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윤영 옥
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1 Volume 2 Number 9 September, 2010 KSBSB NewsLetter Korean Society for Bioinformatics and Systems Biology KSBSB 1 한국생물정보시스템생물학회

2 K S B S B K S B S B K S B S B KSBSB 한국생물정보시스템생물학회 5대 목표 목표: 국제 수준의 학회 1. 위원회 중심 체제 확립 2. 1,000 명 회원; 400 명 학술대회 참석 3. 학회지, IBC (Interdisplinary Bio Central) SCIE 등재 4. 최고 수준의 전산정보화 5. 연간 예산 규모 2 억원 KSBSB 차기회장 선정위원회 구성 및 절차 2010 년 5 월 14 일 실무이사회의 의결 사항에 따라 다음과 같이 차기회장 선정위원회 구성을 하였습니다. - 위원장: 홍순찬 (KISTI) - 위 원: 권경훈 (한국기초과학지원연구원) 추인선 (한국생명공학연구원) 이근우 (경상대학교) 김동섭 (KAIST) 선정 절차 - 모든 실무이사로 부터 회장 후보 추천 받음(7/1~7/23) - 선정위원회에서 후보 3 인 선정(7 월 마지막 주) - 후보에게 소견 발표문 요청 및 접수(8/1~ 8/31) - 정회원들의 이메일 투표에 의한 회장 선출(9/1~ 9/9) - 선출된 회장 당선자를 9 월초 실무이사회에서 차기회장으로 인준 2 Newsletter Vol. 2 No. 9

연간 예산 규모 2 억원 KSBSB 차기회장 선정위원회 구성 및 절차 2010 년 5 월 14 일 실무이사회의 의결 사항에 따라 다음과 같이 차기회장 선정위원회 구성을 하였습니다.

3 September 2010 KSBSB 제 4 차 실무이사회의 개최 안내 일시: 2010 년 9 월 9 일(목) 오후 6 시 장소: 한강 선상 뷔페 크루즈 (여의도 선착장) 일정 오후 6 시 여의도 선착장의 노들나루 노들레스토랑에 모임 (회의) 오후 7 시 여의도 진성나루에서 크루즈 탑승 오후 7 시 30 분 선상 뷔페 크루즈 출발 오후 9 시 입항 안건 1) 2011 APBC 성공적인 개최에 필요한 사항 점검 2) 차기 회장 인선 확정 3) 기타사항 KSBSB 3

(회의) 오후 7 시 여의도 진성나루에서 크루즈 탑승 오후 7 시 30 분 선상 뷔페 크루즈 출발 오후 9 시 입항

4 KSBSB ROADMAP 날짜 일정 비고 2008 년 12 월 29 일 저녁 5 시 연세대학교, 노경태 전임회장 및 이상혁 총무간사와 만나 업무 인수인계 협의 29 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 1 호 발간 2009 년 1월 2월 8-9 일 학회워크샵 진주 아시안 레이크사이드 호텔에서 학회 임원/이사들 Kick-off 워크샵 및 이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 2 호 발간 24 일 제 1 회 운영위원회 대전에서 개최 28 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 3 호 발간 2008 년 12 월 5 일 이사회에서 유장렬 차기 회장 선출 2009 년과 2010 년 정기 학술대회임시조직위원장 및 장소를 결정 3월 4월 5월 13 일 집행이사회의 개최 (강릉 경포대 현대호텔 4:30 PM) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 4 호 발간 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 5 호 발간 22 일 집행이사회의 (무주리조트) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 6 호 발간 6 월 13 일 일본 CBI 의 Prof. Masahiro Okamoto and Prof. Akihiko Konagaya 부산 방문 그랜드호텔 실사 및 실무자 회의 27 일 일본 CBI 방문 실무자 준비 회의 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 7 호 발간 7 월 3 일 KSBSB Summer School 개최 (서울대 농생대) 및 임시총회, 집행이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 8 호 발간 8 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 9 호 발간 9 월 일 집행이사회의 개최 (부산 그랜드호텔) 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 10 호 발간 10 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 11 호 발간 11 월 4-6 일 부산 그랜드호텔 Bioinfo2009 (CBI-KSBSB Joint 학회) 및 정기총회 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 12 호 발간 2008 년 9 월 일 연세대에서 CBI 측과 준비모임 추진 (주무간사: 김상수) 4 Newsletter Vol. 2 No. 9

개최 (강릉 경포대 현대호텔 4:30 PM) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 4 호 발간 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 5 호 발간 22 일 집행이사회의 (무주리조트) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 6 호 발간 6 월 13 일 일본 CBI 의 Prof. Masahiro Okamoto and Prof.

