Volume 2 Number 4 April, 2010 KSBSB NewsLetter Korean Society for Bioinformatics and Systems Biology 한국생물정보시스템생물학회 KSBSB 1
K S B S B K S B S B K S B S B KSBSB 한국생물정보시스템생물학회 5대 목표 목표: 국제 수준의 학회 1. 위원회 중심 체제 확립 2. 1,000 명 회원; 400 명 학술대회 참석 3. 학회지, IBC (Interdisplinary Bio Central) SCIE 등재 4. 최고 수준의 전산정보화 5. 연간 예산 규모 2 억원 2010 년 7 월 Summer School 준비 위원회 위촉 - 조직위원장: 조광휘 (숭실대학교) - 학술위원장: 권경훈 (한국기초과학지원연구원) 2010 년도 표준화 사업 관련 표준심의위원회 위촉 - 표준심의위원장: 이근우(경상대학교) - 표준심의위 원: 이인석(연세대학교) 조광휘(숭실대학교) 최선심(강원대학교) 2 Newsletter Vol. 2 No. 4
KSBSB 제 2회 Summer School 개최 일시: 2010 년 7 월 분과위원회 심포지엄 KSBSB BioInfo20100 APBC2011 학회 개최 일시: 장소: 2011. 1. 12-14 인천 송도컨벤시아 (예정) 중요 dates Submission of papers: July 20 2010 Notification of paper acceptance: September 17 20100 Submission of posters: September 30 20100 Camera-ready copy & Author registration: September 30 2010 Notification of poster acceptance: October 20 2010 Conference: January 12 2011 - January 14 2011 6 Newsletter Vol. 2 No. 2
2009 KSBSB ROADMAP 날짜 일정 비고 2008 년 12 월 29 일 저녁 5 시 연세대학교, 노경태 전임회장 및 이상혁 총무간사와 만나 업무 인수인계 협의 29 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 1 호 발간 2009 년 1월 2월 8-9 일 학회워크샵 진주 아시안 레이크사이드 호텔에서 학회 임원/이사들 Kick-off 워크샵 및 이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 2 호 발간 24 일 제 1 회 운영위원회 대전에서 개최 28 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 3 호 발간 2008 년 12 월 5 일 이사회에서 유장렬 차기 회장 선출 2009 년과 2010 년 정기 학술대회임시조직위원장 및 장소를 결정 3월 4월 5월 13 일 집행이사회의 개최 (강릉 경포대 현대호텔 4:30 PM) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 4 호 발간 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 5 호 발간 22 일 집행이사회의 (무주리조트) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 6 호 발간 6 월 13 일 일본 CBI 의 Prof. Masahiro Okamoto and Prof. Akihiko Konagaya 부산 방문 그랜드호텔 실사 및 실무자 회의 27 일 일본 CBI 방문 실무자 준비 회의 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 7 호 발간 7 월 3 일 KSBSB Summer School 개최 (서울대 농생대) 및 임시총회, 집행이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 8 호 발간 8 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 9 호 발간 9 월 25-26 일 집행이사회의 개최 (부산 그랜드호텔) 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 10 호 발간 10 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 11 호 발간 11 월 4-6 일 부산 그랜드호텔 Bioinfo2009 (CBI-KSBSB Joint 학회) 및 정기총회 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 1 권 12 호 발간 2008 년 9 월 17-19 일 연세대에서 CBI 측과 준비모임 추진 (주무간사: 김상수) 4 Newsletter Vol. 2 No. 4
