대한진단검사의학회지제 26 권제 5 호 2006 Korean J Lab Med 2006;26:374-9 원저 수혈의학 한국인에서 8 가지 ABO 대립유전자의빈도분석 송상훈 1 장호은 2 유광철 2 이현정 2 박경운 1,2 송정한 1,2 한규섭 1 서울대학교의과대학검사의

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1 대한진단검사의학회지제 26 권제 5 호 2006 Korean J Lab Med 2006;26:374-9 원저 수혈의학 한국인에서 8 가지 ABO 대립유전자의빈도분석 송상훈 1 장호은 2 유광철 2 이현정 2 박경운 1,2 송정한 1,2 한규섭 1 서울대학교의과대학검사의학교실 1, 분당서울대학교병원진단검사의학과 2 Analysis for Eight ABO Alleles in Korean Population Sang Hoon Song, M.D. 1, Ho Eun Chang, M.T. 2, Kwang Chul Ryu, M.T. 2, Hyun Jung Lee, M.T. 2, Kyoung Un Park, M.D. 1,2, Junghan Song, M.D. 1,2, and Kyou Sup Han, M.D. 1 Department of Laboratory Medicine, Seoul National University College of Medicine 1, Seoul; and Seoul National University Bundang Hospital 2, Bundang, Korea Background : ABO genotyping is a useful tool in case of ABO discrepancies and in legal medicine. Recent knowledge of various alleles in the ABO gene has led to the need of a different method that can cover numerous polymorphisms. We performed a polymerase chain reaction using sequencespecific priming (PCR-SSP) with 12 primer sets and evaluated its value in the detection of 8 ABO alleles. Methods : enomic DNA was isolated from peripheral blood of 222 unrelated Koreans. Sequencespecific primer sets for the nucleotides 261, 297, 467, 802, 803, and 1059 were selected, and 12 PCR reactions were performed for each sample. Direct sequencing was performed to evaluate the accuracy of discrimination between A 1 (Pro) and A 1 (Leu) and between O 1 and O 1v. Results : All the ABO genotype patterns were in an exact match with the ABO phenotypes. The results from sequencing and PCR-SSP were equivalent. The allele frequencies of A 1, B, O 1, and O 1v were 27.25%, 19.82%, 27.25%, and 25.68% respectively. Out of total 121 A 1 alleles, 6 (4.96%) were A 1 (Pro) alleles and 115 (95.04%) were A 1 (Leu) alleles. No A 2, O 2, or CisAB alleles were found in this study. Conclusions : The proportion of O 1v allele was similar to that of O 1 allele. This was an unexpected result. We developed a method for detecting 8 ABO alleles by PCR-SSP; the method was accurate and was able to discriminate between A 1 (Pro) and A 1 (Leu) and between O 1 and O 1v. (Korean J Lab Med 2006;26:374-9) Key Words : ABO, Polymerase chain reaction, Allele, A 1 (Leu), O 1v 서 론 ABO 혈액형은수혈의학과이식면역학에서가장중요한혈액 접 수 : 2006년 6월 1일 접수번호 : KJLM1955 수정본접수 : 2006년 8월 25일 게재승인일 : 2006년 8월 25일 교신저자 : 박경운 우 경기도성남시분당구구미동 300 분당서울대학교병원진단검사의학과 전화 : , Fax: m91w95@dreamwiz.com 형체계이다. ABO 유전자의염기서열은 1990년에처음알려졌으며 [1], 이후 150개이상의대립유전자가발견되었다. ABO 유전자에의해생성된각각의효소를통해서 ABO 혈액형이결정된다. A 대립유전자에의해생성된효소는 N-acetylgalactosamine 을 H 항원에붙여서 A 항원을만들며, B 대립유전자에의해생성된효소는갈락토오스를 H 항원에붙여서 B 항원을만든다. 한편, O 대립유전자는활성형효소를생성하지못한다. ABO 유전자는 9q34에위치하며, cdna는 7개의엑손으로구성되어있고엑손 6과엑손 7이전체염기서열의 77% 를차지한다. 374

