PowerPoint 프레젠테이션

Size: px

Start display at page:

Download "PowerPoint 프레젠테이션"

수진 시
5 years ago
Views:

1 lacz 를이용한 color selection ( 클로닝 ) Lac operon은 E. coli가 lactose를 galactose와 glucose로분해하는데필요한효소인 beta-galactosidase를만드는유전자 Lactose가없을때에는불필요한유전자인 beta-galactosidase는생성되지않음 그이유는유전자의앞쪽에있는 inhibitor region에서생성된 inhibitor가 promotor 영역의 operator 부분에결합하여 RNA polymerase 가활동하는것을방해하여 beta-galactosidase가생성되지않도록하기때문임 유전자조절기구를실험에이용하고자하는것이바로 LacZ 임 이부분을 plasmid에삽입, LacZ operon이동작하고있는가확인하기위해서는 IPTG와 X-Gal이라는두가지물질을사용. IPTG: LacZ gene inducer역할, Lactose 대신 inhibitor와결합하지만분해되지않음 X-Gal(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-D-galactopyranoside) : lactose 대신 beta-galactosidase에의하여대사되는물질, 일종의변형된 galactose sugar로서원래무색이지만 beta-galactosidase에의하여대사되면푸른색을냄 따라서 LacZ의 MCS에 DNA가재조합되지않은박테리아의 colony는 LacZ가제기능을발휘하여 X-Gal 을대사시키므로푸른색이되고, DNA가재조합된박테리아의 conony는 LacZ가망가져서기능하지않아 X-Gal이그대로남아있어서흰색 colony가됨. 이렇게색깔의차이로 DNA가 plasmid 에들어가서세포내에서증폭되어기능하는지알수있음

coli에서나머지부분 (omega fragment) 을만들어보완하면완전한 beta galactosidase의기능을할수있게됨.

2 lacz 를이용한 color selection ( 클로닝 ) lacz는 Lac operon의일부, Lac operon 은너무커서 plasmid에다넣지못함. plasmid에서작은부분 (alpha fragment) 을만들고, E. coli에서나머지부분 (omega fragment) 을만들어보완하면완전한 beta galactosidase의기능을할수있게됨. alpha complementation Ampicllin 처리에 colony 를형성한것중에서 X- Ampicillin과 X- Gal/IPTG시약으로원하는세포를고르는과정 Gal/IPTG 처리로흰색을보이는 colony가원하는 gene이 plamid에재조합되어들어가있는 cell인것

3 lacz 를이용한 color selection ( 클로닝 ) LacZ를이용하여재조합 plasmid가들어간 colony를선택하기위해서는그림처럼배양접시에 X-Gal과 IPTG 시약을넓게바른후그위에세포를골고루펴서발라준다 (spreading), X-gal은빛을받으면못쓰게되므로배지에직접첨가하지않고 E. coli 세로를배지에도포할때함께도포해줌 37 C 배양기에서뒤집어밤새키우면

4 Lac operon 은젓당 (lactose) 은있고포도당이없을때만유도 Glucose 와 lactose 가동시에존재하면 (lac operon 의발현에의해대사물질이분해 Lactose galactose+glucose) lac operon 은작동하지않음 (glucose 에의해 lac 단백질합성이억제됨 분해대사물억제 ) Positive regulation( 양성적조절 ) : 다른종류의단백질과 DNA의상호작용에의해조절 Lac promoter 자체는 RNA 중합효소에약하게결합되기때문에억제물질 (repressor protein+lactose) 이작동유전자부위에결합하지않는다하더라도즉시전사가일어나지못함 대사물활성자단백질 (catabolite activator protein, CAP ) 필요 CAP은 RNA 중합효소가 promoter에효율적으로결합할수있도록도와주는부속단백질, 포도당이없을때에만 promoter 부위에결합 세포내포도당의농도가떨어지면 ATP 대사유도체인환상 AMP(cyclicAMP;cAMP분자증가 camp가 CAP에결합해야만 CAP가 lac promoter에결합하여전사를촉진 유전자발현

Regulation mechanism of trp operon 1) Negative regulation 대장균은트립토판이주위에흔하지않기때문에자신이 트립토판을생성해야함. 트립토판생산경로에관계하는효소에대한암호화부위 는폴리시스트론인 trp 오페론안에위치.

