1 - 편집순서 1 : 겉표지

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1 1 - 편집순서 1 : 겉표지

2 2 - 정도관리 학술연구용역사업최종결과보고서 지표후보물질 국문과제명 영문과제명 발 굴 을 주관연구기관 : 원광대학병원 주 의 ( 주의내용기재 ) 위 한 ( 글 14 point 고딕체 ) 검체수집 질병관리본부 질병관리본부

3 3 -

4 4 - 주의내용

5 1 - 편집순서 2 : 제출문 과제번호 학술연구용역사업최종결과보고서 과제명 영문국문 주관연구기관 주관연구 책임자 기관명소재지대표 원광대학병원익산시신용동 정은택 성명 소속및부서 전공 박도심 원광대학병원진단검사의학과 진단검사의학 연락처 이메일 ds@hanmail.net 연구비 70,000 천원 연구기간 총참여연구원 ( 책임연구원 : 1 명, 연구원 :2 명, 연구보조원 :5 명 보조원 :3 명 ) 비고보안성유 (0) 무 () 2011 년도학술연구용역사업에의하여수행중인학술연구용역과제의 최종결과보고서를붙임과같이제출합니다. 붙임 : 1. 최종결과보고서 12 부. 2. 전자파일 CD 2 매 년 11 월 4 일 주관연구책임자박도심 ( 인또는서명 ) 주관연구기관장정은택 ( 직인 ) 질병관리본부장귀하

6 2 - 편집순서 3 : 목차 목 차 Ⅰ. 연구개발결과요약문 ( 한글 ) ( 영문 ) Ⅱ. 학술연구용역사업연구결과제1장최종연구개발목표제2장최종연구개발내용및방법제3장최종연구개발결과제4장연구결과고찰및결론제5장연구성과및활용계획제6장기타중요변경사항제7장연구비사용내역제8장첨부서류

7 3 - 편집순서 4 : 요약문 과제명 중심단어 주관연구기관원광대학병원주관연구책임자박도심 연구기간 ➀ μμ μ μ μμ ➀ ➁

8 4 - 편집순서 5 : 요약문 ( 영문 ) Title of Project Key Words Institute Wonkwang University Hospital Project Leader Do-Sim Park Project Period From March 7, 2011 through November 6, 2011 ➀ μμ μ ➀ ➁

9 5 - 편집순서 6 : 총괄연구과제의연구결과 학술연구용역사업연구결과. : (target specimen) - (1) plasma: 1000 vial (10 vial *100) serum: 1000 vial (10 vial*100) DNA: RNA: 100 tube + 3 DNA plate(20ug 3 copies) (100 ug *100 20ug EP tube ) 100 tube + 2 RNA plate (2ug 2 copies) (5 ~ 10 ug *100, RIN EP tube ) LCL cell: 200 vial (2 vial*100) cells/vial (2 vial ) LCL cell DNA: 300 tube (100 ug * 100) 20 μg2ep tube 1EP tube (2) : 100%. (target specimen) : 100% (1) - 100

10 6 - plasma, serum : 2, DNA: 100% 260/ () RNA : 100% 260/ RNA integrity number (RIN) 4.0 () RNA RNA Later RNA Kit RNA (2) : 100% 100%

11 7 - Figure 1. An abstract about SPREC (Standard PREanalytical Code); Cancer Epiemiol Biomarker Prev 2010; 19: 건식보관법의필요성및개발 건식보관법의필요성 : 기존냉동법은대형냉동공간필요, 전기력소모, 이산화탄소배출 - 지구온난화유발, 검체이송, 포장, 해동시변성이쉽고회복불가의단점이있음 미국스탠포드대학자료에의하면 350 개의검사실에서 2000 개의냉동고가가동되어 610,000 스퀘어피트의면적을차지하며연간 3,600 metric ton 의이산화탄소배출이외전 기료소요등으로 560 만달러의운영비를소요함 이러한관점에서세계인체자원은행및관련연구자들은건식법보관법의필요성이절실했고최근 DNA와 RNA를건식으로보관하는건식보관법이개발된상태임 (Assessing a novel room-temperature RNA storage medium for compatibility in microarray gene expression analysis. Biotechniques. 2009;47:667-8, 670)

12 8 - Figure 2. Freezing storage that is using as storage method of most of biobanks and annual increase of cumulative cost for bioresource storage. Figure 3. Water bear (tardigrade, left) and Synthetic matrix technique for molecular stabilization. Dried storage was applicated from principle for survival of water bear.