2 8 가지 ABO 대립유전자의분석 375 A 대립유전자와 B 대립유전자는 7개의염기 (297, 526, 657, 703, 796, 803, 930) 에서차이를보인다. 이중 4개의염기 (526, 703, 796, 803) 의차이가아미노산의변화를일으켜효소의특이성과활성에영향을미친다 [1]. O 대립유전자는 261번염기의결실로인해 117개의아미노산으로이루어진비활성형효소를생성하여 A 또는 B 항원을만들지못한다 [1]. 동양인에서는아직까지발견되지않았으나서양인에서는흔히발견되는 O 2 대립유전자의경우에는다른 O 대립유전자와는달리 261번염기의결실이없는대신에다른몇몇부위의염기치환이있다 [2]. 본연구에서는 12쌍의염기서열특이시발체를이용한중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction using sequence-specific priming, PCR-SSP) 를이용하여 8가지의 ABO 대립유전자를분석할수있는방법을고안하였고보조적으로염기서열분석을시행하여그유용성을평가하고기존의결과와비교하고자하였다. 대상및방법 분당서울대학교병원에서헌혈을시행한비혈연관계에있는한국인 222명을대상으로하였다. 남자는 121명 (54.5%), 여자는 101 명 (45.5%) 이었으며연령은 37.1±15.1세 (18-79세) 였다. 본연구는분당서울대학교병원기관윤리위원회의승인을받았고모든검사대상으로부터사전동의서를받았다. 핵산추출에는 Puregene DNA isolation kit (entra Systems Inc., Minneapolis, MN, USA) 를이용하였다. Table 1. Oligonucleotide primers used in typing of 8 ABO alleles Polymorphic site Name Primer sequence (5 to 3 ) Nucleotide 261 O1-F A A AT TCC TC T TA no1-f A A AT TCC TC A T O1-R ATA TAT AT CA AAC ACA TT AAC CCA AT Nucleotide 802 O2B-F AT A CT A CAT A TT CC O2-R TC ACC CCC CA AA AC T no2-r CA CCC CCC AA AA CC Nucleotide 803 O2B-F AT A CT A CAT A TT CC B-R ATC AC CCC CC AA AC nb-r CC ACC CCC CA AA CC Nucleotide 1059 A2-F A C TC C AA C na2-f A C TC C AAC AC A2-R TT AT TT A T A C Nucleotide F CAT TT CT A CAC 297A-F CAT TT CT A CAC A 297-R CTT AT C AAA CAC AT TAA C Nucleotide F AC T CTT TCC TA AC T 467T-R C A CAC CC C C 467C-R C CAC CC C CA Internal control HH-F TC CTT TTT AAC CAT TCC CTT A HH-R CCA CTC AC AT TTC TT TT TT TC Artificially changed base pairs are expressed as underlined. 1. 혈청학적 ABO 혈액형검사혈구형검사는마우스단클론항체 (Serologicals Co., Norcross, A, USA) 를사용하여슬라이드법으로시행했고, 혈청형검사는자가제조한혈구를사용하여시험관법으로시행했다. 2. 염기서열특이시발체를이용한중합효소연쇄반응총 6개의염기 (261, 802, 803, 1059, 297, 467) 에특이적인 12 쌍의시발체를사용하여중합효소연쇄반응을시행하였다. 시발체는기존의연구에서사용한것을 [2, 3] 사용하였으며 Table 1에정리하였다. 중합효소연쇄반응은 PTC-200 (MJ Research Inc., Waltham, MA, USA) 를사용하여시행하였다. no1-f 시발체의경우 3 말단으로부터 4, 5번째위치에인위적인불일치염기를삽입하였다. 각각의중합효소연쇄반응에는내부대조 (internal control) 로서사람성장호르몬 (HH) 유전자를증폭시키기위한반응을포함하였다. 증폭반응의조건은 467번염기와관련된반응을제외하고는모두동일하였다. 총 25 L의반응액은핵산추출물 100 ng, 10 buffer 2.5 L, 2.5 mm dntp 1 L, Taq 중합효소 단위 (Takara Bio Inc., Otsu, Japan), 대립유전자검출을위한시발체각각 5 pmol, HH 시발체각각 2 pmol으로구성되었다. 95 에서 1분간처리한후에 95 1분, 66 1분, 72 1분씩 32회반응시켰고, 최종연장반응은 72 에서 5분간시행하였다. 