5 September 월 30 일 2011 APBC 국제학술대회 준비모임 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 1 호 발간 2010 년 1 월 일 강원도 용평리조트 공동심포지엄 개최 및 집행이사회의 개최 (2009 년도 결산보고 및 회계감사) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 2 호 발간 2 월 28 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 3 호 발간 3 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 4 호 발간 4월 30일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 5 호 발간 5 월 14 일 실무이사회의 개최 (서울 아보체) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 6 호 발간 6 월 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 7 호 발간 7 월 2 일 Summer School (숭실대) 심포지엄 개최 및 집행이사회의 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 8 호 발간 8 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 9 호 발간 9월 9일 제 4 차 실무이사회의 개최 (한강 선상뷔페크루즈, 여의도선착장), 차기 회장 인준 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 10 호 발간 10 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 11 호 발간 11 월 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 12 호 발간 12 월 3 일 집행이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 3 권 1 호 발간 2011 년 1 월 일 인천 송도컨벤션센터 APBC2011 학회 개최 및 정기총회 개최 (2010 년 결산보고 및 회계감사) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 3 권 2 호 발간 유장렬 회장 체제 종료 1 월 13 일 인천대교 Moonlight Cruise+Dinner APBC 2011 년 1월 한국에서 개최 예정 GIW2011 을 2011 년 12 월에 한국에서 개최 예정 KSBSB 5

발간 7 월 2 일 Summer School (숭실대) 심포지엄 개최 및 집행이사회의 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 8 호 발간 8 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 9 호 발간 9월 9일 제 4 차 실무이사회의 개최 (한강 선상뷔페크루즈, 여의도선착장), 차기 회장 인준 30 일 KSBSB Online 뉴스레터

6 2010 KSBSB 최신정보 OMICS 암 세포에 존재하는 돌연변이에 대한 대규모 분석 결과 약 400 건 이상의 유방암, 폐암, 난소암, 그리고 전립선암 샘플에 대한 대규모 유전학적 분석을 통해서 수천 개의 암 관련 돌연변이를 밝힐 수 있었다. Kan 등은 암 환자에서 얻어진 DNA 를 분석하였으며, 1,507 개의 유전자 암호화 영 역에서 2,576 개의 돌연변이를 밝힐 수 있었다. 이들 중에서 77 개의 돌연변이 는 돌연변이가 심각하였으며, 단백질 인산화 효소, G 단백질 결합 수용체, 그 리고 다른 잠재적인 치료 타깃이 될 수 있는 단백질과 관련성을 가지고 있었 다. 출처: Nature doi: /nature09208 면역센서를 제어하는 동식물에 공통된 단백질 복합체의 구조를 밝힘 일본의 독립행정법인 이화학연구소(리켄)는 종을 넘어서 동식물에서 공통적인 면역센서를 제어하는 RAR1, SGT1, HSP90 의 3 가지 단백질로 구성된 단백질 복합체의 입체 구조를 밝힘으로써 RAR1 이 복합체 형성을 촉진하여 기능을 강화시킴으로써 바이러스(예, 담배 모자이크 바이러스)의 침입을 방어하는 메 커니즘을 확립하였다고 2010 년 7월 30 일자 보도를 통하여 발표했다. 이것은 리켄 식물과학 연구센터 식물 면역 연구팀의 시라스( 白須賢 ) 팀리더를 비롯한 연구팀과 영국의 암연구소(The Institute of Cancer Research)의 Minghao Zhang 연 구원, 로렌스(Laurence H. Pearl) 교수와의 공동 연구에 의한 성과이다. 지금까지 면역센서의 제어에 중요한 인자로서 RAR1, SGT1, HSP90 의 3 가지 단백질을 식별해 왔다. 이들 단백질은 서로 결합해 복합체를 형성하고 면역센서와 결합 한다. 3 가지 단백질 중 어떤 한 단백질이 기능을 잃어도 면역센서의 작용은 저하하며 식물은 다양한 세균에 감염된다고 알려져 있다. 그러나, RAR1-SGT1- HSP90 복합체가 어떤 메커니즘으로 면역센서를 제어하는 것인지는 알려지지 않았다. 따라서 위 연구팀은 이 복합체의 입체 구조의 분석과 생화학, 분자생 물학적 분석법을 결합한 다각적인 접근방식으로 위 단백질 복합체의 기능 분 석을 시도하였다. HSP90 은 분자 샤페론의 하나로 단백질의 구조 형성을 돕는 것은 물론 그 활성을 제어하고 있다고 생각된다. 6 Newsletter Vol. 2 No. 9 출처:

7 September 2010 관상동맥질환 유발 95 개 유전지 표 발견 국내 연구팀이 세계적 연구그룹에 참여해 관상 동맥질환을 유발하는 혈중 지질농도와 관련된 95 개 유전지표를 발견했다. 질병관리본부는 서 울대 통계학과와 함께 국제지질유전학협력 연 구에 참여해 이 같은 성과를 냈다고 4 일 밝혔 다. 관상동맥질환은 관상동맥이 협착돼 심근에 혈류 공급장애가 발생하는 상태를 말한다. 혈중 지질농도는 혈액 내 총 콜레스테롤과 저밀도 지단백 콜레스테롤, 고밀도 지단백 콜레스테롤, 중성지방 등의 농도를 일컫는다. 질병관리본부 에 따르면 이번 국제협력연구에는 세계 19 개국 200 명 이상(40 개 연구그룹) 연구자들이 참여했 으며, 총 13 만명을 대상으로 3 년간 진행됐다. 최고권위 학술지 네이처 8 월호에 게재될 예정 이다. 연구는 유럽인에게서 밝혀진 혈중지질농 도에 영향을 미치는 유전지표를 한국인 인구집 단에서 검증하는 방식으로 이뤄졌다. 질병관리 본부 측은 "고위험 질환인 관상동맥질환의 예 방과 치료를 위해서는 이 질환의 주요위험인자 들 중 하나인 혈중지질농도를 조절하는 것이 매우 효과적"이라며 "이번 연구에서 발견된 유 전지표들을 개인별 유전정보를 바탕으로 한 예 방의학에 활용해 국내 심혈관질환 사망률 감소 에 기여할 것"이라고 강조했다. 출처: 머니투데이 &type=2 지질 대사와 연관된 95 개의 유전 자 영역을 발견 독일의 환경 건강을 위한 연구소인 Helmholtz Zentrum Munchen(HZM)의 연구팀이 국제 지질 유전학 콘소시움(Global Lipids Genetics Consortium)의 동료들과 더불어 지단백질 물질 대사의 가장 중요한 4 개의 인자(총 콜레스테롤, LDL 콜레스테롤, HDL 콜레스테롤, 트리글리세 리드) 중에 적어도 1 개와 각각 관련되는 인간 게놈 상의 95 개의 유전자 영역을 발견했다고 2010 년 8 월 4 일자 보도를 통하여 발표했다. 총 콜레스테롤, LDL 콜레스테롤, HDL 콜레스테 롤, 트리글리세리드는 관상동맥질환(coronary artery disease); CAD)에 대한 가장 중요한 위험인 자들로써 이 질병의 치료 전략에서도 주요한 표적으로 삼고 있는 것들이다. 위 공동 연구팀 은 지단백질 대사에 영향을 미치는 유전자 영 역이 정말로 존재하는 가와 이들이 치료 전략 에서 어떤 중요한 점이 있는 가에 대한 2 가지 관점에 초점을 맞추고 연구를 진행하였다. 연구 팀은 위의 질문에 명백한 긍정의 답을 얻을 수 있는데, HZM 역학연구소의 Christian Gieger 박사 에 따르면 이번 연구를 통하여 단지 높은 지질 수준만이 아닌 관상동맥 질환과도 깊은 관련성 을 보이는 유전자 변이를 정확히 확인하는 것 에 성공했다고 언급했다. 혈중 지질 수치의 상 승은 심질환의 가장 중요한 위험인자로서 이번 연구성과는 혈중 지질 농도 및 심혈관계 질환 과 유전적 변이가 매우 깊은 상관성을 가진다 는 것을 검증한 것으로 평가할 수 있다. 출처: KISTI 미리안 글로벌동향브리핑 sp php 카멜레온 나노입자 활용해 바이 오 칩 효율성 높여 바이오칩을 이용해 물질 분석의 효율성을 크게 개선할 수 있는 기술이 국내 연구진에 의해 개 발됐다. 이 연구는 재료공학 분야 유명 학술지 네이처 머터리얼스 (Nature Materials) 2010 년 9 월호 표지논문으로 실린다. 서울대학교 전기전 자공학부 권성훈 교수 연구팀은 자기장의 영향 을 받아 색깔과 배열이 변하는 초상자성( 超常磁性 ) 나노입자 의 특성을 활용해 혈액 등 생 체물질을 검사할 때 분석 종류는 늘리고 시간 은 줄이는 기술 을 개발했다고 22 일 밝혔다. 권 교수는 초상자성 나노입자는 한 가지 물질이 지만 여러 가지 색을 표현하는 카멜레온과 같 은 특성이 있다 며 이 입자에 컬러바코드(color bar-code)를 형성하는 방법으로 수백만 가지 정 보를 담을 수 있다 고 말했다. 연구팀은 카멜 레온 미세입자 가 자기장에 반응하는 특성도 활 KSBSB 7

질병관리본부 에 따르면 이번 국제협력연구에는 세계 19 개국 200 명 이상(40 개 연구그룹) 연구자들이 참여했 으며, 총 13 만명을 대상으로 3 년간 진행됐다. 최고권위 학술지 네이처 8 월호에 게재될 예정 이다. 연구는 유럽인에게서 밝혀진 혈중지질농 도에 영향을 미치는 유전지표를 한국인 인구집 단에서 검증하는 방식으로 이뤄졌다.

