED PMC 3,700,000 건 Embase Much more coverage of non-english content and RCTs/ controlled clinical trials Cochrane reviews and meta-analyses Q: PMC 저널을 EMBASE 에서바로확인가능한가요? Embase Unique 5.9m records 2800 journals over 2+M conference abstracts from +5,500 conferences Since 2009 In Press (unpublished) Embase & Medline 11.8M 3,000 Medline on Embase 8.3M 2,500 Embase is Internationally Recognized and Recommended
6 MEDLINE 의 MeSH Medical Subject Headings 의약어로, 미국국립의학도서관 (NLM) 에서만든통제어휘시소러스 색인전문가들이통일성있는용어로논문주제를색인함으로써, 저자마다다양하게표현하지만동일한개념을누락없이검색 하나의논문에는평균 8-15 개의 MeSH 용어가주어지며, 그중그논문의내용을대표하는용어는 * 로표시 학술지에논문투고시국제의학학술지편집인협의회 (International Committee of Medical Journal Editors: ICMJE) 에서도논문저자키워드를 MeSH 에의해작성하도록규정
7 EMBASE- Emtree 1. Life Science 분야의통제어휘시소러스 2. 75,488 개이상의우선어 (+31,000 개약물우선어 ) 와 310,000 개이상의동의어 (186,000 약물동의어포함 ) - Medline (ca. 27,000 개우선어 /8,800 약물우선어 ) 3. 모든 MeSH 용어포함및 23,000 개이상의 CAS registry number 4. 모든약물 (31,000 개이상의 generic drugs, 화학명, 상품명포함 ) 및화학물질정보는 Emtree 에포함 (FDA, EMEA and WHO) 5. 3,000 이상의일반및의료장비용어와 (e.g. endoscopes, catheters, prostheses) medical procedures 와연관된수천가지용어 (e.g. endoscopy, catheterization) 6. 최신약물, 질병, organisms and procedures 는 Medline 과비교해연간 3 배이상추가색인됩니다. (with back-posting of older records). 7. 신약용어는 Emtree 에먼저업데이트됩니다. 8. 모든약물, 제너릭네임포함 (described by FDA and EMA, all International Non- Proprietary Names (INNs) described by WHO from 2000) Medline 보다훨씬많은약물우선어, 동의어포함 PubMed 대비평균 74% 더많은 reference 정보 PubMed 만을이용시 25% 이상의 Clinical Trial Data missing
8 MeSH 검색 VS. 자연어검색 매핑된 MeSH Term 으로검색결과 2,113 건으로 ( 자연어검색시 3,947 건 ) 좀더주제에맞는논문이검색되는것을확인!!
9 EMBASE 검색, Emtree VS. 자연어검색 매핑된 Emtree Term 으로검색결과 4,891 건으로 ( 자연어검색시 7,446 건 ) 좀더주제에맞는논문이검색되는것을확인!!
10 MORE 약물정보 MORE COMPREHENSIVE COVERAGE IN EMBASE VS PUBMED Product name Search term Emtree Preferred term MeSH Preferred term or Substance name Records (2007 March 2014) MEDLINE Embase Lipitor Atorvastatin Atorvastatin 6,220 24,410 Plavix Clopidogrel Clopidogrel 9,059 35,946 Advair Fluticasone propionate plus salmeterol Fluticasone, salmeterol drug combination 322 2,300 Oxycontin Oxycodone Oxycodone 2,041 10,289 Abilify Aripiprazole Aripiprazole 2,397 8,649 Singulair Montelukast Montelukast 1,760 6,382 Seroquel Quetiapine Quetiapine 3,426 15,570 Crestor Rosuvastatin Rosuvastatin 2,106 8,201 Cymbalta Duloxetine Duloxetine 1,652 6,426 Online study conducted on 12 March 2014, on Embase (www.embase.com) and MEDLINE (via PubMed). 10
