Technical/Specs Sequencing 서비스안내 Standard Sequencing Plasmid/PCR product 를 primer 를이용하여고객이원하는 region 을분석하는서비스이며, 대부분의 normal 샘플에대해 최적화되어있습니다. Full Len

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성원 한
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1 Technical/Specs Sequencing 서비스안내 Standard Sequencing Plasmid/PCR product 를 primer 를이용하여고객이원하는 region 을분석하는서비스이며, 대부분의 normal 샘플에대해 최적화되어있습니다. Full Length Sequencing (Primer walking) 길이가긴 insert 를포함한 plasmid 혹은 PCR product 를 primer walking 으로분석하는서비스입니다. 3kb 기준으로약 1 주일소요되며, size 에따라추가기간이요구됩니다. 서비스완료후 Data 는각 single data 및 assemble 후 contig file 형식으로제공되며 Primer 는 design 된 primer 정보와함께 dry 된상태로발송됩니다. Difficult Sequencing GC/AT rich, repeat sequence, secondary structure 등의 standard sequencing 으로는분석이어려운 structure 를가지고있는 template 를대상으로하는서비스입니다. Difficult sequencing process 는바이오니아만의노하우로최적화되어있으며, standard sequencing 과는다른분석조건및시약이사용됩니다. End Sequencing BAC, Fosmid, Cosmid DNA 등 large construct 를대상으로한서비스입니다. Ready-to-load (without editing) DNA Analyzer (ABI3730xl) Running 이전단계까지준비된샘플을대상으로한서비스입니다. (dry 혹은 Hi-Di 에 dilution 된상태로접수가능, 단 BigDye v3.1 만가능 ) Custom DNA Sequencing PCR product 의 direct sequencing 시 high quality data 를얻기위해서는 PCR optimization 이수행되어야합니다. 이에당사에서는다량의샘플에대해최상의맞춤서비스를제공하며, genomic DNA 와세부의뢰정보를보내주시면 primer design 을포함하여 PCR 조건최적화및 Sequencing 까지일련의과정을서비스합니다. 부가서비스안내 의뢰샘플의종류에따라선택적으로부가서비스를이용하실수있습니다. * 모든 material 은당사제품으로서비스됩니다. 1) Colony/ Cell stock Cell stock Plasmid DNA Extraction Plasmid DNA 2) genomic DNA PCR Non-purified PCR product PCR purification/agarose gel extraction purified PCR product 3) genomic DNA Primer design PCR optimization PCR Non-purified PCR product PCR purification/ Agarose gel extraction purified PCR product: Custom Sequencing

2 Plasmid DNA Extraction 액체배지에배양된 cell 을보내주시면 plasmid DNA extraction 을수행합니다. Agar plate 혹은 Cell stock 형태로의주문도 가능하며, 별도의배양비용이추가됩니다. Purification PCR product 의 direct sequencing 시에는반드시 product 내불순물을제거하기위한 purification 과정이선행되어야하며, high quality data 를얻기위해서는 non-specific band 를제거하는것이중요합니다. - PCR purification: 일반적으로 spin column 을이용한정제방법으로서 non-specific band 가존재하지않을경우적합하며, 당사제품인 PCR Purification Kit (AccuPrep PCR Purification Kit) 을사용합니다. - Agarose gel extraction: Agarose gel 에서원하는 band 만분리하여추출하는방법으로서 PCR product 내 non-specific band 가존재할경우적합하며, 당사제품인 PCR Purification Kit (AccuPrep Gel Purification Kit) 을사용합니다. PCR & Purification Optimization 된 PCR 조건, product size 등의정보와함께 genomic DNA 및 specific primer 를보내주시면 PCR 후 size 확인과 purification 을수행하며, 당사 primer synthesis service 도이용가능합니다. 본서비스과정에는당사제품인 high fidelity PCR premix (AccuPower ProFi Taq PCR PreMix) 및 PCR Purification Kit 를사용합니다. Sample 및 Primer 준비조건안내 Sample 준비 Type Concentration Volume/rxn Purity Plasmid DNA 100 ng/µl 10 µl PCR product 50 ng/µl 10 µl Non-purified PCR product 50 ng/µl 20 µl A260/A280: ~1.8 A260/A230: Genomic DNA 30 ng/µl 30 µl * 1rxn 기준이며, 샘플은 1.5ml tube 혹은 plate 로준비해주시고, 재분석에필요한샘플양을감안하여충분한양을보내주시기바랍니다. Primer 준비 Type Concentration Volume/rxn 세부안내 Universal primer 무상제공 - 당사보유 universal primer 를사용하실경우 name 만기재해주시면됩니다. Specific primer 5 pmol/µl (5 µm) 5 µl Sequencing primer 적정조건 : 18~22 mer, TM 50~56 C Ordered primer 당사홈페이지온라인주문을하시면생산된 oligo 의일부는바로 sequencing 에사용됩니다. Sequencing service 주문시 Oligo 와동시에주문이가능합니다.

Working Day: 접수시간기준 24 시간이내완료 접수시간 Data 전송 10:00 AM 당일 19:00 PM 18:00 PM 익일 09:00 AM 2. 서비스접수후접수내역을 SMS 로안내드립니다. 3.