8 용했다. 그는 자기장으로 바이오 칩 내부의 미 세 입자를 빠르게 회전시키면 혈액 등과 반응 하는 시간을 기존 대비 10 분의 1 정도로 줄일 수 있다 고 설명했다. 이 기술은 암 같은 질병 의 진단, 개인 맞춤 유전자분석, 신약 물질후보 검출 등 생화학 반응 분석이 필요한 분야에 응 용할 수 있다. 연구팀은 이에 대한 특허를 출원 했으며 상용화 기술과 장비 개발도 진행 중이 라고 덧붙였다. 출처: 동아사이언스 2/ / html Systems Biology 생명체의 정확한 모사를 위한 가 상세포 방법론 개발 교육과학기술부(장관 안병만)는, 한국과학기술 원(KAIST) 이상엽 교수 연구팀이 생명체의 세 포를 체계적으로 분석하여 세포 전체의 대사적 특성을 정확하게 예측할 수 있는 가상세포 방 법론 을 개발하였다고 밝혔다. 이 연구는 교육 과학기술부 미래기반기술사업(시스템생물학 연 구개발)의 지원을 받아 수행되었으며, 연구결과 는 세계적 저명 학술지인 미국 국립과학원 회보(PNAS) 誌 8 월 2일자 온라인판에 게재되 었다. 가상세포는 컴퓨터시스템으로 실제세포를 모사하여 연구하고자하는 생명체의 세포를 체 계적으로 분석하는 중요한 도구이다. 이상엽 교 수 연구팀은 생명체의 정확한 모사를 위한 가 상세포 시스템을 개발하였다. 이를 이용하여 얻 어진 가상세포 예측 결과들은 실제 세포실험으 로 측정된 결과와 비교하여 정확도가 획기적으 로 개선되었다. 이로써 보다 정확한 가상세포 예측이 가능하여, 실제 생명체의 분석연구에서 시간과 비용을 큰 폭으로 줄일 수 있게 되었다. 이번 가상세포 방법론의 개발은 국내뿐 아니라 세계생명공학 분야에서 새로운 패러다임을 제 공하여, 생명체의 분석과 개량연구에 소모되는 시간과 비용을 절감할 수 있게 되었으며, 또한 이번에 개발한 방법론은 게놈 염기서열이 분석 된 모든 생명체에 적용이 가능하기 때문에 다 양한 산업적, 의학적 응용을 위한 미생물 개발 에 활용될 수 있을 것으로 기대된다. 출처: BRIC 바이오통신원 s&id= 세포죽음을 실시간으로 관찰할 수 있는 바이오포토닉 기술 프로그램된 세포의 죽음을 일컫는 아폽토시스 (apoptosis)는 정상적인 발달과정과 건강한 면역 시스템 기능 그리고 암 예방에 핵심적이다. 이 과정은 세포구조를 극적으로 바꾸게 되지만 현 재 일반적인 현미경 관찰방법의 한계로 인해 상당히 많은 구조적인 재조직화에 대한 문제가 풀리지 않은 채 남아있다. 미국 과학원의 학술 지인 Proceedings of the National Academy of Sciences 지에 발표된 논문에서 버팔로의 뉴욕 주립대학(State University of New York, Buffalo) 과 학자들은 실시간으로 세포 수준의 거대분자가 프로그램된 세포죽음 과정에서 일어나는 변화 를 실시간으로 관찰할 수 있는 바이오포토닉 이미징(biophotonic imaging) 접근법을 개발했다. 이번 연구는 맞춤형 분자의학의 잠재성을 현실 화시키는데 도움이 될 수 있을 것이다. 예를 들 어 암치료를 위한 화학치료법은 개별 환자에 나타나는 세포변화를 목표로 할 수 있다. 또한 새로운 합성물을 스크리닝하기 위한 도구를 개 발할 수 있을 것이다. 뉴욕주립대학의 레이저, 포토닉스 및 바이오포토닉스 연구소(UB Institute for Lasers, Photonics and Biophotonics, ILPB)의 소 장이며 이 대학의 화학, 물리학, 전기공학 및 의학과 교수인 파라스 프라사드(Parad N Prasad) 박사는 이 새로운 기술은 분자수준에서 일어 나는 세포의 변화의 동적인 묘사가 가능하게 할 수 있다 고 말했다. 출처: 사이언스데일리 htm 8 Newsletter Vol. 2 No. 9

html Systems Biology 생명체의 정확한 모사를 위한 가 상세포 방법론 개발 교육과학기술부(장관 안병만)는, 한국과학기술 원(KAIST) 이상엽 교수 연구팀이 생명체의 세 포를 체계적으로 분석하여 세포 전체의 대사적 특성을 정확하게 예측할 수 있는 가상세포 방 법론 을 개발하였다고 밝혔다.

