저작자표시 - 동일조건변경허락 2.0 대한민국 이용자는아래의조건을따르는경우에한하여자유롭게 이저작물을복제, 배포, 전송, 전시, 공연및방송할수있습니다. 이차적저작물을작성할수있습니다. 이저작물을영리목적으로이용할수있습니다. 다음과같은조건을따라야합니다 : 저작자표시. 귀하는원저작자를표시하여야합니다. 동일조건변경허락. 귀하가이저작물을개작, 변형또는가공했을경우에는, 이저작물과동일한이용허락조건하에서만배포할수있습니다. 귀하는, 이저작물의재이용이나배포의경우, 이저작물에적용된이용허락조건을명확하게나타내어야합니다. 저작권자로부터별도의허가를받으면이러한조건들은적용되지않습니다. 저작권법에따른이용자의권리는위의내용에의하여영향을받지않습니다. 이것은이용허락규약 (Legal Code) 을이해하기쉽게요약한것입니다. Disclaimer
印 印 印
- i -
- ii -
- iii -
- iv -
- v -
- 1 -
- 2 -
- 3 -
- 4 -
- 5 -
- 6 -
종류 최상위 EC 번호 설명 개수 1 산화환원효소 164,330 2 전이효소 128,182 효소 3 가수분해효소 92,716 4 탈탄산효소 34,884 5 이성질화효소 23,223 6 합성효소 34,261 7 수용체 27,238 8 통로 5,904 9 포린 2,533 비효소단백질 10 독소 1,588 11 운반체 71,452 12 DNA 결합단백질 6,659 13 RNA 결합단백질 3,186 596,156-7 -
- 8 -
아미노산잔기 표면부분의아미노산잔기 일반적속성 알라닌 알라닌 아미노산잔기의수 아르기닌 아르기닌 단백질총면적 아스파라긴 아스파라긴 표면프랙탈차원 아스파르트산 아스파르트산 이황화결합 시스테인 시스테인 표면적과부피의비 글루타민 글루타민 2차구조 글루탐산 글루탐산 나선구조 글리신 글리신 병풍구조 히스티딘 히스티딘 회전구조 이소류신 이소류신 보조인자 류신 류신 ATP 리신 리신 NAD 메티오닌 메티오닌 FAD 페닐알라닌 페닐알라닌 금속 프롤린 프롤린 철 세린 세린 마그네슘 트레오닌 트레오닌 구리 트립토판 트립토판 칼슘 타이로신 타이로신 발린 발린 - 9 -
종류 최상위 EC 번호 설명 단백질서열의개수 1 산화환원효소 13,929 2 전이효소 30,714 효소 3 가수분해효소 21,817 4 탈탄산효소 7,618 5 이성질화효소 4,473 6 합성효소 9,667 비효소단백질 해당사항없음 15,936 104,154-10 -
- 11 -
- 12 -
- 13 -
특징번호 특징종류 설명 1 Ala_ratio 서열길이에대한알라닌의백분율 2 Cys_ratio 서열길이에대한시스테인의백분율 3 Asp_ratio 서열길이에대한아스파르트산의백분율 4 Glu_ratio 서열길이에대한글루탐산의백분율 5 Phe_ratio 서열길이에대한페닐알라닌의백분율 6 Gly_ratio 서열길이에대한글리신의백분율 7 His_ratio 서열길이에대한히스티딘의백분율 8 Ile_ratio 서열길이에대한이소류신의백분율 9 Lys_ratio 서열길이에대한리신의백분율 10 Leu_ratio 서열길이에대한류신의백분율 11 Met_ratio 서열길이에대한메티오닌의백분율 12 Asn_ratio 서열길이에대한아스파라긴의백분율 13 Pro_ratio 서열길이에대한프롤린의백분율 14 Gln_ratio 서열길이에대한글루타민의백분율 15 Arg_ratio 서열길이에대한아르기닌의백분율 16 Ser_ratio 서열길이에대한세린의백분율 17 Thr_ratio 서열길이에대한트레오닌의백분율 18 Val_ratio 서열길이에대한발린의백분율 19 Trp_ratio 서열길이에대한트립토판의백분율 20 Tyr_ratio 서열길이에대한타이로신의백분율 - 14 -
