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현중 범
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1 임상병리와정도관리 : 제 24 권제 1 호 2002 J. Clin, Pathol. & Quality Control 2002:24: 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 조현찬 ( 집필대표 ) 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 대한임상검사정도관리협회진단유전학분과위원회 Annual Report on External Quality Assessment in Diagnostic Genetics in Korea (2001) Hyoun Chan Cho, Sun Hee Kim, Sung Sup Park, Hee Yeon Woo, Hye Shim Choi, Jae Seok Kim, Eui Chong Kim, Suk Ja Park, Jong Woo Park, Soon Pal Seo, Kyung Soon Song, Yu Kyung Lee, and Hyun Sook Chi Diagnostic Genetics Subcommittee, The Korea Association of Quality Assurance for Clinical Pathology, Seoul, Korea The importance of quality control for dramatically growing genetic tests continues to be emphasized with increasing clinical demands. Diagnostic genetics subcommitee of KSQACP performed two proficiency trials for cytogenetic study and one proficiency trial for molecular genetic tests in Cytogenetic surveys were performed by 32 laboratories and answered correctly in most laboratories except some problems in nomenclature and analysis for unbalanced whole arm translocation. Interpretation of special stain findings and fluorescent in situ hybridization (FISH) results has some problems to be improved. The proficiency trial for molecular genetic tests were molecular tests for genetic disorders including Huntington's disease(hd) and Leber Hereditary Optic Neuropathy(LHON), ABO genotyping, hematologic malignancies and infectious diseases including tuberculosis and hepatitis C. The trial materials for molecular tests were distributed to 52 laboratories and most of them revealed acceptable result except only small number of laboratories in HCV PCR. External quality assessment program for diagnostic genetics could be helpful to give participants many chances of continuous education and of interesting case materials. Key Words:External quality assurance, Cytogenetics, Molecular genetics 서 2001 년도세포유전검사의정도관리사업은예년과마찬가지로염색체검사에대해서 2회에걸쳐실시하였는데신빙도조사방법은예전과같은형식으로모두 10예의핵형분석 (karyotyping) 이었다. 특기할사항은보편적인 G- 분염법외에특수염색법과형광동소보합법 (fluorescence in situ hybridization, FISH) 을이용하여분석할수있는증례를처음으로제시하였다는점이다. 분자유전검사정도관리는 7 종의검사를대상으로전체회원기관에대해참가신청을조 교신저자 : 조현찬우 ) 서울시강동구길동 445 한림대학교강동성심병원임상병리과전화 :(02) , FAX:(02) 론 회하였고, 처음으로각기관별보고결과에대한기본적인평가를실시하였다. 재료및방법 I. 염색체검사 1) 실시방법 2001 년도에는 2회에걸쳐각각정도관리용사진을발송하여염색체검사의핵형분석에대한정도관리를실시하였다 년 7월에실시된첫번째염색체검사정도관리프로그램은 5예 (01CY-01, 01CY-02, 01CY-03, 01CY- 04, 01CY-05) 의핵형분석을위한것이었고증례마다환자의간단한임상정보와서로다른 5개의분열중기세포사진을보냈다. 01CY-05 의경우에는핵형분석도움이되는