9 September 2010 유전자 상호작용을 보여주는 지도 작성 미국 UCLA 의 과학자들은 인간의 유전체 지도 를 포함한 포유류의 유전체 지도를 이용하여 유전체 안에 어떤 유전자들이 속하는지에 대한 그 순서를 보여줄 뿐 아니라 어떤 유전자들이 상호작용하는지를 보여주는 연구결과를 발표했 다. 이번 연구결과는 학술지인 Genome Research 지 최신호에 발표되었으며 어떤 유전자들이 함 께 작동하는가를 이해하는데 도움을 주고 이들 유전자들이 협력을 통해 세포의 성장과 사망을 돕는가를 보여주고 있다. 인간을 포함한 포유류 는 약 20,000 개의 다른 유전자를 갖고 있다. 유 전자는 그 모습과 같은 물리적인 특징을 결정 하는 단백질을 만드는 정보를 갖고 있을 뿐 아 니라 혈액이 혈관을 통해 이동하면서 감기바이 러스를 공격하도록 면역시스템을 자극하는 것 과 같은 신체의 처리과정에 연관된다. 유전자는 또한 암과 같은 질병의 발달에 매우 중요한 역 할을 한다. 각각 포유류 세포는 완전한 유전자 의 보충물을 포함하고 있으며 비록 세포의 활 동에 의존하고 있지만 모든 유전자가 활성화되 는 것은 아니다. 유전자는 일대일 상호작용을 할 뿐 아니라 여러 가지 유전자의 광범위한 유 전자 네트워크를 만들어낸다. 지금까지 어떤 유 전자가 함께 작동하는지 그리고 이들 유전자가 형성하는 네트워크에 대해서는 알려진 것이 거 의 없었다. 이번 연구에서 UCLA 의 과학자들은 몇 년 전 인간유전체 프로젝트를 통해 개발된 인간의 방사선 잡종지도(radiation hybrid genome) 와 개와 고양이 그리고 실험쥐를 대상으로 한 포유류 방사선 잡종지도를 사용했다. 출처: 사이언스데일리 htm Chem. Informatics 단백질기능의 비밀을 해독할 새로 운 열쇠는 소분자화합물 생체를 구성하고 있는 단백질은 생명활동의 담 당자로서 복잡한 생명현상을 만들어내고 있다. 그러나, 그 방대한 단백질 중에 기능이 밝혀진 것은 소수이고, 대부분은 기능이 알려지지 있지 않다. 이 때문에 단백질의 기능해명의 단서가 되는, 단백질의 기능을 저해하는 소분자화합물 (Bio Probe)를 검색하는 것은 의약품 개발과 생 명현상의 해명에 빼놓을 수 없다. 기간연구소 chemical Biology 연구기반시설의 연구팀은 생체 에 널리 존재하면서 그 기능이 밝혀지지 않은 단백질 "pyrin"의 기능을 저해하는, 분자량이 겨 우 400 정도의 소분자화합물 "TPh A"를 화합물 Array 라는 수법을 사용해 발견했다. 그리고 발 견한 이 TPh A 를 활용하여 기능이 밝혀지지 않 은 pyrin 이 악성흑색종의 운동에 관여하는 사실 을 규명했다. 이번 연구에서는 연구팀이 독자적 으로 개발한 모든 소분자화합물을 한번에, 게다 가 간단하게 고정화시키는 화합물 Array 에 pyrin 을 흘려넣어 결합하는 소분자화합물을 효 과적으로 탐색하는 데에 성공했다. 화합물 Array 를 활용한 Bio Probe 의 검색은 기능이 알 려지지 않은 단백질의 열쇠를 풀 Tool 로서 기 능하는 것을 증명한 것으로 주목된다. 출처: Nano-Bio 다기능 나노 입자 종양에서 떨어져 나와 혈류를 따라 흘러 다니 다가 새로운 기관에 서식을 하는 하나의 암세 포를 추적하는 것은 마치 건초 더미에서 바늘 을 찾는 것처럼 아주 힘든 일이다. 하지만 워싱 턴 대학에서 개발한 새로운 이미징 기술은 이 KSBSB 9

유 전자는 그 모습과 같은 물리적인 특징을 결정 하는 단백질을 만드는 정보를 갖고 있을 뿐 아 니라 혈액이 혈관을 통해 이동하면서 감기바이 러스를 공격하도록 면역시스템을 자극하는 것 과 같은 신체의 처리과정에 연관된다. 유전자는 또한 암과 같은 질병의 발달에 매우 중요한 역 할을 한다.