3 샘플형태에따른준비사항 - Single tube 형태 1.5 ml micro centrifuge tube 로준비하실경우상단에기재된샘플이름과 order sheet 에기재하신샘플이름을동일시하여주시기바랍니다. - Plate 형태 V-type bottom 의 96well plate 에각 well 순서에맞도록넣어주시고, cross-contamination 이되지않도록 cap 을 이용하여 sealing 을하시길권장합니다. 서비스진행과정안내 1. Working Day: 접수시간기준 24 시간이내완료 접수시간 Data 전송 10:00 AM 당일 19:00 PM 18:00 PM 익일 09:00 AM 2. 서비스접수후접수내역을 SMS 로안내드립니다. 3. 서비스완료후 Data 는 4 가지 file (ab1, text, PDF, full text) 과 report 가함께제공됩니다. 4. Sample 및 primer 는 1 개월후폐기되며, 장기보관이필요하신경우별도로요청하셔야합니다. * 장기보관에따른 degradation 으로인한문제는책임지지않으므로, primer 를장기보관하실경우에는 1 개월을주기로교체하시길권장합니다.

4 상담안내 1. 아래의연락처또는 로문의주시면신속히답변해드립니다. - Tel: 또는 /3 - sequencing@bioneer.co.kr 2. 상담시간 : 평일오전 09:00 ~ 오후 6:00 ( 주말, 휴일휴무 ) BIONEER 보유 universal primer list Primer name Sequence(5' --> 3') Length [bases] T7promoter TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG 20 T7terminator GCT AGT TAT TGC TCA GCG G 19 T3 AAT TAA CCC TCA CTA AAG GG 20 SP6 ATT TAG GTG ACA CTA TAG 18 EBV-R GTG GTT TGT CCA AAC TCA TC 20 BGH-rev CTA GAA GGC ACA GTC GAG GC 20 M13F(-40) GTT TTC CCA GTC ACG AC 17 M13R(-40) CAG GAA ACA GCT ATG AC 17 M13F(-20) GTA AAA CGA CGG CCA GT 17 M13R(-20) GCG GAT AAC AAT TTC ACA CAG G 22 pgex5 GGC AAG CCA CGT TTG GTG 18 pgex3 GAG CTG CAT GTG TCA GAG G 19 pqe-forward CCC GAA AAG TGC CAC CTG 18 pqe-reverse GTT CTG AGG TCA TTA CTG G 19 EGFP-C CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G 22 EGFP-N CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G 22 RVprimer3 CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC 20 RVprimer4 GAC GAT AGT CAT GCC CCG CG 20 GLprimer1 TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TG 23 GLprimer2 CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CA 23 CMV-F CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTG 21 CMV30 AAT GTC GTA ATA ACC CCG CCC CGT TGA CGC 30 CMV24 TAT TAG GAC AAG GCT GGT GGG CAC 24 Gal4AD TAC CAC TAC AAT GGA TG 17 Gal4BD-F TCA TCG GAA GAG AGT AG 17 Gal4BD-R TTT CTT TGG AGC ACT TGA GC 20

5 MATCHMAKER3 GTG AAC TTG CGG GGT TTT TCA GTA TCT ACG AT 32 pbad-for ATG CCA TAG CAT TTT TAT CC 20 pbad-rev GAT TTA ATC TGT ATC AGG 18 SV40-pArev CCT CTA CAA ATG TGG TAT GG 20 SV40-pAF AAA TAA AGC AAT AGC ATC AC 20 malef GGT CGT CAG ACT GTC GAT GAA GCC 24 pcold-f ACG CCA TAT CGC CGA AAG G 19 pcold-r TCC CCG CCA AAT GGC AGG GA 20 3AOX GCA AAT GGC ATT CTG ACA TCC 21 5AOX GAC TGG TTC CAA TTG ACA AGC 21 pbabe-f TGA CCT GGG AAG CCT TGG CT 20 pbabe-r TTG CTG ACT AAT TGA GAT GCA TGC TTT 27 V5_Reverse ACC GAG GAG AGG GTT AGG GA 20 pjet1.2f CGA CTC ACT ATA GGG AGA GCG GC 23 pjet1.2r AAG AAC ATC GAT TTT CCA TGG CAG 24 27F AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG R TAC GGY TAC CTT GTT ACG ACT T F CCA GCA GCC GCG GTA ATA C R TAC CAG GGT ATC TAA TCC 18 ITS1 TCC GTA GGT GAA CCT GCG G 19 ITS2 GCT GCG TTC TTC ATC GAT GC 20 ITS3 GCA TCG ATG AAG AAC GCA GC 20 ITS4 TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC 20 ITS5 GGA AGT AAA AGT CGT AAC AAG G 22 LCO1490 GGT CAA CAA ATC ATA AAG ATA TTG G 25 HCO2198 TAA ACT TCA GGG TGA CCA AAA AAT CA 26 pet-upstream ATG CGT CCG GCG TAG A 16 pba-f ATT GTC TCA TGA GCG GAT AC 20 pbh-r GCG TTA TCC CCT GAT TCT GT 20 pbic_f CTC ATG AGC GGA TAC ATA TTT G 22 pbic_r GCC GCA GCC GAA CGA CCG AG 20

F. Sequencing FSequencing 01. Sequencing Service DNA sequencing Phone: (ext.4 4)

F. Sequencing FSequencing 01. Sequencing Service DNA sequencing Phone: (ext.4 4) FSequencing 01. DNA sequencing Phone: 1588-9788 (ext.4 4) E-mail: sequencing@bioneer.co.kr 01. 242 FAQs 247 개요 상세 설명 바이오니아는 국내 최초로 를 시작하였으며, 매년 개선된 high-throughput sequencing service를 제공하고 있습니다. Plasmid