11 MORE 비영어 (non-englsih) 컨텐츠포함 : SRs Language Embase (per year) * MEDLINE (per year) * Unique in Embase English ** 877,186 (90%) 664,207 (92%) 213,000 Chinese 27,861 (2.9%) 11,523 (2.2%) 16,300 German 17,051 (1.7%) 7,421 (1.0%) 9,600 French 13,491 8,469 5,000 Spanish 12,582 6,839 5,700 Japanese 7,762 5,761 2,000 Russian 6,275 6,094 200 Portuguese 4,918 3,560 1,400 Polish 3,479 1,791 1,700 Turkish 3,264 545 2,700 Italian 2,880 1,522 1,400 Dutch 2,618 899 1,700 Czech 1,557 (0.16%) 585 (0.08%) 1,000
12 MORE 무작위대조군연구보고서 (RCTs) Embase 는 SRs 에서중요한연구 SR 에대한중요한연구유형인무작위대조군연구보고서 RCTs 를 MEDLINE 보다많이제공하며, 특히영어이외의언어로자료를제공합니다. Language Embase on Elsevier MEDLINE on Ovid Embase Advantage Percent Turkish 613 75 538 717% Korean 134 46 88 191% Portuguese 712 442 270 61% Dutch 606 442 164 37% Chinese 5366 3945 1421 36% Polish 491 434 57 13% Spanish 2316 2137 179 8% French 3952 3904 48 1% German 8393 8566-173 -2%
Part I. 정보검색전략수립 1. 선행연구조사, 연구주제탐색, 검색전략수립 - 선행연구에서검색방법및검색툴참고하기 - 선행연구에서검색식조합및연구주제어참고하기 2. 연구주제 PICO Question 설계예시 3. EMTREE 를이용해서연구주제어정의 / 검색동의어확장하기 4. 최종검색전략 PICO 수립
14 검색전략수립 특이도검색 부적절한문헌을배제할가능성 지식을위한문헌검색 특정문제에대한중요논문포함 주된용도 - Focused Searching - 근거중심진료를위한검색 민감도검색 적절한문헌을찾을가능성 연구를위한문헌검색 해당연구논문모두포함 주된용도 - 체계적고찰 - 논문쓰기 - 연구계획서쓰기 - 임상진료지침개발 철저한검색을원하거나실제검색에서원하는내용을찾지못했다면민감도검색, 많은검색결과없이몇개의좋은논문을찾고자한다면특이도검색을수행한다 14
15 특정임상문제에대한중요논문검색 검색예 : Stroke( 뇌졸중 ) 환자의재발을방지하기위해사용되는항응고제 Warfarin 의약물부작용
16 1. 선행연구검색 선행연구에대한개요빠른검색 특정 Cochrane review or systematic review 에서연구전략참고 검색예 : 제 2 형당뇨환자 (Type 2 Diabetes Mellitus Patients) 의생활습관개선 (Drug therapy) 에따른당화혈색소 (HbA1c, glucose level) 조절결과
선행연구참고하기 17
18 선행연구참고 검색된이미출판된 Cochrane review or systematic review 에서검색전략을참고합니다. 검색전략에서 적용을위해연관성을평가합니다. 필요하면, 검색식을해석참고합니다. 사용된색인용어 (indexed terms), 자유어 ( free-text terms) 를참고합니다. 주제어변경등
19 PICO 검색전략 PICO 는문헌검색에서특정의학적인문제에대해더많은사례 ( 증거 ) 를기반으로판단할수있도록사례 ( 증거 ) 문헌을수집하는검색전략입니다. P = Patient AND I = Intervention AND C = Comparison/control AND O = Outcome 문제에대해 4 가지요소의조합결과 The PICO Framework (Sackett et al, 1997) Study hedge 는무작위대조실험 (RCTs), 체계적인리뷰및메타분석등다양한검색유형에서진단, 예방, 예후및치료등과같은임상개념을검색합니다.