10 러한 작업을 가능하게 한다. 주변 잡음을 제거 하여 조금 더 정확한 의학적 이미징을 가능하 게 하는 다기능 나노입자를 워싱턴 대학의 연 구팀이 개발하였다. 이는 마치 건초 더미를 제 거하고 빛나는 바늘만 찾을 수 있게 해 주는 것과 같다. 광 충격파(photoacoustic) 이미징을 성 공적으로 입증한 본 연구 결과는 네이처 커뮤 니케이션(Nature Communications) 지에 게재되었 다. 나노 입자들은 초정밀 의학 이미징을 위한 좋은 조영제(contrast agent)이기는 하지만 관련 모든 기술에서 방사선 추적자를 사용하지 않으 며, 주변 조직이 나노 입자에서 발생하는 약한 신호를 흡수하는 경향이 있어 연구자들은 단일 세포 또는 일부 세포만을 관찰할 수 없었다. "비 록 조직이 효과적으로 신호를 만들기는 하지만 조영제에 비할 바는 아니다. 하지만, 조직의 양 이 조영제의 양에 비해 상대적으로 많기 때문 에 주변 잡음이 매우 커지게 된다."라고 워싱턴 대학 생명 공학부 교수이며 본 논문의 주저자 인 시아오후 가오(Xiaohu Gao)는 말했다. 출처: 사이언스 데일리 htm U-Health 사회적 관계가 수명을 결정한다? 브리검영 대학교 연구진이 발표한 새로운 연구 에서 인간의 생존 가능성을 예측하는 중요한 요소로 사회적 관계를 꼽았다. 브리검영 대학교 교수인 줄리안 홀트-렁스태드(Julianne Holt- Lunstad)와 티모씨 스미스(Timothy Smith)는 미국 공공과학 도서관 의학지(PLoS Medicine)에 게재 된 논문에서 친구, 가족, 이웃 또는 동료들 사 이의 사회적 관계가 우리의 수명을 50%까지 향 상시킬 가능성이 있다고 보고했다. 다음은 낮은 사회성이 가지는 위험을 일상 생활에서 겪는 위험 요소들과 비교한 항목이다. 첫째는 하루 에 담배 15 개피를 피운 것과 동등, 둘째는 알 코올 중독자와 동등, 세번째는 운동을 하지 않 10 Newsletter Vol. 2 No. 9 는 사람보다 더 해로움, 그리고 네번째는 비만 보다 두 배 더 해로움 등이 있다. PLoS 의학지 편집장은 브리검영 대학교 연구에 대한 요약문 에 본 연구의 진행 배경과 함께 대인관계의 부 족이 죽음을 부르는 위험 요소라는 생각은 아 직까지는 대중에게 널리 퍼져있지는 못하는 실 정이라고 기술했다. 대인관계의 빈도를 측정하 고 평균 7년 반 동안의 건강 상태를 측정한, 이 전에 출판된 148 편의 논문을 위주로 연구 분석 이 이루어졌다. 출처: 사이언스데일리 htm U-헬스 케어 의료 기기 허가 빨라 진다 식약청, 허가-심사 가이드라인 제정 등 체계 확립 식품의약품안전청(청장 노연홍)은 "관련 산업이 급속히 발전함에 따라 U-헬스케어 의료기기에 대한 신속한 허가 지원체계를 확립하겠다"고 3 일 밝혔다. 식약청에 따르면 U-헬스케어 의료기 기의 품목별 특성에 맞는 안전성과 성능, 사용 자 환경, 의료기기 상호간 데이터 전송 및 보안 기술에 대한 평가방법을 개발한다. 개발된 내용 은 업체 실무자를 대상으로 내달(9 월)부터 교육 할 예정이다. 또한 국내 의료기기 시장이 U-헬 스 분야로 급속히 진입할 것으로 예상, 의료기 기 시장 환경 변화에 선제적으로 대응하기 위 해 U-헬스케어 의료기기의 국내외 산업과 표준 화 현황 조사, 시스템 평가 방법 개발 등의 내 용이 포함된 가이드라인도 추가적으로 만든다. 식약청은 2007 년부터 매년 가이드라인을 제정, 국내 U-헬스케어 의료기기 제조업체와 연구기 관 및 관련업체에 정보를 제공하고 있다. 식약 청 관계자는 지속적으로 평가 기술을 개발하 고 교육을 실시해 전문인력 양성 등 국내 U-헬 스케어 산업 활성화를 위해 노력할 것 이라고 말했다. 출처: 데일리메디 view&dbt=article&code=120579&cate=class6

나노 입자들은 초정밀 의학 이미징을 위한 좋은 조영제(contrast agent)이기는 하지만 관련 모든 기술에서 방사선 추적자를 사용하지 않으 며, 주변 조직이 나노 입자에서 발생하는 약한 신호를 흡수하는 경향이 있어 연구자들은 단일 세포 또는 일부 세포만을 관찰할 수 없었다. "비 록 조직이 효과적으로 신호를 만들기는 하지만 조영제에 비할 바는 아니다.