April 2010 12 월 30 일 2011 APBC 국제학술대회 준비모임 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 1 호 발간 2010 년 1 월 20-22 일 강원도 용평리조트 공동심포지엄 개최 및 집행이사회의 개최 (2009 년도 결산보고 및 회계감사) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 2 호 발간 2 월 28 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 3 호 발간 3 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 4 호 발간 4 월 셋째주 집행이사회의 개최 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 5 호 발간 5 월 14 일 집행이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 6 호 발간 6 월 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 7 호 발간 7 월 2 일 분과위원회 심포지엄 개최 예정 및 집행이사회의 개최 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 8 호 발간 8 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 9 호 발간 9 월 유전체학회와 공동심포지엄 개최 (서울 가톨릭대) 및 집행이사회의 개최 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 01 호 발간 10 월 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 11 호 발간 11 월 30 일 KSBSB Online 뉴스레터 2 권 12 호 발간 12 월 3 일 집행이사회의 개최: 차기 회장 및 회장단선출 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 3 권 1 호 발간 2011 년 1 월 12-14 일 인천 송도컨벤션센터 APBC2011 학회 개최 및 정기총회 개최 (2010 년 결산보고 및 회계감사) 31 일 KSBSB Online 뉴스레터 3 권 1 호 발간 유장렬 회장 체제 종료 Banquet 을 선상에서 하는 계획 가능 APBC 2011 년 1월 한국에서 개최 예정 GIW2011 을 2011 년 12 월에 한국에서 개최 예정 KSBSB 5
Invitation to submit IBC as well as you noticed that many of the current publication systems have various limitations and hurdles in reporting scientific and intellectual efforts, while the ways of scientific discovery and communication are rapidly evolving. IBC is born to take a step forward to change the current ways of scientific reporting. IBC is an interdisciplinary medium for open, rapid, and interactive communication and for archiving scientific and technological achievements in the area of interdisciplinary bioscience and bioengineering. IBC covers areas of experimental, theoretical, fundamental and applied science and engineering dedicated to the understanding, analyzing, and applying biological phenomena and medical issues from interdisciplinary perspectives. Biological and medical papers are also covered by IBC, preferably but not necessarily if they may lead to promotion of any aspects of interdisciplinary thinking and research. IBC aims to be a fast, interactive, and live medium with 7-day publication. The acceptance and the on-line posting of a manuscript are completed within 7 business days after completion of manuscript submission. Interactive discussion is intended for an open discussion between authors and readers through readers comments and authors responses through the website. Post-publication supplementation of the manuscript is possible, so that further supplementary data and discussion can be added to the original article to enhance or to modify