20 2. 연구주제 PICO Question 설계예시 Question Type Treatment (Therapy) 치료 Patient or Problem Intervention Comparison Outcome 환자의질병 (disease) 이나상태 (condition) (e.g., diabetes mellitus, constipation or meningitis) 치료방법 (e.g., drug, surgery or lifestyle modification) 대체치료방법혹은 placebo ( 표준치료 ) 예 ) 사망 (mortality) 생산성 (productivity), 통증 (pain), 장애 (disability) 혹은고용 (employment) Prevention 예방 환자위험요인또는전반적인건강상태 예방법 (e.g., drug or lifestyle modification) May not be applicable 예 ) 병상태 (morbidity), 사망 (mortality), 통증 (pain), 장애 (disability) Diagnosis 진단 대상질환또는상태 진단검사나절차 문제에대한현재의기준 / 표준시험 검사유용성의측정 (e.g., sensitivity, specificity or odds ratio) Prognosis (natural history) 예후 Etiology or harm (causation) 위험요인 예후 (Prognosis) Usually time, sometimes 임상문제의심각도 (severity) expressed as 및지속시간 (duration) watchful waiting 환자위험요인, 현재질병상태, 전반적인건강상태 위험인자의강도 ( 도즈 ) 의 indication 과노출기간을포함하여인자개입 Usually not applicable. watchful waiting 의경우표준치료식별 May not be applicable 예 : 생존율, 사망률이나질병의진행속도 예 ) 질병발병율, 질병의진행속도, 혹은사망율 Adapted from http://libguides.mssm.edu/ebm/ebp_pico
3. EMTREE 를이용해서연구주제어정의 / 검색동의어확장하기 21
22 4. 최종검색전략 PICO 수립 검색예 : 제 2 형당뇨환자의생활습관개선에따른당화혈색소 (HbA1c) 조절결과 Population Intervention Comparator Outcome Type / Methods 진료환경 (Healthcare setting) 외래 제 2 형당뇨병환자 당뇨병치료제처방 생활습관개선 당화혈색소조절목표도달 RCT, Meta-analysis, Systematic review, Cohort, Prospective Type 2 Diabetes Mellitus Patients - Diabetes/ Glucosuria/Glycosuria - Insulin dependent diabetes - Non- insulin dependent diabetes Drug therapy - Medication therapy management - Prescription drug* - Performance enhancing substance* - Controlled substance* Modified Life style lifestyle modification/ Diabetic diet/diet restriction/ exe rcise therapy HbA1c Control - blood glucose level, blood sugar lowering, - Glycated hemoglobin - Improved management of glucose levels - managing diabetes /antidiabetic effect/ - clinical effectiveness/ Comparative effect/therapy effect RCT, Meta-analysis, Systematic review, Cohort, Prospective Ambulatory
Part 2. EMBASE 검색 & 필수개념!! 1. 검색범위 ( 관련성넓고많은문헌 VS 관련성깊고적은문헌 ) 2. 필수검색연산자 3. Embase 검색식 = Medline 검색식 4. 검색예데모시연 5. 알아두면유용한검색필터기능들 특정언어문헌 / 특정소스문헌
24 1. 검색범위지정 검색예 )
25 Embase 검색범위 ( 검색용어의범위 ) Embase 검색옵션설명 PubMed 검색옵션 Map to preferred term in Emtree Search also as free text in all fields Explode using narrower Emtree terms Search as broadly as possible Limit to terms indexed in article as major focus 우선어와동의어를입력시자동으로인식되어우선어동의어동시검색예 ): myocardial infarction, heart attack 은 heart infarction 로매핑검색 검색범위를지정하지않을경우자유어로 all fields 로검색이진행됨 검색어가모든필드에서자유어 (free text search) 로검색되어짐 title, abstract, Key words, idex terms, 소속등. Emtree 하위용어까지확장검색 최대한넓게검색 / 위모든조건들모두포함하며검색어를 AND 연산자로분리하여검색, 검색어들간에 OR 검색실행예 ) heart attack -> 'heart'/exp OR heart AND attack 논문중에서가장중요한 main topic 을 Indexer 가부여이옵션을선택하면용어색인이있지만아이클에서주요주제어로간주되지않는모든기록은제외되며, 이옵션을해제하면, 검색은아티클내에서주요주제어가아닐지라도검색어로인덱스된레코드가검색이됩니다. Automatic term mapping All fields 검색 Mesh explode Automatic term mapping Mesh major topic