11 September 2010 잠복 결핵 및 활동 결핵의 차이를 보여주는 유전자 발현 프로파일 Mycobacterium tuberculosis 에 대한 면역 반응은 매우 복잡하며, 정확하게 밝혀지지 않았으며, 따라서 새로운 진단 방법, 치료법, 그리고 백신 의 개발이 어려웠었다. 활성 결핵 및 잠복 결핵 을 앓고 있는 환자들과 정상인의 발현 유전자 의 전사 프로파일을 비교 분석하기 위해서 시 스템 생물학(systems biology) 접근 방식이 이용 되었다. 활성 폐 질환은 중성구에 의한 인터페 론 유도 유전자 프로파일을 보였다. 잠복 결핵 을 앓고 있는 환자들 중에서 약 10%는 활성 결 핵으로 이환 될 수 있다. 이번 연구에서 잠복 결핵 환자의 10%에서 활성 결핵을 앓고 있는 환자와 매우 유사한 전사적 특성이 관찰되었으 며, 이러한 바이오마커들이 질병의 진단 및 경 과 확인에 유용하게 이용될 수 있을 것으로 확 인되었다. 출처: Nature doi: /nature09247 바다 해면생물 유전자 분석 통해 암 치료 바닷속 원시생물 해면과 인간의 유전자가 70% 일치하며 해면 유전자 분석을 통해 암 치료가 가능할 것이라는 연구 결과가 나왔다. 국제연구 팀이 최근 연구결과를 발표한 과학전문지 네이 처에 따르면 연구팀은 인간과 해면생물이 암을 포함한 각종 질병에 관한 유전적 공통점이 많 다는 사실을 발견했다. 연구에 참여한 호주 퀸 즐랜드대 버나드 데그난 교수는 인류의 먼 조 상인 해면생물의 유전자를 정밀 분석하면 암 등 인간 질병을 유발하는 유전자 작동 원리를 파악할 수 있고 이를 응용해 인간 질병치료에 적용할 수 있다 고 밝히고 해면생물 유전자는 암과 줄기세포 연구의 돌파구가 될 줄기세포의 성배 라고 표현했다. 한편, 지난 2005 년 우리 나라 남해안에 서식하고 있는 해면생물에서 암 세포만 골라서 죽이는 항암물질이 단국대 신용 득 교수팀에 의해 세계 최초로 발견, 전 세계적 인 주목을 받았다. 또 지난 3 월에는 미국 연구 팀에 의해 해면에서 발견되는 스켑트린(sceptrin) 이라는 물질이 암세포의 운동성을 억제한다는 연구결과가 나와 해면생물 연구가 인간 질병 극복에 핵심 열쇠로 떠오르고 있다. 출처: 데일리 메디 view&dbt=article&code=120668&cate=class8 Education / Etc. 시아노박테리아 대량증식을 통한 바이오연료 생산 시아노박테리아(cyanobacteria)는 현존 생명체 중 가장 오래된 형태의 중 하나로서 현재 우리가 호흡하는 대기 중의 산소를 만들어내고 있다. 이번에 아리조나주립대학 Biodesign Institute 의 Hyun Woo Kim 과 Raveender Vannela 는 바이오 연료와 바이오 소재의 원천으로 기대되는 이 미생물을 배양하여 대량 증식시키는 방법을 연 구하고 있다. 이번 연구는 광생물반응기 (photobioreactor: PBR)로 불리는 광합성 생명체를 증식시키는 장치를 최적화시키는데 핵심적인 기반을 제공해 줄 것이다. 이번 새로운 연구결 과는 시아노박테리아 증식의 최적화를 위하여 이산화탄소, 인, 충분한 햇빛이 PBR 내부에서 정밀한 상호작용이 필요함을 가리키고 있다. 연 구팀의 기초 조사는 대규모 바이오연료 생산에 필수적인 PBR 내부의 시아노박테리아 증식을 제한할 수 있는 요소들을 평가하기 위한 정량 적 도구도 제공하고 있다. 이번 연구결과는 Biotechnology and Bioengineering 에 발표되었다. 출처: 한국바이오안전성정보센터 네티즌 참여 게임을 통한 단백질 구조 예측 알고리즘 개발 자연적인 폴리펩타이드 체인은 마이크로 초 내 에 자연 상태의 단백질로 접힐 수 있지만, 주어 KSBSB 11

이번 연구에서 잠복 결핵 환자의 10%에서 활성 결핵을 앓고 있는 환자와 매우 유사한 전사적 특성이 관찰되었으 며, 이러한 바이오마커들이 질병의 진단 및 경 과 확인에 유용하게 이용될 수 있을 것으로 확 인되었다. 출처: Nature doi:10.

12 진 아미노산 서열로부터 안정적인 3 차원적 구 조를 예측하는 것과 물리학 제 1법칙은 여전히 컴퓨터로 해결해야 하는 문제로 남아 있다. Seth Cooper 와 David Baker, 그리고 공동연구원들은 자신들이 개발한 구조 예측 알고리즘인 로제타 를 온라인 상에 공개하였으며, 이를 통해 수천 명의 네티즌들이 새로운 알고리즘 개발에 참여 함으로써 단백질 구조 예측을 좀더 잘 예측할 수 있는 프로그램 개발이 가능하도록 하였다. 이번 연구 결과는 과학적으로 복잡한 문제도 인터렉티브 멀티플레이어 게임을 통해서 해결 될 수 있다는 사실을 보여주고 있다. 출처: Nature doi: /nature Newsletter Vol. 2 No. 9

네티즌들이 새로운 알고리즘 개발에 참여 함으로써 단백질 구조 예측을 좀더 잘 예측할 수 있는 프로그램 개발이 가능하도록 하였다.

13 September 2010 ΐ᱁ᚠ ᡘṀḈⳀ᱁ᚠソㇰℴ ΠΞΞΧ ನ༨Ρ ᣤⲔ Ḉ፬Ⲕᓠⴙヘ Ṅ ⅔ ᎌ ㄉ Ḉᓠ᱁᱁ゼヘ၀ᔐࡄ ḙฬ Μᡜ Ḉ፬Ⲕ ᣤℴ Ꮐ⅔ ⅐ፐᣨ၈ ⅐ᓠⴙゼ⅐ᡘ ᱁᱁ゼࡄ ➐ Ḉ፬Ⲕᓠក ݨ ゼࡄ ネฬ ΜソㇰΚṐ Κ ᱢ ঔᓠᦨᏓゼ⅐Κ⅔ Ꮐ ᓜ⅔ ၈ ൨ℬ ᗘ ゼ ࡄᝠ ⅔ ឍㄉΚ ⅔ ᎌ Ḉ ⅔ ᎌ ရ ঔΚ ソㇰℴ ዠࡄ Ṛ ᰐパ၈ ゼࡄ Ṛ Ṅ ᣨ ᣤᏀ ᡘఘ①Ṁঔ ዱฬ Μΐ ᰐΨ Ζ⅔ ソ ᵼΗ⅔ዡ Ψ ϗϝϡϣϙϡϧϡϐϗϝήϕϛϗϗϛμϑϝϛ KSBSB 13