the discovery. This way, the manuscript is not static, but can reflect further progresses and the results of the interactive discussion. IBC publishes various types of scientific efforts with more flexibility and freedom of presentation. The categories of manuscript includes Regular research articles, Reports on negative results Hypotheses/Ideas, Experimental methods, Reviews, Prospects, 6 Newsletter Vol. 2 No. 4
April 2010 News and Views, Tutorials, Essays, and Addenda, etc. e-depot is intended to archive various types of research and scholarly activity materials for long-term preservation of, providing proper credit to, and free public access to formally unpublished research findings. These include provisional manuscripts, preliminary results, experimental notes, short ideas, posters, proceedings, presentations (texts, videos, or audio files), images, protocols, research tips, lecture, conference report, and education materials. e-depot is a citable archive with DOI designations but is not subjected to peer-review. The editor makes the final decision within 7 business days upon receiving the materials. The authors take full responsibility for the ownership and copyright for any of the materials they deposit in the e-archive. So I would cordially invite you to share the vision of IBC and to report your precious intellectual efforts in IBC. More information on IBC can be found at http://www.ibc7.org Instructions for submission can be found at http://www.ibc7.org/pds_board/class_view.php?code=board_006&pid=5&page=1 Please feel free to contact me if you have any questions or suggestions ibc@ibc7.org. KSBSB 7
20100 KSBSB 최신정보 OMICS 출처: GenoveWeb Daily News BioIn(생명공학정 정책연구센터) Science, Bio-IT World Weekly 동아사이언스 8 Newsletter Vol. 2 No. 4 인간 장내 세균의 메타게놈학적 분석 메타게놈을 연구하고 이해하기 위해 구성된 국제연구컨소시 시엄은 MetaHIT (metagenomics of the Human Intestinal Tract Consortium)을 중심으 로 새로운 국제적 연구진이 공동연구를 통하여, 인간 장내 세균의 분 포 양상을 밝혀 내었다. 이 연구진은 스페인과 덴마크에 살고 있는 건강하거나, 비만, 혹은 장명 (Inflammat tory bowel disease, IBDP 에 걸린 사람 등 모두 124 명의 분변을 수집하여, 그 안에 있는 모든 균들의 DNA 염기서열을 분석하였다. 총 576.77 Giga Basepair 로 330 만개의 서 로 다른 유전자를 찾아 내었다. 이를 개인으로 나누면 한 개인의 장 내균총 게놈의 유전자는 536,000 개 종류인 셈으로, 인간 유전자 25,000 종류를 생각하면 얼마나 많은 박테리아 유전자가 생체 내에서 작동하고 있는지 짐작할 수 있다. 개인별로 존재하는 균종을 살펴본 결과, 약 38% 의 균종을 서로 공통으로 가지고 있었으며, 균종의 분포 와 개인의 건강상태와 상당히 큰 관련성이 있음을 알 수 있다. 즉, 장 내 질환을 가지고 있는 사람의 장내균총은 정상인의 다양성 분포와는 확연히 달라서 장내균총 분포에 대한 분석만으로도 IBD 와 종양성장 염, Crohn 씨 병을 가진 환자를 구분할 수 있었다. Nature 464:59-67 미 연구진, 유전병 환자 게놈 전체해독 미국의 연구진 두 곳이 유전성 질병의 정확한 유전적 원인을 밝혀내 기 위해 유전병 환자의 게놈(유전자) 전체를 해독하는 데 성공했다고 뉴욕타임스(NYT) 인터넷판이 10 일 전했다. 