5 Regulation mechanism of trp operon 1) Negative regulation 대장균은트립토판이주위에흔하지않기때문에자신이 트립토판을생성해야함. 트립토판생산경로에관계하는효소에대한암호화부위 는폴리시스트론인 trp 오페론안에위치. trp promoter 는 RNA 중합효소에대해상대적으로높은결 합력을가지고있어서오페론을전사시키기위해 CAP 같은 활성화단백질을필요로하지않는다. trp operon 은충분한양의트립토판을생산할수있도록활 발하게전사 주위에트립토판이나타나면 trp 억제물질 과트립토판이결합하여공동억제물질 corepressor 을형성 하여전사를중단시킨다. 주위의트립토판농도가떨어 지면억제물질과트립토판이분리되고전사가다시시작.

6 Regulation mechanism of trp operon 1) Negative regulation

Regulation mechanism of trp operon 2) Attenuation ( 전사감쇠, 전사약화 ) Attenuation ( 전사감쇠 ) 기작은억제자에의한조절기작에더불어추가적인조절단계를제공 감쇠부위는전사시작부위로부터 162 뉴클레오타이드아래방향에위치 전사된 mrna의앞쪽부분

7 Regulation mechanism of trp operon 2) Attenuation ( 전사감쇠, 전사약화 ) Attenuation ( 전사감쇠 ) 기작은억제자에의한조절기작에더불어추가적인조절단계를제공 감쇠부위는전사시작부위로부터 162 뉴클레오타이드아래방향에위치 전사된 mrna의앞쪽부분 (tryptophan leader) 은 4 개의부분으로구성되어있음 (1, 2, 3, 4) 1번과 2번, 2번과 3번, 3번과 4번은역반복서열을가지고있어염기쌍을형성할수있음 3번과 4번은전사종결신호구조를타나탬 1번서열에는 tryptophan을암호화하는서열이있음 (tryptophan codon)

8 Regulation mechanism of trp operon 2) Attenuation( 전사약화 ) Trp operon 첫번째유전자는선도 peptide 를암호 화하고있는 trpl 서열 중요한 2 개의 tryptophan 잔기가위치 tryptophan 이부착되어있는 trna 의농도에의해결정 ( 전사약화 / 전사지속 ) Typtophan 이충분하다면 140 nucleotide 가전사된후전사가조기종결 리보소옴이 1 번에 tryptophan 을암호화하는서열을번역 (Prokaryotic cell 에 서는전사와번역이동시에일어남 ) 이순간에도전사는계속됨. RNA polymerase 가 4 번전사를완료할때쯤리 보소옴은 1, 2 번부근에있게됨 리보소옴이 mrna 의 UGA 정지코돈위에서정지하면 1,2 정지구조의형성 2,3 종결방지인자형성의방해 3,4 종결자형성 ribosome 은계속 leader 에붙어서쭉번역하다가이제 Trp 이많은걸인지하고서열 1 번의끝에 UGA 발견하고 번역종결 그와동시에 ribosome 은서열 2 번을가리게 되어서열 3 번과 4 번이서로 stem loop 형성 이것이 rho-independent 신호로작용해전사가멈춤

Regulation mechanism of trp operon 2) Attenuation( 전사약화 ) Trp operon 첫번째유전자는선도 peptide 를암호화 하고있는 trpl 서열 중요한 2 개의 tryptophan 잔 기가위치 Typtophan 이불충분하다면 trp-trna 도부족하여 mrna 상에있는 1 번 서열의 tryptophan