2 128 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 FISH 기법의결과사진 2장도첨가하였다 년 12월에실시된두번째염색체검사정도관리프로그램도 5예 (01CY-06 01CY-07, 01CY-08, 01CY-09, 01CY-10) 의핵형분석위한것이었으며각증례에 5개의분열중기세포사진을보냈다. 01CY-07 의경우에는 DA/DAPI-banding, C-banding, AgNOR-banding 사진을첨가하였다. 각각의분열중기세포의사진은염색체배열을통한핵형분석이필요한기관을위해서같은사진을 2장씩보냈다. 검사결과보고는각검사실에서사용하는통상적방법으로분열중기세포를분석한후최종핵형결과를인체염색체명명법에대한국제규약즉, International System for Human Cytogenetic Nomenclature(ISCN) 1995의단축형에따라기술하도록하였다. 결과분석방법으로각검체에대한핵형을 M:Modal chromosome Number, S:Sex chromosome designation, A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature 와같은 M, S, A, N의네가지요소로서평가하였다. 이에대한각각의평가등급은, ꊱ, ꊲ, ꊳ 으로분류하였으며, 그기준은 :Not Graded, ꊱ: Good Performance, ꊲ:Acceptable Performance, ꊳ: Unacceptable Performance와같다. 이번 2001 년도부터는지난 5년간성적을바탕으로 4개기관의참고기관을선정하여따로분석하였고, 각검체에대한핵형의 target value 는 참고기관의 75% 이상및참여기관다수의의견일치 가있는경우로정하였다. 적절한절단점으로인정하는기준은 two-band rule 를따랐는데이는최빈수의절단점으로부터 two-band 또는 twosubband 내에있는절단점만을인정한다는것이었다. 회신한핵형의명명법이 ISCN 1995 의원칙에벗어나는사항은결과요약지의의견란 (comments) 에기술되도록하였다. 2. 분자유전검사분자유전검사는다른검사에비해시행하는참여기관수가적고, 검체준비가비교적어렵다는특성을갖는다. 이에 2001 년에는대한임상검사정도관리협회참여기관을대상으로 2001 년분자유전검사의 7종검사를안내하고각종목별로참가신청을받았으며, 이렇게신청한기관에대해외부정도관리실태조사를진행하였다. 정도관리물질제조와준비는 Table 11과같고, 각기관의결과는검사방법, 검사결과및검사방법별검사결과를비교분석하였다. 또금년에처음으로각기관별보고결과에대하여두가지등급으로구분하는 (acceptable, unacceptable) 기본적인평가만실시하였다. 결과 1. 염색체검사 2001 년 7월에실시된제 1차염색체검사정도관리검체는 33개기관의검사실에발송하였고, 32개검사실로부터결과회신을받았다 년 12월에실시된제 2차염색체검사정도관리검체는 32개기관의검사실에발송되었고 31개검사실로부터결과를회신받았다. 검체별결과분석내용은 Table 1부터 Table 10과같다. 2. 분자유전검사각종목별참여기관수, 검사결과및다양한검사방법에따른분석은 Table 11부터 Table 14와같다. 설문조사는정도관리참여기관에대해 분자유전검사정도관리에포함하였으면하는검사 와 기타건의사항 에대한 2가지질문을했는데 16개기관에서회신이있었다 (Table 15). 고찰 1. 염색체검사 01CY-01 증례는불임환자로부터얻은말초혈액검체로서인체에서볼수있는유일한 recurrent, non- Robertsonian 선천성균형전좌형증례였다. 대부분의검사실에서 11번과 22번염색체간의균형전좌형을정확하게찾아내었다. 01CY-02 증례는 46,XY,inv(14)(q11.2q32)[3]/46, XY[2] 의핵형을보이는 peripheral T-cell lymphoma/ leukemia 환자로부터얻은골수검체인데다수의검사실이 14번염색체의역위형 (inversion) 을정확히검출하였으나일부검사실에서는다른염색체와의균형전좌형으로판독하거나종양세포의클론성정의에맞지않는명명법을사용하였다. 01CY-03 증례는 9p 미세결실증후군 (microdeletion syndrome) 환자의말초혈액검체로서핵형은 46,XX,del (9)(p22) 이었다. 이증례에서는미세결실증후군을발견할수있는능력과절단점을얼마나정확하게표기하는가를중점적으로평가하고자하였다. 32개기관중 21개기관에서미세결실을발견하였는데이는 2000 년도에제시되었던 Smith-Magenis 증후군 (00CY-03) 과비슷한결과로아직까지는많은검사실에서고정도분염법하에서특정염색체에초점을맞추어미세결실을검출하는기술적인훈련이필요할것으로사료되었다. 01CY-04 증례는항암치료와관련된 (therapy-related) 골수이형성증후군 (MDS) 증례로서핵형은 46,XY,+1,der (1;7)(q10;p10)[2]/46,idem,del(3)(q21)[2] /46,XY[1] 이었는데 1번과 7번염색체의전좌형외에 3번염색체장완의결실 del(3)(q21) 도추가된양상이었다. 이렇게복잡한핵형의증례를제시했던의도는비균형 (Unbalanced) non-robertsonian whole-arm translocation 을포함한복합적염색체이상의검출및명명법을