베일러의대의 리처드 기 브스 박사는 유전성 신경병인 비골근위축증에 걸린 동료 유전의학자 제임스 룹스키 박사의 유전자를 해독, 이날 뉴잉글랜드 의학저널에 결과를 발표했다. 비골근위축증을 앓고 있는 룹스키 박사는 'SH3TC2' 라 불리는 유전자에 돌연변이가 있었는데, 부모 양측으로부터 모두 돌연변이 유전자를 물려받은 것으로 나타났다. 같은 날 시애틀에 있 는 시스템 생물학 연구소의 리로이 후드와 데이비드 갤러스 박사는 밀러증후군과 섬모이상운동 동증을 각각 지닌 아이 두 명과 그들의 부모 의 게놈을 해독, 사이언스지에 결과를 발표했다. 연구진은 관련된 4 개의 유전자 중 질병을 일으킨 유전자를 찾아냈을 뿐 아니라 부모에 서 자식 세대로 전해지는 DNA 의 돌연변이 수를 처음으로 직접 추산 했다. 이들은 인간 유전자 30 억 개 중 세대 당 60 개가 돌연변이에 의해 변형되는 것으로 추산했는데 이는 과거 견해에 비해 상당히 적 은 수치다. http://news.hankooki.com/lpage/health/201003/h2010031116495284500.htm
April 2010 노화 조절 단백질 발견 한국과학기술원(카이스트)을 최연소 졸업한 한 국인 과학자가 노화를 조절하는 기능을 지닌 단백질을 발견했다. 이 연구 결과를 담은 논문 은 세계적인 과학저널 <사이언스> 표지에 실렸 다. 올리거나 표적단백질을 내려주는 약물을 투여 하면 이런 증상이 일부 호전된다는 사실도 알 아냈다. 연구 성과는 이준희 연구원을 제 1 저자 로 <사이언스>에 5 일차(미국시각) 표지논문으 로 실렸다. http://hani.co.kr/arti/science/science_general/409152.ht ml 세계 최초로 팬더 게놈 분석! 미국 샌디에이고 캘리포니아주립대(UCSD) '유전 자통제 및 신호변환 연구실'의 이준희(31) 연구 원은 9 일 '세스트린'이라는 단백질이 노화 및 근육 감소, 동맥경화 등 노화 관련 질병을 일으 키는 단백질들을 조절한다는 사실을 초파리 연 구를 통해 알아냈다고 밝혔다. 세포에 에너지가 부족해지면 '에이엠피케이'(AMPK)라는 단백질 이 활성화되면서 노화가 늦춰지고, 과다영양 상 태가 되면 '표적단백질'(TOR)이 활성화되면서 노화가 촉진된다는 사실은 밝혀졌지만, 이 두 단백질의 활성을 균형 있게 유지하는 방법에 대해서는 그 동안 알려지지 않았다. 연구팀은 사람의 세스트린과 구조와 생화학적 기능이 똑 같은 세스트린을 가진 노랑초파리에서 이 단백 질을 없앤 뒤 관찰을 했다. 그 결과 초파리가 성장하는 데는 이상이 없었으나 지방축적, 부정 맥, 근육퇴화, 심박수 감소 등 노화와 관련된 병리이상이 발견됐다. 연구팀은 에이엠피케이를 2010 년 3월 6일 사이언스데일리(ScienceDaily) 에 따르면, 자이언트 팬더(giant panda)의 유명한 편식 식습관을 포함하여 잘 알려지지 않은 생 물학적 특성에 대한 새로운 연구 결과가 영국 카디프대학교(Cardiff University) 과학자를 포함 하는 중국이 이끄는 연구팀에 의해 밝혀졌다고 한다. 연구팀은 팬더 게놈(genome)을 세계 최초 로 밝히는데 성공하였으며, 이 게놈 정보를 이 용한 유전적 통찰을 통해 멸종 위기에 처한 종 의 보존에 도움을 줄 수 있기를 기대하고 있다. 팬더는 진짜 곰으로 사실은 육식동물이다. 그래 서 육식을 위한 유전자들을 가지고는 있지만, 실제로 팬더는 채식만을 하고 있다. 이 사실은 팬더가 대나무를 소화시킬 때 어떤 유전적 기 질보다도 소화관 내의 미생물에만 의존하고 있 다는 것을 의미할 수 있다. 라고 브루포드 (Bruford) 교수는 말했다. 인간이든 동물이든 식 습관 형성에 있어 음식의 맛은 중요한 역할을 한다. 연구진은 팬더의 T1R1 유전자에서 돌연 변이를 발견하였다. 이 유전자는 고기의 맛을 느끼게 하는데 영향을 미치며, 이 유전자가 손 상이 되었을 경우, 왜 팬더가 육식동물임에도 불구하고 대나무를 지나치게 먹는 식습관을 가 지게 되었는지에 대해 설명할 수 있다 라고, KSBSB 9
영국 카디프대학교 마이크 브루포드 박사는 말 한다. Citing URL : http://www.bric.postech.ac.kr/trend/news/v iew_kisti.php?board=news&id=166027 Notch 가 두 가지 상반된 기능을 한다? Notch 단백질의 상반된 기능이 바르셀로나 생 물의학 연구소 Marco Milan 박사 팀에 의해서 밝혀졌다. 발생 중인 날개에서 클론 분석(Clonal Analysis)이라는 기술을 통해서 정상적인 세포 집단들 중에서 일부 세포 무리를 조작하여 Notch receptor 가 발현되지 않게 했다. 그 결과 예상대로 Notch receptor 없는 세포는 그 Notch pathway 가 활성화 되지 않았다. 그러나 흥미롭 게도 Notch receptor 가 없는 세포와 인접하고 있 는 세포에서 Notch pathway 가 활성화 함을 관찰 하였다. 