9 Regulation mechanism of trp operon 2) Attenuation( 전사약화 ) Trp operon 첫번째유전자는선도 peptide 를암호화 하고있는 trpl 서열 중요한 2 개의 tryptophan 잔 기가위치 Typtophan 이불충분하다면 trp-trna 도부족하여 mrna 상에있는 1 번 서열의 tryptophan 코돈위에서리보소옴이멈추고번역도멈춤 RNA pol 이 DNA 를전사하면서그와동시에 mrna 가나오면 ribosome 이 leader 에붙어서번역함 ribosome 은 leader 서열 1 번에있는 UGGUGG (Trp-Trp) 이걸번역해야되 니까 aminoacyl trna 가오기를기다려야함 전사는계속됨 먼저전사된 2 번과 3 번이 stem loop 를형성함 1,2 정지구조를형성하지않고 2,3 종결방 지인자형성 3,4 종결자형성되지않으므로 전사지속 전사된 mrna 의구조유전자부분의리보소 옴결합자리에리보소옴이새로결합하여번역 을진행

11 RNA polymerase 제거된 σ subunit 은재사용된다 (σ cycle) hn RNA 는 mrna 의전구체이며 snrna 는 mrna 의성숙에관여 σ subunit를제외한핵심효소는실제로 RNA를합성하는효소 β-소단위체는 posphodiester bond에관여, β와 β' 소단위체는 DNA와의결합에관여 α 는핵심효소 (core enzyme) 의형성에관여 RNA polymerase는 3가지종류 (1개리보소옴에서작용, 2개는핵내에서작용 ) 세효소는이온의세기나 2가금속이온에대해서로다른반응을보임 RNA polymerase I : 약한이온세기, Mn 2+ 보다 Mg 2+ 이온에서활성인대부분의 rrna 유전자 ( 대부분 G+C content가높다 ) RNA polymerase II : 강한이온세기, Mg 2+ 이온보다 Mn 2+ 에서더촉진핵질이질성핵 RNA(heterogenous nuclear RNA; hnrna) 작은핵 RNA (small nuclear RNA) RNA polymerase III : 광범위한이온세기에서활성, Mn 2+ 에서활성핵질다양한세포내 RNA 합성과바이러스 RNA 합성에관여함 (tran, 5sRNA, RNA splicing에관여하는 U6 snrna, 분비성단백질의신호 peptide와관련된 7SL RNA, 기능이알려지지않은 7SK RNA, VA(virus associated RNA), EBER2RNA

12 The Three RNA polymerase in Eukaryotic cells Type of Polymerase Genes Transcribed RNA polymerase I Most rrna genes RNA polymerase II RNA polymerase III All protein-coding genes, plus some genes for small RNAs (e.g., those in spliceosomes) trna genes 5s rrna gene Genes for some small structural RNAs sirna (mirna)

13 Eukaryotic transcription TBP (TATA box binding protein) : subunit of TFIID Transcription factor? : enhancer, operator

TBP 에결합하여프로모터와 TFIID 와의결합을안정화 Promoter의 TATA box에 TFIID<TBP포함 > 가결합 TFIIA<TAFII> 와 TFIIB가결합 RNA polymerase와 TFIIF결합 TFIIH< 인산화 > 와 TFIIE <helicase활성 > 가결합하여전복합체 (preinitiation complex) 형성 Pol

14 TBP 에결합하여프로모터와 TFIID 와의결합을안정화 Promoter의 TATA box에 TFIID<TBP포함 > 가결합 TFIIA<TAFII> 와 TFIIB가결합 RNA polymerase와 TFIIF결합 TFIIH< 인산화 > 와 TFIIE <helicase활성 > 가결합하여전복합체 (preinitiation complex) 형성 Pol II 의 C말단인산화 개방형복합체 Pol II와 TFIIF가 promoter를떠나면서전사개시 TFIIF와결합하여 RNA polymerase를전사개시부위치에존재하도록함 상단부 : TBP-TATA 상자결합을안정화 Pol II 의 C 말 단인산화 Pol II에강하게결합하여비특이적결합을억제 TFIIF는 PolII, TBP, TFIIB, TAFII와상호작용