특징번호 특징종류 설명 21 Ala 서열내에알라닌의개수 22 Cys 서열내에시스테인의개수 23 Asp 서열내에아스파르트산의개수 24 Glu 서열내에글루탐산의개수 25 Phe 서열내에페닐알라닌의개수 26 Gly 서열내에글리신의개수 27 His 서열내에히스티딘의개수 28 Ile 서열내에이소류신의개수 29 Lys 서열내에리신의개수 30 Leu 서열내에류신의개수 31 Met 서열내에메티오닌의개수 32 Asn 서열내에아스파라긴의개수 33 Pro 서열내에프롤린의개수 34 Gln 서열내에글루타민의개수 35 Arg 서열내에아르기닌의개수 36 Ser 서열내에세린의개수 37 Thr 서열내에트레오닌의개수 38 Val 서열내에발린의개수 39 Trp 서열내에트립토판의개수 40 Tyr 서열내에타이로신의개수 특징번호 특징종류 설명 41 음전하를띈아미노산잔기의백분율 Percentage_of_neg_charged 아스파르트산과글루탐산개수의합을 _residue 서열길이로나눈값 42 양전하를띈아미노산잔기의백분율 Percentage_of_pos_charged 아르기닌과리신개수의합을서열길 _residue 이로나눈값 - 15 -
특징번호 특징종류 설명 43 num_of_c 서열내탄소원자의개수 44 num_of_h 서열내수소원자의개수 45 num_of_n 서열내질소원자의개수 46 num_of_o 서열내산소원자의개수 47 num_of_s 서열내황원자의개수 특징번호 특징종류 설명 48 Aliphatic_Index 단백질구조의지방족곁사슬에의한단백질의상대적인크기 49 Extinction_Coefficient 단백질의특정파장의빛흡수도 50 GRAVY 단백질의상대적소수성수치의평균 51 Instability_Index 시험관내수용액에서의단백질의안정성 52 Theoretical_pI 이론적등전점 53 Molecular_Weight 단백질의분자무게 54 Hydrophobic_Ratio 상대적소수성의비율 55 Solubility 단백질의물에녹는정도의수치 - 16 -
특징번호 특징종류 설명 아스파르트산, 글루탐산, 히스티딘, 56 Polar 리신, 아스파라긴, 글루타민, 아르기닌, 세린, 트레오닌, 트립토판, 타이로신의 개수의총합 57 Aliphatic 이소류신, 류신, 발린의개수의총합 58 Aromatic 페닐알라닌, 히스티딘, 트립토판, 타이로신의개수의총합 59 Small 알라닌, 글리신, 세린, 트레오닌의개수의총합 60 Tiny 알라닌과글리신개수의총합 61 Bulky 페닐알라닌, 히스티딘, 아르기닌, 트립토판, 타이로신개수의총합 62 Hydrophbic 이소류신, 류신, 메티오닌, 발린개수의총합 63 Acidic 글루탐산과아스파르트산개수의총합 - 17 -
특징번호 특징종류 설명 64 PPR 양전하를띈아미노산잔기뒤에양전하를띈아미노산잔기가나타나는비율 65 NNR 음전하를띈아미노산잔기뒤에음전하를띈아미노산잔기가나타나는비율 66 PNPR 양전하를띈아미노산잔기뒤에음전하를띈아미노산잔기가나타나거나, 음전하를띈아미노산잔기뒤에양전하를띈아미노산잔기가나타나는비율 67~76 PPR_DIST 서열의길이를 10등분하였을때각구간마다의 PPR 값 77~86 NNR_DIST 서열의길이를 10등분하였을때각구간마다의 NNR 값 87~96 PNPR_DIST 서열의길이를 10등분하였을때각구간마다의 PNPR 값 97 HHR 98 HNR 99~108 HHR_DIST 109~118 HNR_DIST 소수성아미노산잔기뒤에소수성아미노산잔기가나타나는비율소수성아미노산잔기뒤에소수성이아닌아미노산잔기가나타나거나, 소수성이아닌아미노산잔기뒤에소수성아미노산잔기가나타나는비율서열의길이를 10등분하였을때각구간마다의 HHR 값서열의길이를 10등분하였을때각구간마다의 HNR 값 - 18 -
- 19 -
종류 최상위 EC 번호 설명 개수 1 산화환원효소 7,775 2 전이효소 12,952 효소 3 가수분해효소 9,053 4 탈탄산효소 3,661 5 이성질화효소 2,594 6 합성효소 3,901 7 수용체 5,328 8 통로 1,301 9 포린 516 비효소 10 독소 1,684 11 운반체 2,654 12 DNA 결합단백질 754 13 RNA 결합단백질 450 52,623-20 -
- 21 -