이 결과는 Notch receptor 가 Notch ligand 를 sequester 함으로써, ligand 가 인접한 세포에 발현되고 있는 Notch receptor 와 결합하는 것을 방해하는 기능을 가지고 있음을 말해주는 결과 이다. Notch receptor 가 발현되지 않는 세포는 결 국 그 세포 내에 존재하는 Notch ligand 를 sequester 할 수 없으므로, ligand 가 이웃하는 Notch receptor 를 발현하는 세포의 Notch pathway 를 활성화시켰음을 의미하는 것이다. Notch 활 성화 기작은 종에 상관없이 보존되어 있다고 알려진다. 고등 동물이나 식물세포에서도 비슷 한 기능을 하고 있을 것으로 추정된 바, 이후 Notch receptor 활성화 관련 연구에 기여할 것으 로 생각된다. Current Biology, 2009. doi: 10.1016/j.cub.2010.01.058 mirna 를 자르는 Dicer 가 Caspase 와 만나면 DNA 도 자른다? 콜로라도 대학 볼더 캠퍼스(CU-Boulder)의 분자, 세포, 개발 생물학과 슈(Xue) 교수 그룹이 3 월 12 일자 Science 지에 발표한 논문은 Caspase 와 Dicer 에 관한 매우 흥미로운 연구 결과를 보여 준다. Caspase 는 세포단백질을 자르고 파괴하면 서 세포사멸을 실행하는 효소(executioner enzyme) 이다. 그런데, 이 Caspase 가 mirna processing 에 매우 중요한 기능을 하는 것으로 알려진 Dicer 의 활성을 바꿀 수 있음을 보여주는 실험 결과가 나왔다. Dicer 를 Knock-out 한 C. elegans 는 programmed cell death 가 일어나지 않았고, 염 색체를 자르는 과정이 억제되어 있음을 발견하 였다. 이 연구는 Caspase 가 RNA 절단 효소인 Dicer 를 쪼개는 것이 가능하며 Dicer 를 DNA 절단 효소로 바꿀 수 있다는 것을 보여준 첫 번째 연구라 할 수 있다. Caspase 가 Dicer 와 만 나게 되면, RNA 를 쪼개는 다이서의 기능이 없 어지게 되고, 대신에 DNA 가 가득한 염색체를 자르고 파괴하는 능력을 Dicer 가 가지게 된다. Citing URL : http://www.bric.postech.ac.kr/t rend/news/view_kisti.php?bo ard=news&id=166510 10 Newsletter Vol. 2 No. 4
April 2010 GWAS 연구를 위한 새로운 통계적 기법 개발 인간의 질병과 관련이 있는 유전적 요소를 동 정하기 위한 노력으로 유전학자들이 근래 가장 많이 사용하는 연구기법이 바로 GWAS (Genome-wide association studies)이다. 이는 수천 의 개체를 가진 집단에서 수백만 개의 genetic marker 를 스캐닝하는 방법으로 이루어 진다. 이 들 연구는 일반적으로 서로 다른 두 집단 간에 존재하는 genetic variants 의 빈도를 비교하며, 어 떤 variant 의 빈도에 유의한 차이가 두 그룹 사 이에 발견되면, 그 variant 가 바로 질병과 연관 이 있다고 해석한다. 이러한 연구를 통해 지난 수년 동안 asthma, cancer, diabetes, heart disease 와 같은 질병과 관련 있는 marker 들을 찾아왔다. 하지만, 이러한 genetic variant 빈도의 차이는 질 병과 상관 없는 다른 이유들 예를 들어, 집단의 지역적 분포 즉 population structure 에 의해서도 생겨날 수 있다는 방법적인 한계가 있었다. 이 를 극복하기 위하여 Nature genetics 4 월호에 발 표될 Eskin 그룹의 연구는 population structure 에 의해 야기될 수 있는 문제를 해결할 수 있는 새로운 통계적 기법에 기반을 둔다. 기존의 GWAS 연구가 집단 내 개인들이 서로 unrelated, 즉 서로 관련이 없다는 가정 하에 이루어졌다 면, Eskin 그룹은 기본적으로 집단 내 개인들은 어느 정도 서로 relatedness 가 있다는 가정을 바 탕으로 새로운 통계적 기법을 개발한 것이다. 이는 인간 집단 내의 개인들이 아주 복잡한 역 사 속에서 서로 어느 정도 관련성을 가지고 있 을 수 밖에 없음에 근거한다. http://www.eurekalert.org/pub_releases/2010-03/uoc-- nsm031710.php 무엇이 우리를 서로 다르게 만드나? -유전자만이 차이를 만드는 것이 아니다? 2001 년 인간 게놈의 draft 가 완성된 이래로 인 간만의 특성을 만드는 데 관여하는 유전자를 찾는 연구가 활발히 진행되었다. 독일의 EMBL 팀과 미국의 Yale 대학, Stanford 대학 연구팀의 공동 연구를 통하여 차이를 만드는 것은 유전 자가 아니라 어떻게 그 유전자의 발현을 조절 하느냐에 있다는 것을 밝혔다. 이들 연구는 Science 에 발표되었고, 최초로 전체 인간 genome 을 서로 비교하여 인간과 인간 사이에 유전자 발현의 차이를 일으키는 DNA 서열의 차이가 어떤 부분에 존재하는지 밝혀 내었다. 이들 연구진은 10 명의 사람의 전체 genome 을 sequencing 하고 서로 비교함으로써, 10 명 간에 유전자 발현 조절의 차이를 일으키는 noncoding 부위를 찾고자 하였다. 이들 연구에 따 르면, 인간 전체 유전자의 약 1/4 에 해당하는 유전자가 서로 다른 사람에게서 서로 다르게 발현이 조절되고 있다. 