15 Transcription factor(ii) 진핵생물 RNA 중합효소는보편전사인자 (general transcription factor) 라고불리는여러단백질의도움을필요로함 중합효소와보편전사인자가프로모터에결합하여야만전사가개시 Transcription factor는 RNA polymerase와프로모터부위에서결합하여개시전복합체 (preinitiation compex) 를형성 II 급보편전사인자 : TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH Trascription factor 의역할 1 프로모터와 RNA polymerase의결합을유도한다. 2 DNA의이중나선을풀어서전사개시를도와준다. 3 전사개시후프로모터로부터 RNA polymerase를분리시키는역할을한다. TFIID : TBP(TATA binding protein)+tafii (TBP associated factor) 로구성, TATA box와결합 TBP(TATA binding protein) 는 3가지 RNA 중합효소에서공통적, TAF 는특이성나타냄

Transcription factor(ii) TBP(TATA binding protein) 은 TATA 에작은홈에결합 DNA를휘게만듬 TBP는안장구조를가지고있어 DNA 배열상에결합하고작은홈이약간열리게하여두개의 phenylalanine(phe) 이끼어들어가열림 TAF는 TBP에결합하여프로모터와 TFIID와의결합을안정화시킴 (TFIIA=TAFII)

16 Transcription factor(ii) TBP(TATA binding protein) 은 TATA 에작은홈에결합 DNA를휘게만듬 TBP는안장구조를가지고있어 DNA 배열상에결합하고작은홈이약간열리게하여두개의 phenylalanine(phe) 이끼어들어가열림 TAF는 TBP에결합하여프로모터와 TFIID와의결합을안정화시킴 (TFIIA=TAFII) TFIIB는상단부와말단부구조로나뉘어있음 하단부 (downstream) : 다른전사인자 TFIIF와결합하여 RNA polymerase 를전사개시부위치에존재하도록함 상단부 : TBP-TATA 상자결합을안정화 TFIIB는 σ subunit 와유사한역할을수행 (DNA와의비특이적결합을막고정확히 TATA box를찾는다 ) TFIIF : Pol II에강하게결합하여비특이적결합을억제 TFIIF는 PolII, TBP, TFIIB, TAFII와상호작용 TFIIE : 프로모터로부터전사를활성 (III급 : TFIIIC) (helicase 활성을갖음 ) TFIIH :RNA polymerase의인산화, 인산화활성을갖는다 ( 다른것은 X), ATP를필요로함

17 Transcription factor(ii) TBP+TATA (TFIIA=TAFII) TBP(TATA binding protein) TFIIA - TBP - TATA Box Complex (TFIIB) TFIIB-TFIIA - TBP - TATA Box Complex

19 Eukaryotic transcription ( 진핵세포의전사 )

Eukaryotic mrna 의특징 1. Monocistronic ( polycistronic) 2.

20 Eukaryotic mrna 의특징 1. Monocistronic ( polycistronic) Cap 3. Poly(A) tail 4. 5, 3 UTR ( Leader, attenuator, spacer)

21 Capping 만들어진 mrna에개시코돈과서열중 Met 코드화하고있는 codon 의구별은? Eukaryotic cell은 mrna 5 - 말단에 cap 이라고하는메틸화된 nucleotide를가지고있음 (capping)

22 Capping (A) Nucleotide 인산가수분해효소 (RNA triphosphatase) 는 RNAdml 5 말단의 3개의인산기중 γ-인산기를제거 2개 (α-, β-) 만을남긴다 (B) Guanylyltransferase 는 GTPfh 부터나온 GMP를 RNA 말단의 2 인산기에붙여서 3인산기결합을형성 (C) 메틸전달효소가 S-아데노실메티오닌 (AdoMet) 의메틸기를캡형성구이닌의일곱번째탄소에전달 (D) 또다른메틸전달효소는다른 AdoMet 분자의메틸기를이용해인접한두번째 nucleotide이 2 -OH기를메틸화시킨다