13 9-1. (target specimen) plasma: 1000 vial(10 vial *100) serum: 1000 vial(10 vial *100) DNA: 100 tube + 3 DNA plate(20ug 3 copies) (100 ug *100 20ug EP tube ) plate-biomatrica DNAstable 96 well plate kit RNA: 100 tube + 2 RNA plate (2ug 2 copies) (5 ~ 10 ug *100, RIN EP tube ) plate-biomatrica RNAstable 96 well plate kit LCL cell: 200 vial (2 vial*100) cells/vial (2 vials ) LCL cell DNA: 300 tube (100 ug * 100) 20 μg2ep tube 1EP tube. (target specimen) μ μ

14 10 - μ

15 11 - 샘플 ID 공여자샘플의일련번호 검체분석전변수 ISBER 학회에서는제시한 보관박스 SPREC 기록 tag 번호 성명 공여자성명마지막자제외 나이 나이 성별 남 / 여 DNA 정보 DNA 전체정보 /RNA 전체정보 DNA/RNA Quantity (ug/ml) DNA 정도결과 DNA 보관정보 DNA/RNA 보관정보 ( 질소탱크, 초 저온냉동고등 ) Total DNA 전체유전자양 추출및보관일 유전자추출및보관일 RNA 정보 RNA 전체정보 RNA Quantity (ug/ml) RNA 정도결과 RNA 보관정보 RNA 보관정보 ( 질소탱크, 초저온 냉동고등 ) Total RNA 전체유전자양 Immortalized cell line 정보 Cell 제작전체정보 Cell Quantity Cell의 number Cell 보관정보 Cell 보관정보 ( 질소탱크번호등 ) Cell 배양및보관 Cell 배양및보관정보 Cell line 제작자 Cell line 제작자정보 Table 1 Import data for sample storage

16 12 - 임상정보및데이터 환자의세부임상정보및결과 WBC WBC(/mm3) Eosinophil Eosinophil (/mm3) Hct Hct counts hs-crp hs-crp 정량 AST/ALT/BUN/CR 참고치이상여부및결과 각항목정량, Normal 여부 TC 검사이상여부 각항목정량, Normal 여부 HBs Ag Negative HCV AB Negative HIV AB 10명표준혈장정도관리검체환자 Negative

17 13 -

18 14 -

19 15 -

20 16 - Figure 4 Production Process of standard plasmsa for Quality control research

21 17 - () : ➀,➁, target vial+ 470 vial(300ul * 500, 300uL * 470) 100 vial + 90 vial (300uL * 100, 300uL * 90)

22 18 -

23 19 - ➂

24 20 - ➃

25 21 -

26 22 -

27 Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC) 분리 1. PBS 10mL 50mL falcon tube 에넣고 ACD tube 의전혈 (8mL 정도 ) 을모두 50mL tube 에부음 2. PBS 로 50% 희석된전혈을 15ml tube 에 Ficoll 3ml 가담긴위에주사기로서서 히넣어줌 (ficoll 과섞이지않도록조심스럽게혈액을넣음 ): 2 개의 falcon 튜브에 실시함 g 에서 20 분간원심분리한후 PBMC 층만조심스럽게 suction 수거 3. 1 PBS 로 12mL X 1 회 wash 한다 RP20 로 2mL X 1 회 wash 한다. Lymphoblastoid Cell Line (LCL cell) 제작및배양

28 24 -

29 plasma: 1000 vial(10 vial*100) serum: 1000 vial(10 vial*100) DNA: 100 tube + 3 DNA plate(20ug 3 copies) (100 ug *100 20ug EP tube ) RNA: 100 tube + 2 RNA plate (2ug 2 copies) (5 ~ 10 ug *100, RIN EP tube ) LCL cell: 200 vial(2 vial*100) cells/vial (2 vials ) LCL cell DNA: 300 tube (100 ug * 100) 20 μg2ep tube 1EP tube (1)Plasma plasma ID (2)Serum serum ID (3)DNA 3plate ID (4)RNA 3plate (5)LCL cell LCL (6)LCL DNA LCL DNA

30 26 - serial N B code originaln 0=

31

32

33 29 - B code AST(5 [ALT] CREA(0.5 GLU(70 CHO(1 S-CRP( Bun(8-20 H B s -35IU ( mg/d -100mg mg/ mg/dl) AgII /L) IU/L) L) /dl) mg/dl) L) Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg

34 Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg

35 Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg

36 32 - B code CREA(0. GLU(70- CHO(130 AST(5-3 [ALT](5- Bun(8-20 S-CRP( mg 100mg/ -250mg/ 5IU/L) 40IU/L) mg/dl) mg/l) /dl) dl) dl) HBsAgII Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg

37 Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg

38 Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg

39 35 - Bcode 이름 orino. 날짜 280/ /230 DNA ng/ul 전 한 박 함 현 장 최 문 박 김 노 박 양 신 권 차 전 하 백 유 이 양 김 김 양 탁 김 김 문 문 양 최 김 순 장 서 오 김 신 정 최