이는 유전자의 차이보다 훨씬 큰 차이로 개개인의 차이가 유전자의 차 이가 아니라 발현의 차이라는 것을 시사하는 결과이다. http://www.eurekalert.org/pub_releases/2010-03/emblwmu031810.php 한반도 자생생물 600 종 족보를 새 로이 밝히다 국립생물자원관(관장 김종천)은 2009 년도 한반 도 생물다양성 기원 규명: 한반도 주요 생물군 계통수 작성 사업을 통해 한반도 자생생물 600 종에 대한 계통유연관계를 확인하였다고 밝혔 다. 한반도에 자생하는 생물종들의 기원을 찾음 으로써 궁극적으로 우리나라 생물주권을 확립 하는 기반을 마련하고, 그 과정에서 얻어지는 정확하고 풍부한 생물학적 정보들은 생물 관련 산업에 매우 유용하게 이용되어 진다. 실제로 옥수수나 감자 등 식량자원의 우수한 품종개발 이나 인간질병 치료 연구, 생태계 보전 등 다양 한 분야에서 계통연구는 필수적이며 중요한 정 보를 제공한다. 국립생물자원관 유전자원연구팀 은 2008 년도에 이어 2009 년에는 우리나라 자 생생물 600 종에 대한 계통유연관계에 대한 연 구를 마쳤다. 잠자리류 및 나비류의 전체 계통 유연관계에 대한 연구가 본 사업을 통해 시도 되었으며, 특히 거미류, 버섯류, 해조류에 대한 집중적인 연구를 통해 흥미로운 결과들을 얻었 다. 우리나라에 서식하는 거미류 22 과 123 종의 계통유연관계를 분석해본 결과 이곳 저곳 방랑 하며 사는 배회성 거미들과 한 지역에 집을 짓 KSBSB 11
고 사는 정주성 거미들로 크게 나뉘어져 그룹 을 형성하는 결과를 발견했다. Citing URL : http://www.bric.postech.ac.kr/myboard/read.php?board =news&id=166386 Bio-Nano KRISS, 동맥경화 혈관 내 3 차원 나노이미징 및 분석기술 개발 동맥경화 혈관 내에 숨어있는 지방을 나노 수 준까지 정밀하게 이미징 하고 성분분석까지 동 시에 실시할 수 있는 측정기술이 개발되었다. KRISS(한국표준과학연구원, 원장 김명수) 미래 융합기술부 나노바이오융합연구단 김세화 문대 원 박사팀은 CARS 현미경(비선형광학현미경)을 이용해 동맥경화 혈관 내 지방을 3차원으로 이 미징하고 화학성분을 동시에 분석할 수 있는 심혈관 조직검사 원천기술을 개발하였다. 이를 활용하면 기존 염색 현미경 진단방법으로는 관 찰하기 힘든 세포 수준의 발병 초기 단계부터 지방 축적 과정으로 인한 심화단계인 지방고형 물(lipid crystal) 형태까지의 과정을 3 차원으로 이미징할 수 있다. 또한 세포 수준에서 단층촬 영이 가능해 지방 알갱이 하나의 성분까지도 파악할 수 있다. 이를 통해 동맥경화 초기 단계 이더라도 지방의 형태에 따라 진행 단계를 정 확히 파악해 신속한 조치가 가능해질 수 있다. Citing URL : http://www.bric.postech.ac.kr/myboard/read.php?board =news&id=166515 Chem. Informatics 작년 바이오 약물시장 두자릿 수 성장 컨설팅 업체인 라메리에(lamerie)가 최근 발간한 새로운 보고서에 따르면 14 대 계열 바이오 약 물 시장은 917 억 8000 만 달러로 전년도 828 억 5000 만 달러와 비교해 10.78% 성장했다. 바이 오 약물 시장의 주요 변화는 2 위에 머물던 항 암제가 1 위로 등극했으며 항응고제, 항소염제 등이 성장을 주도했다. 반면 항 TNF 억제제, G- CSF 등은 하락세를 보였다. 주요 약물 계열별 매출을 보면 암 항체(Cancer Antibodies)는 2009 년 총 181 억 달러로 전년도 156 억 달러보다 11.32% 증가했다. 이 계열 약물은 맙테라/리툭 산(Rituxan/MabThera), 허셉틴(Herceptin), 아바스 틴(Avastin), 어비툭스(Erbitux), 벡티비스(Vectibix) 등이 있다. 바이오 약물 시장에서 선두를 고수 하던 류머티스 관절염 등 항-TNF 억제제 약물 시장은 작년 매출이 181 억 달러로 전년(163 억 3000 만 달러)에 비해 10.63% 성장했으나 2 위 로 밀려났다. 이 계열 약물은 엔브렐, 레비케이 드, 휴미라, 심지아 등이 대표적이다. 3 위는 휴 마로그, 휴물린 등 인슐린 시장이 133 억 4000 달러로 전년(109 억 달러)대비 22% 성장했다. 신장암 수술 후 혈액감소증 치료제인 EPO (Erythropoietins) 시장은 95 억 달러로 제네릭 경 쟁으로 전년 100 억 달러보다 5% 이상 감소했 다. 5 위인 아보넥스 등 인터페론 베타 시장은 60 억 달러로 전년 대비 13.3% 성장했다. 이어 항응고제 시장은 57 억 3000 만 달러(+16%), G- CSF 51 억 6000 만 달러, 항소염제(Anti- Inflammatory Antibodies) 31 억 2000 만 달러 (+36.24%), 인간성장 호르몬(Human Growth Hormone) 28 억 9000 만 달러(+7.8%), 인터페론 알파 26 억 달러(+1.9%) 등이 10 위권 시장을 형 성했다. 이밖에 효소보충제(Enzyme Replacement) 시장은 24 억 2000 만 달러, 눈 항체(Ophthalmic Antibody) 23 억 4000 만 달러, 난포 촉진 호르몬 (Follicle Stimulating Hormone) 12 억 달러, 항바이 러스 항체 10 억 800 만 달러 등의 순이었다. http://www.pharmstoday.com/news/articleview.html?id xno=68192 U-Health '사이코패스' 치료 가능성 열었다 한국과학기술연구원(KIST 원장 한홍택)은 신경 과학센터 센터장 신희섭 박사팀이 타인의 공포 를 공감하는 능력에 관여하는 뇌 회로들과 그 기작을 최초로 규명했다고 2 일 밝혔다. 프로셀 12 Newsletter Vol. 2 No. 4