23 Capping Cap은모두 3가지형태를가지고있음 Cap 0 : 2 -O 메틸화된 nucleotide가없다 < 일부바이러스 RNA> Cap 1 : 2 -O 메틸화된 nucleotide가 1개 < 세포및바이러스 RNA> Cap 2 : 1개이외에또다른 2 -O 메틸화된 nucleotide가존재함 < 진핵세포에서만발견 > Capping은언제일어나는가???? AdoMet이없으면완전히전사가억제? 전사후과정? mrna전구체가약 30개 nucleotide 가되기전에부터발생함

24 Cap의 기능 1. mrna가 분해되는 것을 방지함 2. 핵에서 세포질로 mrna가 이동되 1. mrna가 분해되는 것을 방지함 : RNA를 분해하는 핵산가수분해효소의 공격으로 는 것을 증진 3. mrna의 번역능을 증진 4. mrna가 splicing 되는 효율을 증 부터 캡이 RNA를 보호한다 3. mrna의 번역능력 증진 : 캡결합단백질이 캡과 결합하여 번역을 위해 리보 소옴으로 옮겨간다 캡이 없다면 캡결합단백질과 결합할 수 없고 번역 진 이 이루어지지 않음 2. 핵에서 세포질로 mrna가 이동하는 것을 증진 나머지 snrna는 전사한 후 capping 되고 세포질로 나가 단백질과 결합 snrnp를 형성하여 다시 핵내로 들어 4.. mrna의 spicing의 효율 증진 와 spicing에 관연 : 캡형성이 이루어지지 않은 mrna는 첫 : U6 RNA : capping 이루어지지 않고 그대로 핵내에 남아 있는다 (III) RNA polymerase III 번째 intron 부위가 제거되지 않은 상 태로 존재(다량의 2번째 intron이 제 거된 전구체 발견)

전사후과정 -Splicing 분자가나다라생물학은어렵지만마바사아재미있는자차카과목타파하이다 진핵세포는핵속에서전사가일어나며, 전사된 RNA가수정되어,

Exon( 엑손 ) - 유전자에서실제로아미노산을암호화하고있는 DNA염기서열 Splicing( 스플라이싱 )-전사에의해서인트론과엑손은같이

이과정을 RNA splicing이라한다 성숙한 mrna에는 Hybridization of DNA and RNA ( 잡종형성 )

25 전사후과정 -Splicing 분자가나다라생물학은어렵지만마바사아재미있는자차카과목타파하이다 진핵세포는핵속에서전사가일어나며, 전사된 RNA가수정되어, 그후세포질로이동한다. Intron( 인트론 ) - 진핵세포에서실제로아미노산을암호화하지않는 DNA서열이유전자내부에산재해있는데이를인트론이라한다. Exon( 엑손 ) - 유전자에서실제로아미노산을암호화하고있는 DNA염기서열 Splicing( 스플라이싱 )-전사에의해서인트론과엑손은같이 RNA로전사된다. 그러나 RNA가핵을떠나기전에인트론은제거되고, 엑손끼리연결되어연속적으로암호화된서열을갖는 mrna 분자를만든다. 이과정을 RNA splicing이라한다 성숙한 mrna에는 Hybridization of DNA and RNA ( 잡종형성 ) 을통해서확인-R-loop intron 부위가없다. (DNA에서만발견 ) DNA-RNA hybridization 형성에있어서 DNA의 intron 부위는 hybridization 되지않아고리를형성

26 전사후과정 -Splicing Intron 과 exon 이함께전사되어커다란 mrna 전구체를형성 (hnrna) 를형성하고여기서 intron 에 해당하는부위를 2 차적으로제거 hnrna는아직 mrna 보다크다, 핵내에서발견 splicing 이일어나지않았음 hnrna 와 mrna 도 R-loop 를형성할까?