자주이용하는 EMBASE 검색범위 field 26
PUBMED 검색 field 27
28 2. 다양한검색연산자 - Search tips 부울린연산자 Boolean operators AND depression AND tricyclic 단어나구를모두레코드에있는경우 OR elderly OR geriatric OR aged 적어도하나의단어나문장은레코드에있는경우 NOT depression NOT tricyclic NOT 전에단어문구가레코드에있고 NOT 뒤에단어나구문은제외 복잡한단일검색에서괄호를사용하고여러연산자를결합하여사용 (aged OR elderly OR geriatic) AND (depression OR insomnia) 인접검색 Proximity operators NEAR/n drug* NEAR/2 adverse n 개의단어내에있어야합니다 NEXT/n adverse NEXT/2 reaction* 동일한순서로 n 개의단어내에있어야합니다 근접및부울연산자를결합하여보다복잡한단일검색을만들기위해괄호를사용 clinical NEXT/2 (application* OR trial) NEAR/10 biomarker* NEAR/10 (treatment OR disease) (adverse OR side OR undesirable) NEXT/2 (effect* OR reaction* OR event* OR outcome*)
29 2. 다양한검색연산자 - Search tips 구문검색 (Phrase search) 'heart attack' "heart attack" heart-attack 구문에서단어를따옴표또는하이픈으로연결하지않으면, Emtree term 혹은자유어 ( free text) 로인식하여각단어를 AND 로검색진행예 ) heart attack 'heart'/exp OR heart AND attack. 예 ) 'heart infarction' AND clinical NEXT/2 (trial OR study) 절단자 Truncation/Wildcards * 하나이상의문자를대체? 단일문자절단 sul*ur 'heart attack*' sulf?nyl catheter? 결과 : sulfur, sulphur 결과 heart attack, heart attacks 결과 'sulfonyl' and 'sulfinyl 와같은단어포함 결과 'catheters 검색 'catheter' or 'catheterization 검색안됨 Note: * 로절단하기전에적어도세개의문자를입력 Wildcard + field 조합 : 예 ) sul*ur:ti:ab? + field 조합은지원하지않음 ( 예 : sulf?nyl:ab:ti) 구문내에서절단문자 ( 와일드카드 ) 를사용 : heart infarct* or "metabol* disorder*" Wildcard * 2 단어미만이문자로사용할수없음 : 예 ) "m* disorder" or "metabol* d*"
30 PubMed, Cochrane 검색식 = EMBASE 검색식 Database Thesaurus Search Result EMBASE Emtree 'digoxin'/exp AND 'anti bacterial agents'/exp 10,103 PubMed MeSH (Digoxin[MeSH Terms]) AND ("Anti-Infective Agents"[Mesh] OR "Anti- Infective Agents" [Pharmacological Action]) 417 ((exercise* or fitness) adj3 (treatment or intervent* or program*)).tiab. ((exercise* OR fitness) NEAR/3 (treatment OR intervent* OR program*)):ab,ti adj3= NEXT/3 or NEAR/3 로, tiab = title / abstract
31 검색예 : 'heart infarction' AND clinical NEXT/2 (trial OR study) clinical NEXT/2 (application* OR trial) NEAR/10 biomarker* NEAR/10 (treatment OR disease) (adverse OR side OR undesirable) NEXT/2 (effect* OR reaction* OR event* OR outcome*) ((exercise* or fitness) adj3 (treatment or intervent* or program*)).tw ((exercise* OR fitness) NEAR/3 (treatment OR intervent* OR program*)):ab,ti adj3= NEXT/3 or NEAR/3 로, tiab = title / abstract
32 EMBASE 고급검색 검색범위지정및검색연산자결합하기 검색예 : 아토피피부염환자에게면역치료와국소치료 / 스테로이드의결과비교
33 PubMed Advanced Search 특정필드검색및결합하기 AND, OR, NOT 연산자선택 여러필드를조합하여검색식만들기 특정필드에있는키워드만검색
34 34 다양한검색연산자사용비교 1. 다양한관련용어를사용한검색 Emtree / 연구자의전문지식 / 경험에서용어의이해와선택 2. 검색범위지정 넓은검색부터좁은검색 3. 다양한 truncation (*), phrase 구성, AND/ NEAR/ OR/ NEXT 조합구성 4. 연구자의 Try/ Error 를통한검색결과비교수정반복
35 알아두면유용한검색필터들 특정언어문헌만골라보기 35
PubMed_ 본문언어구분 / 원문보기 본문의언어가루마니아어. 본문의언어가영어가아닌논문은아티클제목에각괄호 36