40 최 문 김 강 이 국 이 유 정 김 임 김 이 강 곽 성 정 서 허 윤 김 이 박 진 최 이 김 강 정 김 김 정 이 이 김 한 한 홍 이 최 김 지 한

41 조 조 김 김 이 정 조 임 박 최 김 이 김 박 장 진 최

42 target vial (300uL * 500) vial (300uL * 470) vial (300uL * 100) 4-90 vial (300uL * 90) ~

43 39 -

44 40 - (3) (4) target -

45 41-54(20) (20)

46 42 - item AST U/L ALT U/L B u n mg/dl Cr mg/dl G L U mg/dl C H O mg/dl TG mg/dl mean sd cv% item H D L L D L S - C R P LDH U/L mg/dl mg/dl mg/l HBSAG HCV Ab HIV Ab Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg mean sd cv% item AST U/L ALT U/L B U N g l u c o s e cholesterol TG Cr mg/dl mg/dl mg/dl mg/dl mg/dl mean sd cv% item H D L L D L S - C R P LDH U/L mg/dl mg/dl mg/l HBSAG HCV Ab HIV Ab Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg Neg mean sd cv%

47 43 -

48 44 - μ μ μ. Comparison of same volume of DNA using ArchivePure DNA Cell/Tissue Kit, 5 prime, absorbance 260/280 =1.85, 260/230=1.97, total 99 μg) PerfectPure DNA Blood Kit 10mL , 5 prime 260/280 =2.0, 260/230=2.2 total 220μg)

49 45 -

50 46 - (3) : (4) : 4

51 47 - 제 5 장연구성과및활용계획 5.1 활용성과 과제명 과제책임자박도심 / 원광대학병원 / 진단검사의학과 번호논문제목저자명저널명집 ( 권 ) 페이지 Impact factor 1 국내 / 국외 SCI여부 번호발표제목발표형태발표자학회명연월일발표지 1 국내 / 국제 번호출원 / 등록 1 특허명출원 ( 등록 ) 인출원 ( 등록 ) 국출원 ( 등록 ) 번호 IPC 분류

52 활용계획

53 49 -

54 50 - 연구원변경 : 연구원퇴사로인한연구원교체 성명 참여기간 성명 참여기간 김준호백철현 연구보조원 유현동연구보조원 양용근연구보조원 고주희보조원 김민정연구보조원

55 51 - 학술연구용역사업연구비변경 과제명정도관리지표후보물질발굴을위한검체수집 (2011) 과제번호 2011E 발주부서생물자원은행 ( 과 ) 연구수행기관학교법인원광학원연구책임자박도심 연구기간 2011 년 03 월 07 일부터 2011 년 11 월 06 일까지 사업비 70,000( 천원 ) 학술연구용역사업연구비변경사항 비목변경전변경후변경사유 인건비 28,746,123 28,746,123 여비 1,022, ,952 유인물비 800,000 50,000 전산처리비 450,000 - 시약및연구용재료비 29,776,877 32,944,915 회의비 4,900,000 4,491,010 임차료 0 - 교통통신비 720,000 - 의뢰부서추가요청에의한공여자수증가및이에대한처리비용증가 위탁정산수수료 385, ,000 일반관리비 ( 이윤 ) 3,200,000 3,200,000 총액 70,000,000 70,000,000 변경사유 ( 추가사항 ) 세부과제는주관연구기관을통해제출

56 52 -

57 53-1. Betsou F, Lehmann S, Ashton G, Barnes M, Benson EE, Coppola D, DeSouza Y, Eliason J, Glazer B, Guadagni F, Harding K, Horsfall DJ, Kleeberger C, Nanni U, Prasad A, Shea K, Skubitz A, Somiari S, Gunter E: International Society for Biological and Environmental Repositories (ISBER) Working Group on Biospecimen Science : Standard preanalytical coding for biospecimens: defining the sample PREanalytical code, Cancer Epiemiol Biomarker Prev, 19: , Hernandez GE, Mondala TS, Head SR : Assessing a novel room-temperature RNA storage medium for compatibility in microarray gene expression analysis, Biotechniques, 47:667-8, 670, 2009

58 54 - 본학술연구용역사업의성과로기술된게재된학술지논문전체사본 ( 게재허가를받은경우게재 증명서 ) 과산업재산권등록증 ( 또는출원서 ) 사본을반드시첨부할것.

- 1 -

- 1 - - 1 - 목 차 - 2 - 과제명 중심단어 β 주관연구기관 연구기간 β β β β β - 1 - Title of Project Key Words Prion, Neurodegenerative disease, biomarker, β-amyloid, albumin Institute Kyungwon University Project Leader Seong Soo

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