April 2010 제약(대표 조대웅), 하버드 의대 등 국내외 연구 진과의 공동연구를 통해 진행된 이번 연구는 교육과학기술부가 주관하는 '국가과학자지원사 업'의 지원을 받아 수행됐다. 이 연구결과는 네 이처 뉴로사이언스(Nature Neuroscience) 온라인 판 1 일자에 게재됐다. 연구팀에 따르면 사람은 살면서 자신이 직접 공포나 고통을 경험하지 않더라도 공포나 고통을 받는 다른 사람들을 보면서 이를 간접적으로 느낄 수 있다. 하지만 ' 사이코패스'는 다른 사람의 공포와 고통에 무감 각하고 양심의 가책을 느끼지 않기 때문에 자 신이 저지른 죄의 대가로 받게 될 처벌을 두려 워하지 않고, 연쇄범죄를 저지를 가능성이 높은 것으로 알려져 있다. 연구팀은 공포 감정이입에 있어 뇌신경의 '내측통증체계(medial pain system)' 가 관여하며, 여기에 'L-타입 칼슘이온통로(Ltype Ca2+ channel)'가 중요한 역할을 한다는 사 실을 밝혀냈다. 타인의 공포를 공감하는 뇌 회 로와 그 메커니즘을 규명해 '사이코패스'를 치료 할 수 있는 가능성을 연 것이다. http://www.asiae.co.kr/news/view.htm?idxno=2010030 210083615259 정신분열증 증상이 청년기에 나타 나는 이유 학술지 Neuron 2 월 25 일 자에 발표한 또 다 른 연구에서, 연구팀은 쥐의 전전두엽에서 DISC1 유전자를 일시적으로 차단시켜 새로운 정신분열증 동물 모델을 만들었다. 이마 가까운 데 위치하고 있는 전전두엽은 정상인과 비교해 정신분열증환자에서 차이가 보여지는 뇌 영역 이다. 연구자들은 RNA 간섭을 이용해 새로운 동물 모델을 만들어 냈는데, DISC1 유전자를 차 단시키기 위한 짧은 RNA 단편을 임신 후 2 주 에 쥐 태아에서 발생하는 뇌 공동에 주입하였 다. 그들은 이 RNA 단편이 전전두엽에서 세포 안으로 이동한다는 것을 보였다. 유전자의 차단 은 일시적이며, 유전자의 기능은 출생 후 2 주 혹은 3 주 안에 완전히 복구된다. 유전자가 재 활성화된 후에 다양한 시점에서, 과학자들이 동 물의 뇌와 행동을 시험해 정상 쥐와의 차이를 보았다. 연구팀은 동물이 청년기에 접어들 때, DISC1 을 차단한 그룹에서 신경세포 소통을 위 한 화학적 신호전달물질인 도파민을 생산하는 전전두엽에서 신경세포가 확연하게 미숙하다는 것을 알아냈다. 그러므로 동물은 중간신경원의 결핍 증후를 보인다. 또한 실험군은 정상 쥐와 비교해 청년기에 여러 행동학적 차이점을 보인 다. 예를 들어 실험군은 자극원에 더 강력하게 반응하고 더한 운동성을 보인다. 흥미롭게도 이 작용들은 정신분열증을 치료하는 약물인 클로 자핀(clozapine)을 동물에 주입했을 때 얼마간 완화되었다. 연구팀은 두 연구 모두 DISC1 유전자에 의해 영향을 받은 이 해부학적 차이가 출생 전에 시 작되는 문제를 만들지만 오직 청년기에 나타난 다는 것을 제안한다고 언급했다. 만약 이 해부 학적 차이로 이어지는 신호전달 경로에 대해 더 이해할 수 있다면, 결국 정신분열증의 과정 을 변형시킬 수 있고, 청년기 동안 증상을 줄이 거나 막기 위해 중재할 수 있을 것이다 논문 1: Nature Neuroscience, Volume 13, Pages: 327?332, 2010 논문 2: neuron Neuron, Volume 65, Issue 4, 480-489, 25 February 2010 Citing URL : http://www.bric.postech.ac.kr/trend/news/view_kisti.php?board=news&id=165404 초파리도 겨자 는 맵다 미국 브랜다이스대 국가행동유전학연구실의 강 경진 연구원은 21 일 사람이 겨자, 고추냉이, 계 피를 먹거나 최루가스, 담배연기를 쐤을 때 고 통을 일으키는 화학적 통각 수용체(TRPA1) 가 초파리와 말라리아모기에도 존재하고, 화학 적 고통을 느끼는 원리도 똑같다는 사실을 규 명했다고 밝혔다. 사람과 달리 닭이 고추씨를 잘 먹는 것은 매운 맛을 느끼는 캡사이신 수용 체가 없기 때문이다. 조류와 인류는 매운 맛에 대한 감각 기능이 달리 진화해왔다는 것을 알 수 있다. 그러나 강 연구원은 계피 등에 대한 감각의 경우 초파리나 사람이나 똑같다는 사실 을 행동 신경유전학이라는 방법을 통해 알아냈 다. 초파리는 발에 미각 수용체가 있어 발을 설 탕물에 담그면 주둥이를 쭉 내민다. 강 연구원 은 이런 특성을 이용해, 설탕물에 계피나 고추 냉이에서 뽑은 화학물질을 넣었을 때 초파리들 KSBSB 13