37 알아두면유용한검색필터들 소스문헌골라보기 37
Part 3. 결과관리기능 1. 검색식저장관리 / 편집 / 최신정보업데이트설정 2. 검색결과반출하기 3. 원문보기
39 검색식저장 / 편집하기최신정보와자동결과관리 Export, 인쇄또는공유결과 - RIS, 텍스트또는 CSV 를포함하는형식으로반출 자동으로새로운검색결과를받기위해 email alert 를등록
40 검색식저장관리 (saved search) 저장된검색, Rerun 재검색 최신업데이트정보관리 / email alert 등록최신업데이트자동수신
41 검색결과반출 10,000 건까지선택내보내기가능 10,000 건이상인경우 10,000 건씩선택후순차적으로내보내기진행
42 도서관로그인후이용 원문 (full-text) 보기 - 도서관에서구독하고있는원문저널원문바로보기연동 - 구독하지않는원문저널은출판사홈페이지로연동 논문작성지원 - EndNote 로반출하기 - Refworks 로반출하기 - Mendelay 로반출하기 - Scopus 수록정보보기 42
Part 4. 검색초보자 / 전문가를위한 5 분완성 EMBASE 만의 EBM/SRs 문헌검색기능 PICO 기능 Demo
44 44 PICO search form ❶ Search 메뉴에서 PICO 를선택합니다. ❶
45 45 PICO search form: 검색어입력창활용하기 ❷ 페이지의왼쪽에, Find best term' 에서키워드를입력하고제안된목록에서조건중하나를선택합니다. ❷
46 46 PICO search form: 검색옵션설정 ❹ 입력된검색용어는기본값으로 broadly as possible 로검색이됩니다. 다른검색옵션은오렌지색창에서화살표를클릭하여목록에서다른검색옵션을클릭합니다. index term, major focus explosion search broad as possible ❹
47 47 PICO search form: 동의어설정 ❺ Emtree 용어가추가되면, 회색창이오렌지색창옆에표시됩니다. 회색창을클릭하면, 쿼리해당용어의모든동의어가표시되며, 개별동의어를패널에서버튼을클릭하여선택추가혹은제외할수있습니다. 기본적으로는 all fields 로모두포함하기로설정됩니다. ❺ ❺
48 48 PICO search form: 검색필드설정 ❻ 추가된동의어는기본적으로모든분야에서검색됩니다. Free-text term 이검색되는필드를변경하려면드롭다운화살표를클릭하여변경합니다. 모든필드검색하기는제목 (titles), 초록 (abstracts), 저자키워드 (Keywords), brand name, manufacturer name 등에서모두검색 ❻
49 49 PICO search form: 검색결과 # 의표시 EMBASE 는자동으로개별 PICO 요소내에용어들사이를 OR ( 부울연산자 ) 로추가합니다. 다른 PICO 들요소사이 'AND' 연산자로검색어 / 전략들을결합합니다. ❶ PICO 검색어들의입력을통해검색이진행하는동안실시간으로 EMBASE 결과의개수를계산하고, 페이지의아래쪽오른쪽코너에결과개수를표시합니다. ❷ Show # results 선택해서검색수행및결과를봅니다. ❶❷ More information is available in the Help file: http://help.elsevier.com/app/answers/detail/a_id/4635/p/7794
50 50 PICO search form: 검색어추가입력하기 ❶ 용어는검색입력라인어디에나추가될수있습니다. 어느용어의앞이나뒤에커서를놓고, 새로운용어나괄호를추가입력합니다. ❷ 다르게는, 검색질문의적절한위치에커서를위치시키고그위치에용어를추가하는페이지좌측 Emtree 에서용어를선택해서추가합니다. ❷ ❶
51 51 PICO search form: 검색어편집수정 / 제거하기 ❶ 토큰을더블클릭하거나검색어를편집하거나수정하는플라이아웃메뉴에서 Edit Token' 버튼을선택합니다. ❶ ❷ 토큰의앞이나뒤에서키보드의 Delete 키를누르거나, Remove Token. 을선택하거나확대를통해토큰을제거합니다. ❷
52 Question components P Patient or Population Describe the most important characteristics of the patient (e.g.-age, disease/condition, gender) I- Intervention Prognostic factor, Exposure Describe the main intervention (e.g.-drug or other treatment, diagnostic/screening test) Your question Neoplasm Staging Breast Neoplasms Mastectomy, Modified Radical C-Comparison (if appropriate) Describe the main alternative being considered (e.g. placebo, standard therapy, no treatment, the gold standard) Mastectomy, Segmental O-Outcome Describe what you re trying to accomplish, measure improve, affect. (e.g.- reduced mortality or morbidity, improved memory, accurate and timely diagnosis) Survival Analysis Survival Rate Disease-Free Survival Mortality The well-built clinical question: 조기유방암에서변형근치적절제술과보존술은장기생존률에차이가있는가?
편리한 PICO 검색어입력및검색수식조합 53
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