467번염기와관련된반응은총 25 L의반응액에 HH 시발체를각각 1 pmol 혼합하였고다른조성은동일하였다. 95 에서 1분간처리한후에 95 30초, 68 30초, 72 30초씩 30회반응시켰고, 최종연장반응은 72 에서 5분간시행하였다. 3. 염기서열분석 PCR-SSP를이용한 297번염기와 467번염기에대한다형성분석의정확성을확인하기위해서염기서열분석을시행하였다. 297번염기의분석을위해서는시발체로 Itr5-F (5 -AA CT AT A TT TCC A-3 ) 및 297-R을사용하여인트론 5와엑손 6의일부를포함하는중합효소연쇄반응을시행하였다. 467번염기의분석을위해서는시발체로 467-F와 no2-r을사용하여중합효소연쇄반응을시행하였다. 각각 235 bp와 442 bp 크기의 PCR 산물을 QIAquick PCR purification kit (Qiagen, Hilden, ermany) 를이용하여정제한후 ABI 3730xl DNA analyzer (Applied Biosystems, Foster, CA, USA) 를사용하여염기서열분석을시행하였다. 4. 통계분석통계분석에는 SPSS 12.0 for Windows (SPSS Inc., Chica-

3 376 송상훈 장호은 유광철외 4 인 go, IL, USA) 를사용하였다. 본연구와다른연구에서의대립유전자빈도의차이를분석하기위해서카이제곱검정을시행하였고 P<0.05를통계적으로유의한수준으로설정하였다. 본연구에서나타난주요유전형과그빈도를 Table 3 및 Table 4 에정리하였다. 각각의대립유전자의빈도는다음과같았다 : A 1, 27.25%; B, 19.82%; O 1, 27.25%; O 1v, 25.68%. A 1 대립유전자 결 본연구에서는각각의검체에대해 12쌍의 PCR-SSP를이용하여 ABO 대립유전자를분석하였다. 본연구의결과에따라나타날수있는 8가지의 ABO 대립유전자에대해 Table 2에정리하였다. 총 222명의헌혈자를대상으로한분석에서표현형과유전형의결과는모두일치하였으며, 297번과 467번염기의염기서열분석결과는모두 PCR-SSP와동일한결과를보였다. Table 2. Possible 8 alleles matched by polymorphisms on six nucleotide positions at the ABO locus 261 Nucleotide position 과 Allele C A C A 1 (Pro) C A T A 1 (Leu) A T A 2 C C C B C A C O 1 A C C O 2 C C A T CisAB C C O 1V Abbreviation:, deletion. Table 4. ABO genotype frequencies (%) in this study and comparison with other ethnic groups enotype This study (N=222) Korean [16] (N=253) Japanese [20] (N=520) Chinese [9] (N=125) erman [21] (N=169) European [9] (N=98) A 1 (Leu)/ A 1 (Leu) A 1 (Pro)/ A 1 (Pro) A 1 (Leu)/ * 0.00 A 1 (Pro) A 1 (Leu)/O A 1 (Pro)/O A 1 (Leu)/O 1v * A 1 (Pro)/O 1v B/B * 2.04 B/O * B/O 1v * O 1 /O O 1 /O 1v O 1v /O 1v A 1 (Leu)/B A 1 (Pro)/B * Others *P<0.05 and P<0.01 as compared to this study. Others include genotypes with A 2, O 2, or other O alleles other than O 1 or O 1v. Table 3. Possible patterns detected with PCR-SSP and results of ABO genotyping in 222 Korean blood donors Nucleotide Reaction number Reaction name Positive result NonO O2 A NonO B C NonB A NonA2 C A T C enotype Phenotype Number (%) O 1 /O 1 O 20 (9.01) O 1 /O 2 O 0 (0.00) O 1 /B B 20 (9.01) /- + O 1 /A 1 A1 33 (14.86) O 1 /A 2 A2 0 (0.00) O 2 /O 2 O 0 (0.00) O 2 /B B 0 (0.00) /- + O 2 /A 1 A1 0 (0.00) O 2 /A 2 A2 0 (0.00) B/B B 8 (3.60) /- + B/A 1 A1B 27 (12.16) B/A 2 A2B 0 (0.00) /- + A 2 /A 1 A1 0 (0.00) A 2 /A 2 A2 0 (0.00) /- +/- A 1 /A 1 A1 12 (5.41) O 1v /O 1 O 28 (12.61) /- + O 1v /A 1 A1 37 (16.67) O 1v /B B 25 (11.26) O 1v /O 1v O 12 (5.41) Abbreviations: PCR-SSP, polymerase chain reaction using sequence-specific priming;, deletion.