이 회피하는 반응을 관찰했다. 또 TRPA1 항체 를 이용해 고통을 느끼는 감각신경세포를 찾아 냈다. 강 연구원이 속한 연구팀은 계통발생학적 분석을 통해 좌우대칭인 동물들의 공통 조상이 이미 5억년 전에 화학적 통각 기능을 갖게 됐 다는 것을 증명했다. 연구팀의 논문은 강 연구 원을 제 1저자로 과학저널 <네이처> 25 일차(영 국 현지시각)에 실릴 예정이다. 이에 앞서 지난 주 <네이처>는 우수논문 미리보기 서비스인 어드밴스트 온라인 에 강 연구원 논문을 소 개했다. http://hani.co.kr/arti/science/science_general/411418.ht ml 의 창업성공률 제고 및 기술경쟁력 강화에 노 력하고 있다. Citing URL : http://www.bric.postech.ac.kr/myboard/read.php?board =news&id=166226 Education / Etc. 생명연 바이오벤처센터, 10 년 연속 최우수 창업보육센터로 선정 한국생명공학연구원(생명 硏, 원장 박영훈, www.kribb.re.kr) 바이오벤처센터는 중소기업청 에서 매년 창업보육 사업자를 대상으로 실시하 는 중소기업청 지정 전국 260 여 개 창업보육센 터의 운영평가에서 2000 년 6 월 바이오벤처센 터 개소이래 국내에서 유일하게 10 년 연속 최 우수창업보육센터(BI: Business Incubator) 운영기 관으로 선정되었다고 밝혔다. 생명 硏 바이오벤 처센터는 생명 硏 연구성과의 조기확산을 통한 바이오산업 활성화와 기술중심의 바이오벤처기 업 육성을 목적으로 1999 년 설립되어 창업보육 시설(2,970 m2)과 대규모 발효시설(2.5t) 및 분리 정제시설을 갖춘 생물시험공장(1,650 m2)으로 구 성되어 있다. 생명 硏 은 바이오벤처센터 운영을 통하여 바이오기업에게 입주공간 및 산업화 시 설 등의 창업인프라 지원뿐만 아니라, 경영 및 마케팅 지원, 해외시장진출 및 투자유치 지원, 산업화 연구 및 생산공정개발 지원, 산업화 장 비 및 시제품생산지원, 산업화 전문인력양성, 산업화 기술정보 및 애로기술 지원 등 연구개 발에서 생산, 마케팅에 이르기까지 전주기적 창 업보육지원체계 구축을 통하여 바이오벤처기업 14 Newsletter Vol. 2 No. 4
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2009-2010 생물정보시스템생물학회 위원회 명단 회 장 유장렬 한국생명공학연구원 고 문 김삼묘 경북대학교 전산학과 이광형 KAIST 부회장(해외협력부회장) 노경태 연세대학교 부회장(출판부회장) 남홍길 포항공과대학교 감 사 김승호 한국생명공학연구원 이상엽 한국과학기술연구원 기획 이사 총무 이사 재무 이사 학술 이사 이도헌 KAIST 이현주 광주과학기술원 김지현 한국생명공학연구원 유재수 충북대학교 김영주 한국생명공학연구원 이상주 KISTI 김동섭 KAIST 홍순찬 한국과학기술정보연구원 이상혁 이화여자대학교 최 선 이화여자대학교 김주한 서울대학교 조광현 KAIST 대외협력이사 김희발 서울대학교 조용민 축산과학원 김희남 고려대학교 이채영 숭실대학교 홍보 이사 산학 이사 국제 이사 출판 이사 이근우 경상대학교 이봉희 가천의과대학교 김양석 경희대학교 김형태 마크로젠 박홍석 한국생명공학연구원 김철민 부산대학교 인영용 (사)분자설계연구소 최선심 강원대학교 한윤수 중앙대학교 이인석 연세대학교 주 현 인제의대 표준화 이사 권경훈 기초과학지원연구원 김용주 기술표준원 조상연 연세대학교 신임 이사 이병욱 KOBIC 추인선 KOBIC 유웅식 가천의과대학교 16 Newsletter Vol. 2 No. 4
April 2010 2009 년 정기학술대회 조직위원 김상수 숭실대학교 주 현 인제의대 김철민 부산대학교 이근우 경상대학교 황대희 포항공과대학교 이현주 광주과학기술원 김희발 서울대학교 김양석 경희대학교 박근준 질병관리본부 오석준 인제의과대학교 한균희 연세대학교 Systems Biology 부회장 이상혁 이화여자대학교 Systems Biology 이 사 황대희 포항공과대학교 윤성로 고려대학교 조광현 KAIST Omics 부회장 권경훈 기초과학지원연구원 Omics 이 사 김희발 서울대학교 김동섭 KAIST 고광일 고려대학교 송미영 한의학연구원 유웅식 가천의과대학교 Chem.Informatics & Drug Discovery 부회장 윤창노 한국과학기술연구원 Chem.Informatics & Drug Discovery 이 사 이근우 경상대학교 조광휘 숭실대학교 윤석준 숙명여자대학교 조은성 고려대학교 장익수 부산대학교 나노 Bio 부회장 박제균 KAIST 나노 Bio 이 사 박성수 이화여자대학교 정효일 연세대학교 서태석 KAIST 이창수 충남대학교 U-health 부회장 박선희 한국전자통신연구원 U-health 이 사 정호열 한국전자통신연구원 박수준 한국전자통신연구원 KSBSB 17
한국생물정보시스템생물학회 뉴스레터 제 2 권 4 호 발행인 발행일 발행처 편집위원 제 작 유장렬 2010 년 3 월 31 일 한국생물정보시스템생물학회 최선심, 주 현, 한윤수, 이인석, 김영주 윤미경 한국생물정보시스템생물학회 대전시 유성구 어은동 52 한국생명공학연구원내 Tel. 042-860-4431 Fax. 042-860-4608 18 Newsletter Vol. 2 No. 4