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14 생물정보시스템생물학회 위원회 명단 회 장 유장렬 한국생명공학연구원 고 문 김삼묘 경북대학교 전산학과 이광형 KAIST 부회장(해외협력부회장) 노경태 연세대학교 부회장(출판부회장) 남홍길 포항공과대학교 감 사 김승호 한국생명공학연구원 이상엽 한국과학기술연구원 기획 이사 총무 이사 재무 이사 학술 이사 이도헌 KAIST 이현주 광주과학기술원 김지현 한국생명공학연구원 유재수 충북대학교 김영주 한국생명공학연구원 이상주 KISTI 김동섭 KAIST 홍순찬 한국과학기술정보연구원 이상혁 이화여자대학교 최 선 이화여자대학교 김주한 서울대학교 조광현 KAIST 대외협력이사 김희발 서울대학교 조용민 축산과학원 김희남 고려대학교 이채영 숭실대학교 홍보 이사 산학 이사 국제 이사 출판 이사 이근우 경상대학교 이봉희 가천의과대학교 김양석 경희대학교 김형태 마크로젠 박홍석 한국생명공학연구원 김철민 부산대학교 인영용 (사)분자설계연구소 최선심 강원대학교 한윤수 중앙대학교 이인석 연세대학교 주 현 인제의대 표준화 이사 권경훈 기초과학지원연구원 김용주 기술표준원 조상연 연세대학교 신임 이사 이병욱 KOBIC 추인선 KOBIC 유웅식 가천의과대학교 14 Newsletter Vol. 2 No. 9

조광현 KAIST 대외협력이사 김희발 서울대학교 조용민 축산과학원 김희남 고려대학교 이채영 숭실대학교 홍보 이사 산학 이사 국제 이사 출판 이사 이근우 경상대학교 이봉희 가천의과대학교 김양석 경희대학교 김형태 마크로젠 박홍석 한국생명공학연구원 김철민 부산대학교 인영용

15 September 년 정기학술대회 조직위원 김상수 숭실대학교 주 현 인제의대 김철민 부산대학교 이근우 경상대학교 황대희 포항공과대학교 이현주 광주과학기술원 김희발 서울대학교 김양석 경희대학교 박근준 질병관리본부 오석준 인제의과대학교 한균희 연세대학교 Systems Biology 부회장 이상혁 이화여자대학교 Systems Biology 이 사 황대희 포항공과대학교 윤성로 고려대학교 조광현 KAIST Omics 부회장 권경훈 기초과학지원연구원 Omics 이 사 김희발 서울대학교 김동섭 KAIST 고광일 고려대학교 송미영 한의학연구원 유웅식 가천의과대학교 Chem.Informatics & Drug Discovery 부회장 윤창노 한국과학기술연구원 Chem.Informatics & Drug Discovery 이 사 이근우 경상대학교 조광휘 숭실대학교 윤석준 숙명여자대학교 조은성 고려대학교 장익수 부산대학교 나노 Bio 부회장 박제균 KAIST 나노 Bio 이 사 박성수 이화여자대학교 정효일 연세대학교 서태석 KAIST 이창수 충남대학교 U-health 부회장 박선희 한국전자통신연구원 U-health 이 사 정호열 한국전자통신연구원 박수준 한국전자통신연구원 KSBSB 15

한의학연구원 유웅식 가천의과대학교 Chem.Informatics & Drug Discovery 부회장 윤창노 한국과학기술연구원 Chem.

16 2010 년도 신임 위원회 차기회장 선정위원회 위원장 홍순찬 한국과학기술정보연구원 위 원 권경훈 기초과학지원연구원 추인선 KRIBB 이근우 경상대학교 김동섭 KAIST 2010 Summer School 준비위원회 조직위원장 조광휘 숭실대학교 학술위원장 권경훈 기초과학지원연구원 표준화사업 표준심의위원회 위원장 이근우 경상대학교 위 원 이인석 연세대학교 조광휘 숭실대학교 최선심 강원대학교 16 Newsletter Vol. 2 No. 9

준비위원회 조직위원장 조광휘 숭실대학교 학술위원장 권경훈 기초과학지원연구원 표준화사업 표준심의위원회 위원장

17 September 2010 한국생물정보시스템생물학회 뉴스레터 제 2권9호 발행인 발행일 발행처 편집위원 제 작 유장렬 2010 년 8 월 30 일 한국생물정보시스템생물학회 이인석, 최선심, 주 현, 한윤수, 김영주 윤미경 한국생물정보시스템생물학회 대전시 유성구 어은동 52 한국생명공학연구원내 Tel Fax KSBSB 17

Microsoft Word - 2-4.docx

Microsoft Word - 2-4.docx Volume 2 Number 4 April, 2010 KSBSB NewsLetter Korean Society for Bioinformatics and Systems Biology 한국생물정보시스템생물학회 KSBSB 1 K S B S B K S B S B K S B S B KSBSB 한국생물정보시스템생물학회 5대 목표 목표: 국제 수준의 학회 1. 위원회 중심