27 RNA splicing mechanism

28 전사후과정 -Splicing 어디를잘라서어디에붙여야하나? 피리미딘 (U 또는 C) 핵내 mrna 전구체 (hnrna) 에있는거의모든 intron 은똑같은서열로시작하고끝난다 엑손 /GU- 인트론 -AG/ 엑손 이주위염기도 spicing 의신호가될수있음 퓨린 (A 또는 G) 5 -AG/GUAAGU- 인트론 -YNCURAC-YnNAG/G-3 9 개의연속된피리미딘 모든염기 (A, G, C, U) splicing 중간체형성에중요

snrna(small nucler RNA) 가인식한다 snrna는단백질과결합하여 snrnp(small ribonuclear protein, 스누프 ) 라는복합체형성

29 전사후과정 -Splicing p391 splicing 중간체 핵내를떠다니는것이아니라스플 라이세오솜 (spliceosome) 이라고하는 40S 입자에결합하여있음 5 -AG/GUAAGU- 인트론 -YNCURAC-YnNAG/G-3 splicing 공통서열을무엇이인식하는가? snrna(small nucler RNA) 가인식한다 snrna는단백질과결합하여 snrnp(small ribonuclear protein, 스누프 ) 라는복합체형성 U1,U2,U4,U5,U6으로분류 Spliceosome 의일부이다 snrna(small nucler RNA) 가인식한다 snrna는단백질과결합하여 snrnp(small ribonuclear protein, 스누프 ) 라는복합체형성 U1,U2,U4,U5,U6으로분류

30 전사후과정 -Splicing U1: 인트론의 5 말단과상보적서열 핵내를떠다니는것이아니라스플라이세오솜 (spliceosome) 이라고하는 40S 입자에결합하여있음 U2: 인트론의 5 말단과상보적서열 U6, U4 와염기쌍이룸 (U6 보다 U4 가먼저 ) U5: 상보적염기서열관찰되지않음, 2 번째 transesterification 을위해 exon 을 위치시키는역할 U4:U6 가 U2 와결합하여 splicing 에참여하기까지 U2 와의격리작 용 Spliceosome 의일부이다 U6:U6 는 U2 와결합하여 splicing 이활성화 될수있도록 spliceosome 활성부위형성

31 Alternative splicing? One gene One mrna?

32 전사후과정 Poly(A) 형성 절단신호 mrna, hnrna는모두폴리 (A) 를가지고있음 AMP의긴사살이 3 말단에존재 <rrna, trna는없다 > RNA 에폴리 (A) 를첨가하는반응을폴리 (A) 형성 (polyadenylation) 기능 : mrna를보호하고번역을증진시킴 전사가완성되기전에폴리 (A) 의형성은 mrna의전구체를절단시키고그다음에새로운 3 말단에폴리 (A) 를덧붙임 폴리 (A) 형성신호 : 폴리 (A) 형성부위에 20-30bp 앞에 AAUAAA 공통서열이존재 폴리 (A) 형성부위에 15bp 뒤에 GU or U의풍부서열 이존재 전사중간에 mrna를절단과 poly(a) 형성에는몇가지단백질이필요 1. 절단과폴리 (A) 형성특이인자 <cleavage and polyadenylation specificity factor; CPSF) AAUAAA 신호에결합 2. 절단촉진인자 (cleavage stimulation factor; CstF) GU or U의풍부서열 신호에결합 ===== CPSF와 CstF는폴리 (A) 형성부위의인접한곳에결합 두개가단독으로있으면불안정, 서로협동하여안정적구조를가지고있음 ======= 3. 절단에필요한한쌍의 RNA결합단백질 (CFI, CFII)

33 전사후과정 Poly(A) 형성

34 전사후과정 Poly(A) 형성 AAUAAA motif 의하단이절단되면 poly(a) tail 이형성 될준비완료 폴리 (A) 형성 : 2 단계로진행되어짐 1단계, 폴리 (A) 형성개시 최소한 10개의 A가천천히붙는다, (slow polyadenylation AAUAAA 신호필요 ) ATP의계속적인결합 (ATP AMP + Ppi) 2단계, 폴리 (A) 신장 PAB II <poly(a) binding protein II> 가결합 PAP <poly (A) polymerase> : 한번에한개의 AMP를첨가하는폴리 (A) 중합효소 200개또는그이상의 A가빠르게첨가된다