3 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 129 평가하는데그목적이있었다. 1번과 7번염색체재배열은 whole-arm translocation 으로판독한경우염색체절단점은 1q10 과 7p10 이며, 비정상 7번유도염색체 [der(7)] 로판독한경우염색체절단점은 1q11-1q22 와 7번염색체의동원체 (centromere) 를포함한경우를양호한 good 으로평가하였다. 비균형 whole arm translocation 을기술할때전좌형에관여된염색체중한염색체가 2개의정상염색체쌍으로존재하는경우그염색체의증가로해석해야하므로 +1로판독한다. 두개의세포분열중기세포에서는 del(3)(q21) 도같이보이고있었는데이처럼세포유전학적측면에서관련된세포군 (cytogenetically related clones) 들로존재하는경우세포군의크기와는관계없이 stemline clone 을제일먼저쓰고복잡성이증가하는순서로나열하지만이러한기준에맞추어기술하지못하여오답처리된기관이많았다. 01CY-05 증례는 Turner 증후군이의심되는환자로부터얻은말초혈액검체로서핵형은 46,X,psu dic(x;x) (p11.4;p11.23) 이었다. 참고기관의 75% 이상및참여기관다수의의견일치가이루어지지않아 recognition of abnormalities 와 karyotype nomenclature 의등급을평가하지못하였다 년도에는처음으로형광동소보합법 (FISH) 사진을첨가하였는데대부분의검사실에서는이러한 FISH 결과의의미를제대로파악하지못하여동완염색체 (isochromosome) 나이동원체성동완염색체 (isodicentric chromosome) 로판독하였다. 이는아직까지 FISH 검사를시행하지않는검사실이많다는점을고려할때그결과판독의능력도부족할것으로판단되었다. 01CY-06 증례는 46,X,t(X;10)(q13;p13) 을보이는원발성무월경환자인데각검사실마다해상도를기재하는방법의차이로인하여염색체절단점의표기내용은다양하였으나대부분의기관에서염색체이상을검출하였다. 01CY-07 증례는 15번염색체기원의 bi-satellited marker chromosome 이발견된것으로핵형은 47, XX, +psu idic(15)(q13) 이었다. 많은검사실이 15번염색체로부터기원하였다고는판독하였으나, 이동원체성 (dicentric) 혹은이동원체성동완 (isodicentric) 염색체로판독하여오답처리되었다 년도에는처음으로 3가지 (DA/DAPI, C-banding, AgNOR) 의특수염색사진을첨부하였으나특수염색법을이용하지않는기관에서는이에대한판독능력이부족하다는사실을확인할수있었다. 따라서검출한염색체이상에대한명명법교육훈련이더욱필요할것으로생각된다. 01CY-08 증례는소아의급성림프구성백혈병에서가장흔하게관찰되는염색체이상중의하나인 1번과 19번염색체의전좌형 t(1;19) 였다. 이성간 (sex-mismatched allogeneic) 골수이식한후추적검사중의검체로서비정상세포군과정상세포군의성염색체가달랐다. 이성간골수이식 후의검체라는정보를미리제공하지않았으므로, 비정상세포군에서 t(1;19) 와함께 X염색체의소실과함께 Y염색체의증가가있는것으로판독한결과도정답으로처리하였다. 염색체이상의절단점은항상검체의해상도에적합한 ISCN 1995 의 ideogram 의염색대를기준으로하므로 19p13 을절단점으로한핵형은양호한등급 good 으로평가하지않았다. 절단점지정은명명법판정시관찰되는가장흔한오류중의하나이므로 ISCN 1995 의 ideogram 을반드시참조하는것이중요하다. 01CY-09 증례는 21번염색체간의로버트손전좌형 21;21 Robertsonian translocation 을동반한 Down 증후군환자였다. 상당수의기관이 +21 없이 der(21;21) 로만판독하였고, 수적이상을구조적이상뒤에표기하여오답처리되었다. 01CY-10 증례는만성골수성백혈병환자로부터채취한골수검체로 2개의 Philadelphia 염색체 (double Ph) 가발견되었는데대부분의기관에서염색체이상을정확히검출하였다. 그러나역시상당수의검사실에서절단점표기의오류를보였다. 2. 분자유전검사가장대표적인미생물분자유전검사인결핵균과 HCV PCR 검사의경우각각 52, 41개기관이참여하여 1999 년의 36, 34개참여기관에비해많은증가를보였다. 이번실태조사에서는 7개종목을대상으로시행했는데처음으로 ABO genotyping과 Huntington's disease (HD), Leber Hereditary Optic Neuropathy (LHON) 검사를포함시켰다. 참가신청을한기관을대상으로신빙도조사를시행하면검체등의준비가쉬워지므로향후보다많은종목을시행할수있을것이다 년에는표 4의설문조사결과를반영하여훨씬다양한검사, 즉여러종류의분자미생물검사를추가할수있으리라판단된다 넌도분자유전검사정도관리는전체적으로우수한검사결과를보였는데, 가장많은기관이참여한결핵균 PCR 검사에서는단지 1개검체에서 1개기관만틀린결과였다. 그외백혈병검사, 유전질환검사는대부분양호한결과를보였다. 그러나 HCV PCR 의경우 1개검체는 41 개기관중 5개기관이오답을내었다. 검사방법은분자미생물검사의경우킷트사용이증가하고있었다. 결핵균 PCR 에서킷트사용기관의비율이 1999 년에비해 66% 에서 77% 로, HCV PCR 은 64% 에서 85% 로증가하였다. 이는일반적으로정도관리에도움이될것으로생각되나, 킷트의정확한검증이필요하다고하겠다 년에는분자유전검사정도관리사업을 6월과 11월 2회에걸쳐시행할계획이다. 분자미생물검사와유전질환검사에서종목수의추가를검토하고있다, 정도관리사업의효율적인진행을위해웹사이트 ( 를