서열길이 HSP 길이 Positives Identities HSP 길이서열길이 1.0 서열길이 P ositives 서열길이 Identities 서열길이 HSP 길이 HSP 길이 서열길이 P ositives 1.0 HSP 길이 Identities HSP 길이 Positives Positives 서열길이 Positives HSP 길이 Identities 1.0 P ositives Identities Identities 서열길이 Identities HSP 길이 Identities Positives 1.0-22 -
1.00 0.90 0.72 0.54 서열길이 : 100 0.90 1.00 0.80 0.60 HSP 길이 : 90 0.72 0.80 1.00 0.75 Positives: 72 0.54 0.60 0.75 1.00 Identities: 54 a) 질의서열 1과결과서열 1의유사도검색파라미터 1.00 0.50 0.40 0.30 서열길이 : 100 0.50 1.00 0.80 0.60 HSP 길이 : 50 0.40 0.80 1.00 0.75 Positives: 40 0.30 0.60 0.75 1.00 Identities: 30 b) 질의서열 2와결과서열 2의유사도검색파라미터 - 23 -
- 24 -
å n å å d1 d2 d1 n n n d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 n d1 n n d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 n n d1 n d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 a) 첫번째조합 b) 두번째조합 c) 세번째조합 d2 d2 d2 d1 d1 n n d1 n d1 n d2 d2 d2 d1 d1 n n d2 d2 d2 d2 d2 d2 d2 d1 n d1 n n n n d1 d2 d2 d2 d2 d) 네번째조합 e) 첫번째조합 f) 두번째조합 d1 n n d1 d2 d2 *a) 부터 d) 까지는파라미터하나와나머지셋의조합 d2 d2 e) 부터 g) 까지는두파라미터와나머지둘의조합 d1 n n d1 g) 세번째조합 - 25 -
- 26 -
맞은개수틀린개수총합정확도 47,501 5,122 52,623 90.27% - 27 -
YES 집합 NO 집합 정확도 6.2 이상 33,567 1,467 95.81% 6.2 미만 13,934 3,655 79.22% 총합 47,501 5,122 90.27% 6.2 이상백분율 70.67% 28.64% 6.2 미만백분율 29.33% 71.36% - 28 -
산화환원효소 개수 전이효소 개수 탈탄산효소 개수 1.1 587 2.1 561 4.1 363 1.2 308 2.2 83 4.2 464 1.3 296 2.3 618 4.3 99 1.4 111 2.4 402 4.4 32 1.5 108 2.5 334 4.6 45 1.6 204 2.6 161 4.99 22 1.7 48 2.7 2,216 이성질화효소 개수 1.8 133 2.8 89 5.1 185 1.9 73 2.9 10 5.2 133 1.10 31 가수분해효소 개수 5.3 179 1.11 120 3.1 1,134 5.4 263 1.12 14 3.2 364 5.5 10 1.13 26 3.3 12 5.99 83 1.14 104 3.4 454 합성효소 개수 1.15 45 3.5 583 6.1 364 1.16 42 3.6 722 6.2 80 1.17 57 3.7 10 6.3 615 1.18 23 3.8 7 6.4 33 1.20 21 3.11 29 6.5 47 1.97 28 6.6 19-29 -
번호단백질개수 7번 수용체 915 8번 통로 329 9번 포린 158 10번 독소 1,511 11번 운반체 977 12번 DNA 결합단백질 238 13번 RNA 결합단백질 257-30 -
YES 집합 NO 집합 임계값이상 437 10 임계값미만 137 44-31 -
YES 집합 NO 집합 임계값이상 11 5 임계값미만 13 20-32 -
- 33 -
- 34 -
- 35 -
- 36 -
- 37 -
- 38 -
- 39 -