35 세포질에서의 Poly(A) 형성 Poly (A) 의길이는세포질에서길이가단축됨 ( 핵220 20/ 세포질 nt) Ticketting : mrna가번역될때마다길이가줄어든다????/ 번역이일어나든일어나지않든줄어든다 그러면???? 짧아지는것뿐만아니라새롭게합성되기도한다 교체 (turn over) 그러나합성, 분해속도에의해일반적으로짧아진다 궁극적으로 mrna는대부분의혹은전부폴리 (A) 를잃어버린다 mrna의종말

Genetic code RNA codon (AGU) DNA codon (TCA) Ser Coding Anti-coding 아미노산에대응하는유전암호 (genetic code) 는 3개씩의염기로구성 2개이상의암호가동일한하나의아미노산을지정하기도함 genetic code의융통성 (degenerate) 류신 (Leu), 세린 (Ser), 아르기닌 (Arg) :

36 Genetic code RNA codon (AGU) DNA codon (TCA) Ser Coding Anti-coding 아미노산에대응하는유전암호 (genetic code) 는 3개씩의염기로구성 2개이상의암호가동일한하나의아미노산을지정하기도함 genetic code의융통성 (degenerate) 류신 (Leu), 세린 (Ser), 아르기닌 (Arg) : 6개, 프롤린 (Pro), 트레오닌 (Thr), 알라닌 (Ala) : 4개아이소류신 (Ile) : 3개, 나머지는모두두개의코돈을갖는다 개시코돈과정지 ( 종결 ) 코돈 1. 개시코돈 : 아미노산결합의시작을알리는특별한코돈 : AUG ( 메티오닌 ), GUG ( 발린 ) 을암호해석개시 ( 폴리펩티드합성의시작 ) 를지정하는코돈임. 2. 종결 ( 정지 ) 코돈 ( 넌센스코돈 ) : UAA, UAG, UGA : 64개의암호 ( 코돈 ) 중 61개는아미노산을지정하지만 3개의코돈은지정할수있는아미노산이없고아미노산의결합을정지시켜폴리펩티드사슬이연장되지않고종결되도록작용하는코돈임.

37 Genetic code는 3중염기 (triplet), 겹쳐져있지않으며 (nonoverlapping), 쉼표도없고 (commaless), 중복되어있으며 (degenerate), 광범위하게통용되는 (universal) 암호안에들어있음

중복 (degenerate) : 아미노산은 1개이상의코돈을가질수있어유전암호는중복성이있지만 1개이상의아미노산을암호화하는코돈은없다 ( 암호는명확하여야함 ) 하나의아미노산에대해사용되는코돈은무작위로분포되는것이아니라공통되는염기를 1개나 2개가지고있음 여러코돈에서공통적인염기들은보통첫번째와두번째염기임

38 중복 (degenerate) : 아미노산은 1개이상의코돈을가질수있어유전암호는중복성이있지만 1개이상의아미노산을암호화하는코돈은없다 ( 암호는명확하여야함 ) 하나의아미노산에대해사용되는코돈은무작위로분포되는것이아니라공통되는염기를 1개나 2개가지고있음 여러코돈에서공통적인염기들은보통첫번째와두번째염기임 세번째염기는변화의여지가있음 wobble 염기 암호의중복 (degenerate) 은어떠한의미를가지는가? 잠재성돌연변이 (silent mutation): DNA에돌연변이가일어났지만번역된아미노산에변화가일어나지않는돌연변이 두번째염기가 U인경우가능한코돈에의해생기는아미노산은잠재성돌연변이는아닐지라도돌연변이에의해생성되어질수있는손상이크지않을것임

Chapter 26

Chapter 26 11 주 RNA 합성 11.1 DNA-dependent synthesis of RNA: Bacteria에서의 transcription l RNA polymerase (5 subunits로구성 : 2α, β, β, σ) l 효소에의한 RNA 합성의특징 - Complementary sequence to template DNA - RNA chain의합성방향 : 5