4 130 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 이용한참가신청, 전자우편을이용한검사결과의접수및보고서전달등도현실화시킬예정이다결론및요약세포유전학검사분야인염색체검사신빙도조사는 2001 년에두차례에걸쳐총 10 증례에대하여실시되었다 년정도관리물질에는 FISH 사진과특수염색결과에도움을받아판독할수있는선천성염색체이상을보이는증례를포함시킴으로써여러가지세포유전검사법의적응증과의미, 판독법에대한교육이동시에이루어지도록노력하였다. 그결과다수의검사실에서양호한결과를보여주었으나, 아직까지는미숙한판독이여러검사실에서관찰되었다. 이러한문제점을해결하기위한검사자의재교육및정도관리등염색체검사실의질적향상에본프로그램의결과분석이기초자료로서유용하게사용될수있을것으로판단된다. 분자유전검사의참여기관은 2년전에비해많은증가를보였다. 이번정도관리사업에서는 7개종목을대상으로시행했는데향후참가신청기관을대상으로실태조사를시행하면검체등의준비가쉬워지면보다많은종목을추가할수있을것이다. 분자유전검사정도관리는대체적으로우수한검사결과를보였는데, 가장많은기관이참여한결핵균 PCR 검사에서는백혈병검사및유전질환검사에서양호했다 년에는분자유전검사정도관리횟수를증가시키고효율적인사업으로발전시키기위해웹사이트 (www. lab-qa.org) 를적극활용할예정이다. 감사의글 학검사실 ( 김선희교수, 우희연전임의 ) 의주관하에시행되었고, 분자유전검사는서울대학교병원분자유전검사실 ( 박성섭교수, 최혜심수석기사 ) 에서담당했습니다. 또한 ( 주 ) 한국로슈진단에서는 HCV control plasma 를기증해주셨습니다. 검체준비와검체발송및결과분석을위해수고해주신관계자여러분께다시금감사드립니다. 참고문헌 1. 조현찬, 김선희, 박성섭, 윤혜령, 김의종, 박숙자, 박종우, 서순팔, 송경순, 이유경, 전효진, 지현숙. 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (1997). 임상병리와정도관리 1998;20 (1): 조현찬, 김선희, 박성섭, 윤혜령, 김의종, 박숙자, 박종우, 서순팔, 송경순, 이유경, 전효진, 주세익, 지현숙. 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (1998). 임상병리와정도관리 1999;21(1): 조현찬, 김선희, 박성섭, 이경아, 김의종, 박숙자, 박종우, 서순팔, 송경순, 이유경, 전효진, 주세익, 지현숙. 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (1999). 임상병리와정도관리 2000;22(1): 조현찬, 김선희, 박성섭, 이경아, 김의종, 박숙자, 박종우, 서순팔, 송경순, 이유경, 전효진, 주세익, 지현숙. 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2000). 임상병리와정도관리 2001;23(1):S 박성섭. 분자유전검사의정도관리사업전망. 임상병리와정도관리 1997;19: ISCN(1995): An International System for Human Cytogenetic Nomenclature, Mitelman F (ed);s. Karger, Basel, 1995 세포유전검사의정도관리사업은삼성서울병원세포유전

5 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 131 Table 1. Results of Cytogenetic Survey 01CY-01 46,XY,t(11;22)(q23;q11.2) ,XY,t(11;22)(q24;q12) ,XY,t(11;22)(q23;q13) ,XY,t(11;22)(q25;q13) ,XY,t(11;22)(q23;q11.2)[4]/46,XY,t(11 ;22)(q23;q11.2),del(14)(q24)[1] ,XY,t(11;22)(q23.2;q11.2) ,XY,t(11;22)(q23.3;q11.2) ,XY,t(11;22)(q23;q11) ,XY,der(11)t(11;22)(q25;q13.1) 46,XY,del(22)(q13)[5] * M:Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** :Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ:Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