4 8 가지 ABO 대립유전자의분석 377 의 467C/T (Pro/Leu) 비율은 6:115이었으며, A 2, O 2 및 CisAB 대립유전자는이번연구에서발견되지않았다. 가장흔하게관찰된유전형은 A 1 (Leu)/O 1v (15.32%) 와 A l (Leu)/O l (14.41%) 이었다 (Table 4). 고찰 ABO 유전자의 cdna 염기서열이밝혀진이후 [1], ABO 유전형의분석에는다양한분자유전학적방법이사용되어왔다. 초기에는소수의다형성부위를대상으로하여중합효소연쇄반응- 제한절편길이다형성 (PCR-RFLP) 이많이사용되었다 [4, 5]. 국내에서도 261번과 803번염기를대상으로 PCR-RFLP를시행하여 ABO 유전형을분석한연구 [6] 및 261, 526, 803번염기를대상으로한연구가있었다 [7]. 또한혈청학적검사에서 ABO 불일치를보인증례를대상으로하여 261번및 703번염기의다형성을조사한보고가있었다 [8]. 외국에서는최근에다양한방법들이시도되고있고, 새로운 ABO 대립유전자가계속해서발견되고있다 [9-14]. 50개의다형성부위를대상으로하여총 102쌍의시발체를이용한 PCR-SSP를시행하여유전형을분석하고새로운대립유전자를발견한보고도있다 [3]. 본연구에서는 6개의다형성부위를대상으로한 PCR-SSP를시행하였고, 이를통해 8가지의 ABO 대립유전자를구별할수있었다. A 1, A 2, B, O 1 대립유전자이외에 A 1 (Leu), A 1 (Pro) 대립유전자를구별할수있었고 O 1v 대립유전자를추가로확인할수있었다. 297번과 467번염기의경우모든검체를대상으로시행하지는않았지만염기서열분석결과와일치하여정확하게 ABO 유전자형을분석할수있는방법임을확인할수있었다. 기존에국내에서사용된방법들에비해분석가능한대립유전자의종류가많아졌고제한효소를사용함으로써발생할수있는오류를 [15] 방지할수있다. 염기서열분석방법은다양한부위의다형성을확인할수있는장점이있으나고가의장비가필요하고지나치게많은정보를제공하기때문에정규검사로사용하기는힘들다고생각된다. A 1, B, O 대립유전자의빈도는각각 0.273, 0.198, 0.529이었다. 과거에보고된 0.231, 0.209, 0.560에비해 A 1 대립유전자의빈도가약간높고B 대립유전자및 O 대립유전자의빈도는약간낮았으나통계적으로유의하지는않았다. A 1 (Pro) 와 A 1 (Leu) 의비 율의경우, 총 121개의 A 1 대립유전자중 6개는 A 1 (Pro), 115개는 A 1 (Leu) 로나타났는데이전에 9:91로보고된 [16] 것에비해 A 1 (Leu) 의비율이높았으나통계적으로유의하지는않았다 (P= 0.183). 이전의연구 [16] 와본연구모두에서대상검체수가충분하지않아 A 1 (Pro) 대립유전자의숫자가적절히반영되지않았을가능성이있으며, 향후에충분한검체를대상으로한연구를통해한국인에서의 A 1 (Pro) 와 A 1 (Leu) 대립유전자의비율을확인할필요가있다고생각된다. 일반적으로동양인에서는 A 1 (Leu) 이, 서양인에서는 A 1 (Pro) 가더흔하게관찰되는것으로보고되고있다 (Table 5). B 대립유전자의빈도는동양인에서 로나타나서양인의 보다흔한것으로보고되었는데이는본연구의결과와유사하다. 서양인에서드물지않게관찰되는 O 2 또는 A 2 대립유전자는본연구에서는관찰되지않았으며이는과거동양인을대상으로한연구결과들과유사한결과이다. O 1 와 O 1v 대립유전자의비율은 52.2:47.8% 로나타나예상보다 O 1v 의 비율이높았다. 이는이전에한국인을대상으로한연구 [16] 에서전체 O 대립유전자중 O 1v 대립유전자가 36% 로나타난것에비하면높은결과이며, 오히려일본인을대상으로한연구의결과와유사하다 (Table 5). O 1v 대립유전자는특히미국인디언에서전체 O 대립유전자의 90% 이상을차지할정도로높은비율로존재하는것으로알려져있고 [17] 동양인에서서양인보다약간높은비율로관찰되었다 [18]. O 1v 대립유전자는 261번염기의결실이있는것은O 1 대립유전자와같지만 297A> 변이가추가로있는점이다르다 [19]. 그러나 646, 681, 771, 829번염기의치환이추가로존재하는경우가대부분이기때문에 [19] 본연구에서검출된높은비율의 O 1v 는이러한다양한아형들의합으로받아들여야하며, 전반적인염기서열분석을통해여러다형성부위의변이를확인해야할것이다. 또한본연구에서는 O 1v 대립유전자를확인하기위해 297번염기를대상으로했지만이전의국내연구와 [16] 일부외국의연구 [20, 21] 에서는 646번염기를대상으로하기도하였는데, 서로다른부위의변이를가진형이일부존재하지만매우드문것으로알려져있기때문에전체적인결과에는큰차이가없을것으로생각된다. 