6 132 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 2. Results of Cytogenetic Survey 01CY ,XY,inv(14)(q11.2q32)[3]/46,XY[2] ,XY,inv(14)(q11.1q32)[3]/46,XY[2] ,XY,inv(14)(q12q32)[3]/46,XY[2] ,XY,inv(14)(q11.2q32.3)[3]/46,XY[2] ,XY,inv(14)(q11q32)[3]/46,XY[2] ,XY,inv(14)(q11q32)[3] ,XY,inv(14)(q11;q32.1) ,XY,inv(14)(q11.2q32)[2]/46,XY[3] ,XY,del(14)(q32.1) ,XY,t(3;14)(q27;q32)[3]/46,XY[2] ,XY,t(8;14)(q24;q32) ,XY,t(5;9;14;9)(q11.2;q22;q24;q11)[ ]/46,XY[3] ,XY,der(14)[5] ,XY,-14,+mar[3]/46,XY[2] ,XY,der(15)t(15;17)(q22;q?)[5] 46,XY,del(19)(p13.2)[5] 46,XY * M:Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** :Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ:Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

7 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 133 Table 3. Results of Cytogenetic Survey 01CY-03 46,XY,del(9)(p22) ,XY,del(9)(p21) ,XY,del(9)(p23) ,XY,del(9)(p22)[5] ,XY,del(9)(p22.3) ,XY,del(9)(p22pter) ,XY,del(9)(p22)[3]/46,XY[2] 46,XY,del(p22) ,XY,del(9)(p21p22) 46,XY,del(9)(p24.1p24.2) 46,XY,inv(9)(p24q22.1) 46,XY,del(13)(q14.1) 46,XY,t(6;9)(p12;q33) 46,XY * M : Modal chromosome number, S : Sex chromosome designation A : Recognition of abnormalities, N : nomenclature ** : Not graded, ꊱ : Good performance, ꊲ : Acceptable performance, ꊳ : Unacceptable performance

8 134 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 4. Results of Cytogenetic Survey 01CY-04(Continuation) 46,XY,+1,der(1;7)(q10;p10)[2]/46,idem,del(3)(q21)[2]/ 46,XY[1] ,XY,+1,der(1;7)(q10;p10)[2]/46,idem,del(3)(q13.2) [2]/46,XY[1] ,XY,+1,der(1;7)(q10;p10)[2]/46,idem,del(3)(q13.3) [2]/46,XY[1] ,XY,+1,der(1;7)(q10;p10)[2]/46,XY,+1,der(1;7)(q10; p10),del(3)(q13.2)[2]/46,xy[1] ,XY,+1,der(1;7)(q10;p10)[2]/46,XY,+1,der(1;7)(q10; p10),del(3)(q21)[2]/46,xy[1] ,XY,+1,der(1;7)(q10;p10),del(3)(q13.3)[2]/46,XY,+1, der(1;7)(q10;p10)[2]/46,xy[1] ,XY,+1,der(1;7)(q10;p10)[3]/46,idem,del(3)(q21)[2] 46,XY,+1,der(1;7)(q10;p10),der(2)t(2;?)(p?;?)[2]/46,X Y,+1,der(1;7)(q10;p10),t(3;3)(q21;q26)[2] 46,XY,del(3)(q21),der(7)t(1;7)(q11;p11.1)[2]/46,XY,der( 7)t(1;7)(q11;p11.1)[2]/46,XY[1] ,XY,der(7)t(1;7)(q10;p10)[2]/46,XY,del(3)(q13.2),der( 7)t(1;7)(q10;p10)[2]/46,XY[1] 46,XY,der(7)t(1;7)(q10;p10)[3]/46,XY,del(3)(q13.3),der( 7)t(1;7)(q10;p10)[2] 46,XY,der(7)t(1;7)(q10;p10)[3]/46,idem,del(3)(q21)[2] 46,XY,+der(1)t(1;7)(p11;p11),-7[2]/46,idem,del(3)(q13. 3)[2]

9 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 135 Table 4. Results of Cytogenetic Survey 01CY-04 46,XY,+der(1)t(1;7)(p12;p12),-7[2]/46,idem,del(3)(q2 1)[2]/46,XY[1] 46,XY,+der(1)t(1;7)(q10;p10)[4]/46,idem,del(3)(q12) [2]/46,XY[1] 46,XY,der(1)t(1;7)(p11;p11)[2]/46,idem,del(3)(q21)[2 ]/46,XY[1] 46,XY,t(1;7)(p10;p10)[3]/46,XY,t(1;7)(p10;p10),del(3 )(p14p23)[2] 46,XY,t(1;7)(q10;p10),(del(3)(p21)[2]/46,XY,t(1;7)(q1 0;p10)[2] 46,XY,del(3)(q13.2),der(7)t(1;7)(q10;q10)[2]/46,XY,d er(7)t(1;7)(q10;q10),del(16)(q10),+12,-18[1] 46,XY,inv(3)(q29;p22)[3]/46,XY,+1,-7,del(1)(q22)[1]/ 46,XY[1] 46,XY,+der(1)t(1;7)(p11;p11.1),-7[1]/46,idem,del(3)( q21)[1]/46,idem,i(17)(q21)[1]/46,idem,del(3)(q21),i(1 7)(q21)[1]/ 46,XY[1] 46,XY,ins(7;3)(q31.2;q13.2q29)[3]/46,XY[2] 46,XY,der(3),der(7)[5] 46,XY,der(7)t(3;7)(p27;q21) 46,XY,t(3;7)(q13.1;p12)[2]/46,XY[3] 46,XY,t(1;3;7)(q32;q21;q11)[2]/46,XY,t(1;3;7)(q32;q 27;q11)[2]/46,XY[1] 46,XY,t(2;7)(p11.2;q22)[2]/46,idem,del(3)(q13.2)[2]/ 46,XY[1] * M : Modal chromosome number, S : Sex chromosome designation A : Recognition of abnormalities, N : nomenclature ** : Not graded, ꊱ : Good performance, ꊲ : Acceptable performance, ꊳ : Unacceptable performance

10 136 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 5. Results of Cytogenetic Survey 01CY-05 46,X,psu dic(x;x)(p11.4;p11.23) ,X,psu idic(x)(p11.21) ,X,psu idic(x)(p11.23) ,X,idic(X)(p11.2) ,X,idic(X)(q10) ,X,idic(X)(p11) ,X,dic(X)(p10) ,X,i(X)(q10) ,XX,i(X)(q10) ,X,i(X)(q11)[3]/47,idem,+16[2] ,XX,iso(Xq)[3]/47,XY,+16[2] ,X,idic(X)(p11.2)[3]/45,X[2] ,X,idic(X)(p11.23)[4]/45,X[1] ,X,iso(Xq) * M : Modal chromosome number, S : Sex chromosome designation A : Recognition of abnormalities, N : nomenclature ** : Not graded, ꊱ : Good performance, ꊲ : Acceptable performance, ꊳ : Unacceptable performance

11 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 137 Table 6. Results of Cytogenetic Survey 01CY-06 46,X,t(X;10)(q13;p13) ,X,t(X;10)(q21;p15) ,X,t(X;10)(q11;p13) ,X,t(X;10)(q13;p14) ,X,t(X;10)(q13;p15) ,X,t(X;10)(q21;p13) ,X,t(X;10)(q21;p14) ,X,t(X;10)(q21.2;p13) ,X,t(X;10)(q21.2;p14) ,X,t(X;10)(q21.2;p15) ,X,t(10;X)(p14;q21) ,X,t(10;X)(q24;q13) ,X,t(X;10)(p13;q24) ,X,t(X;10)(p10;p10) ,X,t(X;10)(q10;q10) ,X,dup(X)(p11 pter) ,XX,t(X;10)(q13;p13) ,XX,t(X;10)(q21;p14) ,XX,der(10)t(10;X)(p14;q13) ,XY,der(10)t(X;10)(q13;p13) * M : Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A : Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** : Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ : Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

12 138 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 7-1. Results of Cytogenetic Survey 01CY-07 47,XX,+psu idic(15)(q13) ,XX,+?psu idic(15)(q13) ,XX,+psu idic(15)(q11.2) ,XX,+psu dic(15;15)(q13;q13) ,XX,psu dic(15)(q13) ,XX,+idic(15)(q13) ,XX,+idic(15) ,XX,+dic(15;15)(q15;q11.2) ,XX,+dic(15)(q11.2) ,XX,+dic(15)(q12) ,XX,+dic(15)(q13) ,XX,+i(15)(q13) ,XX, ,XX,+psu idic(21)(q22.1) ,XX,+der(21) ,XX,+dic(13;15)(q13;q13) ,XX,t(15;21)(q11.1;q22.1), ,XX,t(15;21)(q11;q21), ,XX,+idic(13)(pter q12,3::12.3 pter) ,XX,idic(Y)(q11.2)

13 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 139 Table 7-2. Results of Cytogenetic Survey 01CY-07 47,XX,+mar ,XXY,dup(21)(q22q11.2) * M:Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** :Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ:Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