이번연구에서 A 2 대립유전자와 O 2 대립유전자는발견되지않았다. A 2 대립유전자는서양인에서는드물지않으나동양인에서는매우드물게발견되며 [9], A 2 또는 A 2 B 표현형을나타내는경우의일부에서발견되는것으로알려져있다 [22]. O 2 대립유전자는아직까지동양인에서는발견된적이없으 Table 5. ABO allele frequencies in various populations Population A 1 (Leu) A 1 (Pro) B O 1 O 1v O 2 A 2 Others This study Korean[16] * Not tested - Japanese[20] Not tested - Chinese[9] 0.180* erman[21] Not tested - European[9] * * *P<0.05 and P<0.01 as compared to this study. Others are rare A or O alleles with unexpected base change or deletion not defined in our method.

5 378 송상훈 장호은 유광철외 4 인 나다른대부분의 O 대립유전자와는달리 261번염기의결실이없어서잘못된유전형으로분류될수있으므로, ABO 유전형분석을할때는이번연구처럼 802번염기의분석을포함시키는것이바람직하다고생각된다. 과거에는엑손 6과엑손 7의다형성부위가주된연구대상이었지만, 최근에는엑손 1-5 부위와인트론등의부위로분석범위가확대되면서 [23-25] 이들부위의다형성까지반영한새로운대립유전자들이발견되고있다. 이러한여러유전자다형성의발생기전으로는점돌연변이를비롯하여상호전위 (reciprocal translocation) 나유전자변환 (gene conversion) 등의기전도동시에작용할것으로생각하고있다 [26]. 본연구에서시행한 6개의염기에대한 12쌍의 PCR-SSP를통한 ABO 유전형분석의결과는 ABO 표현형과모두일치하였으며, A 1 (Pro) 와 A 1 (Leu) 대립유전자및 O 1 과 O 1v 대립유전자를명확히구별할수있었다. 요약배경 : ABO 유전형분석은 ABO 불일치가있는경우와법의학에서유용한수단이다. 최근에다양한 ABO 대립유전자가존재한다는사실이알려지면서다수의다형성을분석할수있는방법이필요하게되었다. 저자들은 12쌍의염기서열특이시발체를이용한중합효소연쇄반응 (PCR-SSP) 을도입하여 8개의 ABO 대립유전자를검출하고자하였다. 방법 : 비혈연관계에있는 222명의한국인의말초혈액에서핵산을추출하였다. 261, 297, 467, 802, 803, 1059번염기에대한 PCR-SSP를이용하여각검체마다 12가지의중합효소연쇄반응을실시했다. A 1 (Pro) 와 A 1 (Leu) 및 O 1 과 O 1v 대립유전자가정확하게구별되는지평가하기위해직접염기서열분석을시행했다. 결과 : 모든 ABO 유전형이 ABO 표현형과일치했으며, 염기서열분석결과는 PCR-SSP 결과와일치했다. A 1, B, O, O 1v 대립유전자의빈도는각각 27.25%, 19.82%, 27.25%, 25.68% 이었다. 총 121개의 A 1 대립유전자중 A 1 (Pro) 는 6개 (4.96%), A 1 (Leu) 는 115개 (95.04%) 였다. A 2, O 2, CisAB 대립유전자는본연구에서발견되지않았다. 결론 : O 1v 대립유전자의비율은 O 1 대립유전자의비율과비슷했으며이는예상하지못한결과였다. 저자들은 PCR-SSP를이용하여 8 ABO 대립유전자의분석을시행하였는데, 이방법은정확하였으며 A 1 (Pro) 와 A 1 (Leu) 및 O 1 과 O 1v 대립유전자를명확히구별할수있었다. 참고문헌 1. Yamamoto F, Clausen H, White T, Marken J, Hakomori S. Molecular genetic basis of the histo-blood group ABO system. Nature 1990; 345: assner C, Schmarda A, Nussbaumer W, Schonitzer D. ABO glycosyltransferase genotyping by polymerase chain reaction using sequence-specific primers. Blood 1996;88: Seltsam A, Hallensleben