14 140 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 8. Results of Cytogenetic Survey 01CY-08 46,XY,t(1;19)(q23;p13.3)[3]/46,XX[2] ,X,-X,+Y,t(1;19)(q23;p13.3)[3]/46,XX[2] ,XY,t(1;19)(q23;p13.2)[3]/46,XX[2] ,X,-X,+Y,t(1;19)(q23;p13)[3]/46,XX[2] ,XY,t(1;19)(q23;p13)[3]/46,XX[2] ,XY,t(1;19)(q23;p13)[5] ,XY,t(1;19)(q23;p13.3)[2]/46,XY,der(19)t(1;19)(q2 3;p13.3)[1]/46,XX[2] ,XY,t(1;19)(q23;p13) ,X,-X,t(1;19)(q23;p13),+mar[cp3]/46,XX[2] ,XX,+Y,t(1;19)(q23;p13),+del(7)(q11),-8[3]/46,X X[2] 46,XX,+Y,t(1;19)(q23;p13),+del(7)(q11),-8[3]/46,X X[2] 46,XY,t(1;19)(q23;p13)[3]/46,XY,der(19)t(1;19)(q23; p13)[2] ,XX[2]/46,XY,der(19)t(1;19)(q22;q13.4)[3] ,XX,t(1;19)(q23;p13)[2]/46,XX,der(19)t(1;19)(q23; p13)[1]/46,xx[2] ,XX,del(1)(q23)(X;19)(q12;q13.3)[3]/46,XX[2] ,XX,t(1;19)(q22;13.3)[2]/46,XX,t(1;2;19)(q22;p12; q13.3)[2]/46,xx[1] * M:Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** :Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ:Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

15 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 141 Table 9. Results of Cytogenetic Survey 01CY-09 46,XX,+21,der(21;21)(q10;q10) ,XX,i(21)(q10) or 46,XX,+21,der(21;21)(q10;q10) ,XX,der(21;21)(q10;q10), ,XX,i(21)(q10) ,XX,idic(21)(q22.3) ,XX,der(21;21)(q10;q10) ,XX,der(21)t(21;21)(p11;q11) ,XX,t(21;21)(q10;q10) ,XX,rob(21;21)(q10;q10) ,XX,+12,der(12;21)(p10;q10) ,XX,del(1)(p36.3),i(21)(q10) ,XX,+21,der(21;21)(q10;q10)[4]/47,XX,+ 21,+21,der(21;21)(q10;q10)[1] * M:Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** :Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ:Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

16 142 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 10. Results of Cytogenetic Survey 01CY-10 47,XX,t(9;22)(q34;q11.2),+der(22)t(9;22)[5] ,XX,t(9;22)(q34;q11.2),+der(22)t(9;22)(q34 ;q11.2)[5] ,XX,t(9;22)(q34;q11.2),+der(22)t(9;22) ,XX,t(9;22)(q34;q11),+der(22)t(9;22)[5] ,XX,t(9;22)(q34;q11),+der(22)t(9;22)(q34; q11) ,XX,t(9;22)(q34;q11.2),+der(22)t(9;22)(q34 ;q11.2) ,XX,t(9;22)(q34;q11),+der(22)[5] ,XX,+der(22)t(9;22)(q34;q11.2)[5] ,XX,der(22)t(9;22)(q34;q11) ,XX,t(9;22)(q34;q11),+21[5] ,XX,t(9;22)(q34;q11),+mar[5] ,XX,t(9;22)(q34;q11),+mar ,XX,+mar ,XX,t(9;22)(q34;q11) ,XY,+X,t(9;22)(q34;q11) ,XX,t(9;22)(q34;q11.2),+der(22)t(9;22)(q34 ;q11.2)[3]/46,idem,-17[2] * M:Modal chromosome number, S:Sex chromosome designation A:Recognition of abnormalities, N: nomenclature ** :Not graded, ꊱ:Good performance, ꊲ:Acceptable performance, ꊳ:Unacceptable performance

17 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 143 Table 분자유전검사실태조사 : 대상종목, 정도관리물질의제조, 참가기관수 검사종목검체번호정도관리물질의제조참가기관수 Tuberculosis 분자유전검사 MD 01-1 M. tuberculosis H37Ra (ATCC 25177) MD 01-2 M. chelonae 52 Hepatitis C virus 분자유전검사 MD 01-3 MD 01-4 HCV control plasma Normal control plasma 41 Leukemia 분자유전검사 ( 염색체전위 ) MD 01-5 MD cells, Kasumi-1 cell line, 106 cells, SUP-B15 cell line 18 ABO 혈액형분자유전검사 MD 01-7 MD 01-8 정상인말초혈액 DNA 혈액형검사환자말초혈액 DNA 4 Duchenne muscular dystrophy 분자유전검사 MD 01-9 MD DMD 환자말초혈액 DNA DMD 환자말초혈액 DNA 3 Huntington's disease 분자유전검사 MD MD Huntington's disease 환자말초혈액 DNA R/O Huntington's disease 환자말초혈액 DNA 2 Leber hereditary optic neuropathy 분자유전검사 MD MD M/41, LHON 환자말초혈액 DNA M/20, LHON 환자말초혈액 DNA 3