M, Kollmann A, Burkhart J, Blasczyk R. Systematic analysis of the ABO gene diversity within exons 6 and 7 by PCR screening reveals new ABO alleles. Transfusion 2003;43: Lee JC and Chang J. ABO genotyping by polymerase chain reaction. J Forensic Sci 1992;37: Fukumori Y, Ohnoki S, Shibata H, Yamaguchi H, Nishimukai H. enotyping of ABO blood groups by PCR and RFLP analysis of 5 nucleotide positions. Int J Legal Med 1995;107: Oh HB, Cho YJ, Cho YH, Hwang YS, Kim DS, Kim SI. enotyping of ABO and D antigens. Korean J Blood Transfus 1997;8:31-7. ( 오흥범, 조연정, 조영희, 황유성, 김두성, 김상인. ABO 및 D 항원의유전자형분석. 대한수혈학회지 1997;8:31-7.) 7. Kang SH, Shin DH, Cho HC, Lee KM, Han KS. Simple ABO genotyping method using three polymorphic sites at the ABO locus. Korean J Blood Transfus 1998;9: ( 강성하, 신동훈, 조현찬, 이규만, 한규섭. 3개의다형성부위를이용한간편한 ABO 유전자형검사법. 대한수혈학회지 1998;9: ) 8. Kim MJ, Shin JW, Kim YH, Kim HO, Cho SR, Kim WJ. Application of ABO genotyping in determination of ABO subgroups. Korean J Blood Transfus 1998;9: ( 김문정, 신정원, 김영환, 김현옥, 조성란, 김휘준. ABO 아형에서 ABO 유전자형검사의적용. 대한수혈학회지 1998;9: ) 9. Yip SP. Single-tube multiplex PCR-SSCP analysis distinguishes 7 common ABO alleles and readily identifies new alleles. Blood 2000; 95: Olsson ML, Irshaid NM, Hosseini-Maaf B, Hellberg A, Moulds MK, Sareneva H, et al. enomic analysis of clinical samples with serologic ABO blood grouping discrepancies: identification of 15 novel A and B subgroup alleles. Blood 2001;98: Ferri, Bini C, Ceccardi S, Pelotti S. ABO genotyping by minisequencing analysis. Transfusion 2004;44: Doi Y, Yamamoto Y, Inagaki S, Shigeta Y, Miyaishi S, Ishizu H. A new method for ABO genotyping using a multiplex single-base primer extension reaction and its application to forensic casework samples. Leg Med (Tokyo) 2004;6: Ferri, Bini C, Ceccardi S, Ingravallo F, Lugaresi F, Pelotti S. Minisequencing-based genotyping of duffy and ABO blood groups for forensic purposes. J Forensic Sci 2006;51: Seo DH, Kim SY, Kin JY, Park SS, Lee JB, Han KS. Molecular characteristics of B subgroups in Koreans. Korean J Lab Med 2005;25:

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