18 144 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 분자유전검사실태조사결과 검사종목검체번호결과기관수 Tuberculosis 분자유전검사 Hepatitis C virus 분자유전검사 Leukemia 분자유전검사 ( 염색체전위 ) MD 01-1 MD 01-2 MD 01-3 MD 01-4 MD 01-5 MD 01-6 Positive 52 Negative 0 Positive 1 Negative 51 Positive 36 Negative 5 Positive 2 Negative 39 AML1-ETO (+) 9 시행한모든종목 (-), AML1-ETO 는시행안함 7 AML1-ETO (+) and bcr-abl, major, b3a2 (+) 1 minor bcr-abl (+) 1 bcr-abl, minor, e1a2 (+) 12 시행한모든종목 (-), minor bcr-abl 은시행안함 4 bcr-abl, minor, e1a2 (+); bcr-abl, major, b3a2 (+) 1 예상결과 ( 주관기관 ) Positive Negative Positive Negative AML1-ETO (+) minor bcr-abl (e1a2 type) (+) 검사한모든종목 (-), minor bcr-abl 을시행함 1 ABO 혈액형분자유전검사 DMD 분자유전검사 HD 분자유전검사 LHON 분자유전검사 MD 01-7 MD 01-8 AO 2 A 2O 1 AB 1 cis-ab/o 1 BO ( 표현형이 AB 이면 cis-ab 가능성이있음 ) 1 A 2O 1 AB 1 exon 45, 46, 47 1 AO (=A1O) cis-ab/o MD 01-9 exon 45, 47 (exon 46은검사안함 ) 1 exon exon 45, 46, 47, 49 1 MD exon 50 3 exon 50 MD MD /18, Positive 1 44/20, Positive 1 24/18, Negative 1 23/17, Negative 1 MD G A, Positive 3 MD T C, Positive 3 Positive Negative G A, Positive T C, Positive

19 진단유전학검사신빙도조사결과보고 (2001) 145 Table 13. 결핵균 PCR 검사방법 1) DNA 추출방법 기관수 소 계 Amplicor (Roche) 25 Instagene (Bio-Rad) 5 Bioneer 4 상품 kit 자체방법 Blood mini kit (Qiagen) 2 Geneprobe 1 Genereleaser 1 NeoDin 1 Solgent 1 Boiling 9 PK/PCI 2 Bead beater/pci 1 40 (77%) 12 (23%) 2) PCR 방법 기관수 소계 Amplicor (Roche) 25 Bioneer 7 Genotech 2 MycoExpress 2 MycoSignal 2 상품 kit 자체방법 Biocore 1 Diaprobe 1 Geneprobe 1 INNO-LiPA (Innogenetics) 1 NeoDin 1 Solgent 1 단순 PCR 5 Nested PCR 3 44 (85%) 8 (15%)

20 146 조현찬 김선희 박성섭 우희연 최혜심 김재석 김의종 박숙자 박종우 서순팔 송경순 이유경 지현숙 Table 14. Hepatitis C virus PCR 검사방법 1) RNA 추출방법 기관수 소계 Amplicor (Roche) 24 RNaid ( 제노텍 ) 3 Tri reagent (MRC) 3 Diaprobe 2 상품 kit RNA PrepMate (Bioneer) 2 38 (92%) High pure viral RNA kit (BM) 1 NeoDin 1 RNA mini kit (Qiagen) 1 RNAzol (Tel-test) 1 자체방법 AGPC 법 2 Boiling 1 3 (8%) 2) 정성검사방법 기관수 소계 Amplicor (Roche) 24 Bioneer 4 상품 kit Geno tech 3 Diaprobe 2 35 (85%) NeoDin 1 Solgent 1 자체방법 RT-Nested PCR 5 단순 RT-PCR 1 6 (15%) 3) 정량검사방법 기관수 소계 상품 kit Amplicor (Roche) 6 6 (100%) Table 15. 설문조사결과 설문결과 ( 요청한기관수 ) 다음에분자유전검사정도관리에포함하였으면하는검사 HBV 정량 (2), HBV(4), CMV/EBV/HSV(3), C. trachomatis(3), HPV(4), U. urealyticum(3), N. gonorrhoeae(1), Rifampin 내성결핵 (1), Malaria-PCR(1), Mycoplasma(1), Rubella(1), ApoE(2) TEL-AML1(1), Acetylcholinesterase(1), Y-chromosome(1). 기타건의사항신속한우송 (1), 검체발송여부를 로통보요망 (1)

Can032.hwp

Can032.hwp Chromosomal Alterations in Hepatocellular Carcinoma Cell Lines Detected by Comparative Genomic Hybridization Sang Jin Park 1, Mahn Joon Ha, Ph.D. 1, Hugh Chul Kim, M.D. 2 and Hyon Ju Kim, M.D. 1 1 Laboratory